MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021006	TAA	2	6	235388	235393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021006	T	6	6	235414	235419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021006	CTA	2	6	235439	235444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_021006	AGA	2	6	235449	235454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021006	AGA	2	6	235497	235502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021006	TAG	2	6	236633	236638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021006	ATA	2	6	236679	236684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021006	TC	3	6	236709	236714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_021006	AGCTG	2	10	236789	236798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_021006	ATC	3	9	236822	236830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021006	TAA	2	6	236850	236855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021006	ATTTT	2	10	236858	236867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021006	TTCT	2	8	236888	236895	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_021006	GAA	2	6	236923	236928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021006	ATCA	2	8	236991	236998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_021006	GCT	2	6	237064	237069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021006	AATT	2	8	237084	237091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021006	GTT	2	6	237108	237113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021006	TAT	2	6	237303	237308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021006	A	6	6	237312	237317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021006	CTCTA	2	10	237320	237329	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1022	NC_021006	A	6	6	237343	237348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021006	TAT	2	6	237389	237394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021006	T	6	6	237428	237433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021006	ATCT	2	8	238334	238341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_021006	A	6	6	238348	238353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021006	A	6	6	238356	238361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021006	A	7	7	242605	242611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021006	TC	3	6	242617	242622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_021006	TAT	2	6	242623	242628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021006	TCC	2	6	242664	242669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_021006	TAT	2	6	242699	242704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021006	TAA	2	6	242757	242762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021006	AAT	2	6	242791	242796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021006	TTA	2	6	242874	242879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021006	ACT	2	6	246048	246053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_021006	TAG	2	6	246083	246088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021006	CAT	2	6	246120	246125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_021006	ATG	2	6	246151	246156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021006	T	6	6	246177	246182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021006	TAG	2	6	246186	246191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1043	NC_021006	GAA	2	6	249533	249538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021006	CCGT	2	8	249572	249579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_021006	TTCAG	2	10	249588	249597	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_021006	GATT	2	8	249679	249686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021006	AAGG	2	8	249698	249705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021006	TCCG	2	8	249744	249751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_021006	CGA	2	6	249773	249778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_021006	AAAAG	2	10	252398	252407	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021006	CA	3	6	252457	252462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_021006	TGCC	2	8	252498	252505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_021006	TCC	2	6	253771	253776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_021006	CT	3	6	253788	253793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_021006	GTTTT	2	10	253876	253885	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021006	T	6	6	253882	253887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021006	CTATA	2	10	253892	253901	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_021006	AGG	2	6	253923	253928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021006	TATAA	2	10	254299	254308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021006	AAC	2	6	254341	254346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021006	TTTA	2	8	254369	254376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021006	TG	3	6	254401	254406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021006	T	7	7	254442	254448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021006	CTA	2	6	254466	254471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1066	NC_021006	ATA	2	6	256131	256136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_021006	T	7	7	258550	258556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021006	AAT	2	6	258683	258688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021006	ATA	2	6	260060	260065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_021006	CCT	2	6	268636	268641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1101	NC_021006	GGA	2	6	268772	268777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021006	AT	3	6	269003	269008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021006	ACC	2	6	269020	269025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_021006	GA	3	6	269041	269046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021006	CTC	2	6	269059	269064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1113	NC_021006	CATAC	2	10	269498	269507	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_021006	CGTT	2	8	269548	269555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_021006	T	7	7	269554	269560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021006	A	8	8	269571	269578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021006	T	6	6	269617	269622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021006	A	8	8	269633	269640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021006	TAA	2	6	269661	269666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021006	ATTT	2	8	271040	271047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021006	ATTG	2	8	271135	271142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021006	AATT	2	8	271177	271184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021006	TACT	2	8	271229	271236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_021006	GGCAA	2	10	271307	271316	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_021006	A	6	6	271363	271368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021006	CTA	2	6	271408	271413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_021006	TAT	2	6	271426	271431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021006	A	6	6	271522	271527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021006	CAA	2	6	271585	271590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1132	NC_021006	TGT	2	6	271669	271674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021006	TCTT	2	8	271694	271701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_021006	TA	3	6	271731	271736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021006	GTA	2	6	271741	271746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021006	CCA	2	6	271751	271756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1138	NC_021006	ACC	2	6	271798	271803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1140	NC_021006	ATA	2	6	271817	271822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1412	NC_021006	TAGAA	2	10	318870	318879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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