MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021006	A	6	6	1852352	1852357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_021006	AGA	2	6	1852414	1852419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_021006	CTT	2	6	1852439	1852444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_021006	GAA	2	6	1852470	1852475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_021006	TCTGA	2	10	1852484	1852493	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8006	NC_021006	GA	3	6	1852568	1852573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_021006	GAAT	2	8	1852577	1852584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_021006	AT	3	6	1852612	1852617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_021006	TAAA	2	8	1852649	1852656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_021006	AAAG	2	8	1852660	1852667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_021006	AAT	2	6	1852674	1852679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_021006	A	6	6	1852713	1852718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_021006	TGT	2	6	1852739	1852744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_021006	AGG	2	6	1852839	1852844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_021006	ATG	2	6	1852863	1852868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_021006	CTC	2	6	1852884	1852889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_021006	AG	3	6	1852892	1852897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_021006	CTC	2	6	1852911	1852916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8019	NC_021006	AGA	2	6	1853017	1853022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_021006	AGA	2	6	1853029	1853034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_021006	CAA	2	6	1853052	1853057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_021006	AGA	2	6	1853077	1853082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_021006	TGATT	2	10	1853122	1853131	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_021006	GAT	2	6	1853174	1853179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_021006	GAT	2	6	1853282	1853287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_021006	AAGA	2	8	1853291	1853298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_021006	TTCTC	2	10	1853320	1853329	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8028	NC_021006	GAT	2	6	1853354	1853359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_021006	A	6	6	1853465	1853470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_021006	CTA	2	6	1853473	1853478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_021006	CCTT	2	8	1853524	1853531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8032	NC_021006	TTA	2	6	1853615	1853620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_021006	GAT	2	6	1853645	1853650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_021006	GTT	2	6	1853660	1853665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_021006	TGT	2	6	1853941	1853946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_021006	ATA	2	6	1853961	1853966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_021006	AATG	2	8	1854037	1854044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_021006	TCT	2	6	1854152	1854157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_021006	GGA	2	6	1854230	1854235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_021006	AGA	2	6	1854242	1854247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_021006	TGG	2	6	1854320	1854325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_021006	AGA	2	6	1854343	1854348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_021006	A	6	6	1854506	1854511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_021006	GC	3	6	1854512	1854517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8045	NC_021006	GAAGTT	2	12	1854563	1854574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_021006	TCAG	2	8	1854636	1854643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8047	NC_021006	GAA	2	6	1854716	1854721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8051	NC_021006	GTGA	2	8	1854968	1854975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_021006	GAT	2	6	1854977	1854982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_021006	AGTT	2	8	1855009	1855016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_021006	TAC	2	6	1855036	1855041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_021006	CT	3	6	1855067	1855072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8056	NC_021006	AGTC	2	8	1855177	1855184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8057	NC_021006	AT	3	6	1855187	1855192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_021006	AGA	2	6	1855230	1855235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_021006	CTGAA	2	10	1855330	1855339	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8060	NC_021006	CTC	2	6	1855351	1855356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_021006	AGT	2	6	1855395	1855400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_021006	ATAAA	2	10	1855500	1855509	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_021006	GT	3	6	1855522	1855527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_021006	TTTGA	2	10	1855528	1855537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_021006	CTGA	2	8	1855569	1855576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8066	NC_021006	TCT	2	6	1855619	1855624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8070	NC_021006	A	7	7	1858223	1858229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_021006	TA	3	6	1858263	1858268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_021006	TGA	2	6	1858288	1858293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8079	NC_021006	TAT	2	6	1858924	1858929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_021006	TAT	2	6	1866813	1866818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8091	NC_021006	ATAA	2	8	1866904	1866911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_021006	ATTG	2	8	1866936	1866943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_021006	A	6	6	1866967	1866972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_021006	A	6	6	1866975	1866980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8098	NC_021006	A	6	6	1867260	1867265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_021006	AGG	2	6	1867286	1867291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8103	NC_021006	AAG	2	6	1867618	1867623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8106	NC_021006	ATG	2	6	1867969	1867974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8108	NC_021006	TAC	2	6	1868077	1868082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_021006	ATA	2	6	1868165	1868170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_021006	A	7	7	1868222	1868228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_021006	AAC	2	6	1868260	1868265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_021006	TTC	2	6	1869516	1869521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_021006	ATT	2	6	1869551	1869556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_021006	TAT	2	6	1870240	1870245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8117	NC_021006	GAAA	2	8	1870300	1870307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_021006	AGG	2	6	1870358	1870363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_021006	GAAA	2	8	1872315	1872322	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_021006	ATA	2	6	1872323	1872328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_021006	A	6	6	1872400	1872405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_021006	ATT	2	6	1872413	1872418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8125	NC_021006	GGA	2	6	1872759	1872764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8127	NC_021006	T	6	6	1876373	1876378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_021006	CAG	2	6	1876404	1876409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_021006	ACTA	2	8	1879483	1879490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8130	NC_021006	GTT	2	6	1879514	1879519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_021006	T	6	6	1879557	1879562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8133	NC_021006	T	7	7	1879854	1879860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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