MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021006	T	6	6	97190	97195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021006	TCA	2	6	97201	97206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021006	TTC	2	6	97245	97250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021006	AGTT	2	8	97358	97365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021006	CATA	2	8	97378	97385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_021006	GAA	2	6	97467	97472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021006	A	7	7	97541	97547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021006	ATT	2	6	97595	97600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021006	TAAA	2	8	98530	98537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021006	A	6	6	98540	98545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021006	AGAT	2	8	98566	98573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021006	TTGA	2	8	99511	99518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021006	T	8	8	99539	99546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021006	TAAA	2	8	100448	100455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021006	GAA	2	6	100460	100465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021006	ATT	2	6	100527	100532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021006	GGA	2	6	100534	100539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021006	TAA	2	6	100896	100901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021006	TAT	2	6	100937	100942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021006	AATT	2	8	100993	101000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021006	TACG	2	8	101045	101052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_021006	AAT	2	6	101055	101060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021006	ATA	2	6	101073	101078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021006	CAA	2	6	101126	101131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021006	TTTAT	2	10	101171	101180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021006	TAC	2	6	101241	101246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_021006	A	6	6	104035	104040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021006	GAG	2	6	104085	104090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021006	AAT	2	6	105295	105300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021006	T	6	6	105314	105319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021006	GAG	2	6	105337	105342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021006	GTTT	2	8	105344	105351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021006	TTA	2	6	107397	107402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021006	ATCT	2	8	109724	109731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_021006	AGAC	2	8	109742	109749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_021006	A	6	6	109774	109779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021006	CATT	2	8	109782	109789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_021006	AGAA	2	8	109804	109811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021006	CCT	2	6	109868	109873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_021006	TAT	2	6	109909	109914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021006	TAG	2	6	109959	109964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021006	CCAA	2	8	110027	110034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_021006	T	7	7	110044	110050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021006	GAT	2	6	110062	110067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021006	TTC	2	6	110091	110096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_021006	T	8	8	110129	110136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021006	AAT	2	6	110176	110181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021006	AT	3	6	110230	110235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021006	AGG	2	6	110249	110254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021006	T	7	7	111722	111728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021006	ATA	2	6	111737	111742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021006	A	6	6	111750	111755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021006	TAT	2	6	111770	111775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021006	TTA	2	6	111859	111864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021006	TA	4	8	111876	111883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021006	ATTTC	2	10	111971	111980	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
557	NC_021006	TAG	2	6	111985	111990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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560	NC_021006	A	6	6	112020	112025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021006	TTG	2	6	112057	112062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021006	AAT	2	6	112074	112079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021006	AAG	2	6	112082	112087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021006	TCT	2	6	112106	112111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_021006	GTA	2	6	112120	112125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021006	TAA	2	6	112126	112131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021006	ATG	2	6	117800	117805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_021006	TG	3	6	117864	117869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021006	AGA	2	6	117898	117903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021006	TGAT	2	8	117906	117913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021006	GA	3	6	117922	117927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021006	GAG	2	6	117975	117980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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575	NC_021006	TGG	2	6	118141	118146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021006	GA	3	6	118164	118169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_021006	AAAG	2	8	118320	118327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021006	AAT	2	6	118353	118358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021006	CGG	2	6	118375	118380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021006	A	6	6	118416	118421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021006	CAT	2	6	118431	118436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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588	NC_021006	AAAG	2	8	120096	120103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021006	T	6	6	120147	120152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021006	AGG	2	6	120161	120166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021006	TAT	2	6	120177	120182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021006	A	6	6	120191	120196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021006	AAC	2	6	121586	121591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021006	A	6	6	121644	121649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021006	A	6	6	121665	121670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_021006	GTG	2	6	121826	121831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021006	T	6	6	121870	121875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021006	CGTT	2	8	121880	121887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_021006	GA	3	6	121897	121902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021006	GTT	2	6	121982	121987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021006	TA	3	6	122002	122007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_021006	GGA	2	6	122133	122138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021006	CA	3	6	122167	122172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_021006	TAG	2	6	122221	122226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021006	ATTTC	2	10	122310	122319	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
610	NC_021006	TAA	2	6	122324	122329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021006	A	6	6	122379	122384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021006	TCA	2	6	122393	122398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021006	TAG	2	6	122511	122516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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615	NC_021006	TCTATC	2	12	122646	122657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_021006	TGG	2	6	122686	122691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021006	TAC	2	6	122777	122782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_021006	AG	3	6	122799	122804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021006	T	6	6	122808	122813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021006	AAG	2	6	122838	122843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021006	AT	3	6	122913	122918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021006	CTT	2	6	122939	122944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021006	ACA	2	6	123024	123029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021006	T	6	6	123091	123096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021006	TCTA	2	8	123126	123133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_021006	GAT	2	6	123167	123172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_021006	TGA	2	6	123240	123245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021006	TA	3	6	130238	130243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021006	ATA	2	6	131585	131590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021006	T	6	6	131628	131633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021006	ATA	2	6	131676	131681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021006	ATA	2	6	131683	131688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021006	TAATA	2	10	131692	131701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021006	AT	3	6	131716	131721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021006	AGG	2	6	131735	131740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021006	TGA	2	6	137639	137644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_021006	TTAT	2	8	137701	137708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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