MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021006	TCC	2	6	345080	345085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_021006	CTG	2	6	345107	345112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_021006	CTC	2	6	345157	345162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_021006	T	6	6	345181	345186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021006	CAT	2	6	345208	345213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_021006	ACG	2	6	345216	345221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_021006	TCT	2	6	345226	345231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_021006	GGT	2	6	345233	345238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021006	GAG	2	6	345331	345336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021006	GAA	2	6	345375	345380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021006	TCA	3	9	345471	345479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_021006	A	6	6	345526	345531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021006	CCT	2	6	345534	345539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_021006	TGA	2	6	345549	345554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021006	GA	3	6	345628	345633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021006	CTT	2	6	345657	345662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_021006	ACG	2	6	345685	345690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_021006	AG	3	6	345717	345722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021006	AGGG	2	8	345775	345782	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021006	GTA	2	6	345832	345837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021006	T	6	6	345846	345851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021006	GAT	2	6	346028	346033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_021006	CTT	2	6	346070	346075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021006	GAAA	2	8	346210	346217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021006	AAGC	2	8	346238	346245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_021006	CAA	2	6	346257	346262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_021006	GCG	2	6	346377	346382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_021006	A	6	6	346436	346441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021006	A	6	6	346449	346454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021006	ACC	2	6	346461	346466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_021006	TGA	2	6	346525	346530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021006	CTTT	2	8	346557	346564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_021006	T	7	7	346570	346576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021006	T	6	6	346605	346610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021006	A	6	6	346618	346623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021006	A	6	6	346637	346642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021006	CTAAG	2	10	346658	346667	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1538	NC_021006	AAT	2	6	346702	346707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021006	TA	3	6	346718	346723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021006	TAT	2	6	346735	346740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021006	GGA	2	6	346755	346760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021006	ATA	2	6	346847	346852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021006	ACC	2	6	346859	346864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_021006	ATTG	2	8	346876	346883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021006	GTA	2	6	346910	346915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021006	TAT	2	6	346963	346968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021006	TGT	2	6	347003	347008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021006	GAT	2	6	347088	347093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021006	AAC	3	9	347102	347110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_021006	TC	3	6	347121	347126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_021006	AGT	2	6	347177	347182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021006	TTC	2	6	347183	347188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_021006	GTA	2	6	347223	347228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021006	CTT	2	6	347254	347259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_021006	T	6	6	347339	347344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021006	AAC	2	6	347345	347350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_021006	TCT	2	6	347364	347369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_021006	CAT	2	6	347416	347421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_021006	TCCTG	2	10	347472	347481	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1560	NC_021006	TAG	2	6	347509	347514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021006	CTT	2	6	347530	347535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_021006	CTT	2	6	347578	347583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021006	TAC	2	6	347753	347758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021006	AAT	2	6	347783	347788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021006	TCA	2	6	347805	347810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_021006	CTT	2	6	347824	347829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_021006	ATC	2	6	347840	347845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_021006	CAG	2	6	347866	347871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_021006	TCC	2	6	347896	347901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_021006	TTA	2	6	347969	347974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021006	TA	4	8	348046	348053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021006	AT	3	6	348070	348075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021006	AATC	2	8	348108	348115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_021006	AT	3	6	348118	348123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021006	AT	3	6	348159	348164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021006	TCA	2	6	348206	348211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_021006	AATAG	2	10	348236	348245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_021006	TCA	2	6	348251	348256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_021006	A	6	6	348292	348297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_021006	AAC	2	6	348358	348363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1585	NC_021006	ATT	2	6	348556	348561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_021006	TAT	2	6	352696	352701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_021006	TAG	2	6	352782	352787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021006	GTTTA	2	10	352824	352833	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_021006	TAT	2	6	352850	352855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021006	T	6	6	352935	352940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021006	ATA	2	6	352962	352967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021006	CTA	2	6	353483	353488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_021006	AGCAT	2	10	353528	353537	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1605	NC_021006	CGG	2	6	353608	353613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_021006	AT	3	6	353638	353643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021006	TGA	2	6	353650	353655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1609	NC_021006	CCTT	2	8	353715	353722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_021006	T	6	6	353761	353766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1612	NC_021006	A	6	6	353803	353808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021006	ACT	2	6	353821	353826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_021006	TGA	2	6	353920	353925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021006	AAGAA	2	10	353996	354005	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_021006	TTC	2	6	354019	354024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_021006	ATT	2	6	354066	354071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021006	TCA	2	6	354086	354091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_021006	CAA	2	6	354128	354133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_021006	CTTA	2	8	354192	354199	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_021006	T	6	6	354215	354220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_021006	AAC	2	6	354289	354294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_021006	AT	3	6	354303	354308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021006	AT	3	6	354322	354327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021006	A	6	6	354356	354361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021006	CT	3	6	354362	354367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_021006	ACA	2	6	354368	354373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_021006	ATA	2	6	354376	354381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021006	T	6	6	354387	354392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021006	TTA	2	6	354395	354400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021006	T	7	7	354402	354408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021006	CTT	2	6	354428	354433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_021006	A	6	6	354481	354486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021006	A	6	6	354488	354493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021006	T	6	6	354574	354579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_021006	TGA	2	6	354641	354646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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