MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021006	AAG	2	6	1019857	1019862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_021006	AAT	2	6	1019900	1019905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_021006	GTC	2	6	1019926	1019931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_021006	TCC	2	6	1021101	1021106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_021006	CTAT	2	8	1021119	1021126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4506	NC_021006	CAT	2	6	1021131	1021136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_021006	ATT	2	6	1021163	1021168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_021006	AGG	2	6	1021202	1021207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_021006	CCT	2	6	1021220	1021225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_021006	TTTC	2	8	1023029	1023036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_021006	TAC	2	6	1023038	1023043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_021006	CCA	2	6	1026016	1026021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_021006	CAA	2	6	1026061	1026066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_021006	ATT	2	6	1026076	1026081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021006	TCG	2	6	1026084	1026089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_021006	ATAC	2	8	1026152	1026159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_021006	T	6	6	1026189	1026194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_021006	CT	3	6	1028516	1028521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_021006	ACC	2	6	1028548	1028553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_021006	TG	3	6	1030124	1030129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021006	CCT	2	6	1030146	1030151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_021006	ATT	2	6	1030155	1030160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_021006	TAA	2	6	1031326	1031331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_021006	TCC	2	6	1031493	1031498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_021006	TCC	2	6	1032143	1032148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_021006	C	6	6	1032189	1032194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4527	NC_021006	AAG	2	6	1032211	1032216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_021006	GAGG	2	8	1032220	1032227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_021006	TAA	2	6	1032268	1032273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_021006	CT	3	6	1032274	1032279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_021006	CTC	2	6	1032291	1032296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_021006	CTT	2	6	1032311	1032316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_021006	CAA	2	6	1032353	1032358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_021006	CCT	2	6	1032451	1032456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_021006	AT	3	6	1032465	1032470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_021006	AGTT	2	8	1032489	1032496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021006	TAA	2	6	1032501	1032506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_021006	CT	3	6	1032576	1032581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_021006	ATG	2	6	1032588	1032593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021006	ATCA	2	8	1032660	1032667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_021006	TTTTCT	2	12	1032676	1032687	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4542	NC_021006	CCA	2	6	1032692	1032697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_021006	ATC	2	6	1032708	1032713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_021006	AACG	2	8	1032742	1032749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4545	NC_021006	TTC	2	6	1032784	1032789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_021006	GTA	2	6	1032850	1032855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_021006	AAGT	2	8	1032866	1032873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_021006	CCAA	2	8	1032880	1032887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_021006	TGA	2	6	1032900	1032905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_021006	AATA	2	8	1032906	1032913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_021006	CTG	2	6	1032949	1032954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_021006	T	6	6	1033005	1033010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_021006	AAT	2	6	1033116	1033121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_021006	GTT	2	6	1033125	1033130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_021006	T	6	6	1033141	1033146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_021006	TCA	2	6	1033356	1033361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_021006	ATCA	2	8	1033400	1033407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_021006	GATA	2	8	1033439	1033446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_021006	TAG	2	6	1033496	1033501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_021006	ATTT	2	8	1033559	1033566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_021006	TCT	2	6	1033658	1033663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_021006	CT	3	6	1033662	1033667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_021006	TAT	2	6	1033685	1033690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_021006	ATTTT	2	10	1033700	1033709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021006	T	6	6	1033706	1033711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_021006	AAT	2	6	1033733	1033738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_021006	AAT	2	6	1033767	1033772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_021006	TCC	2	6	1033779	1033784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_021006	AGG	2	6	1033819	1033824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_021006	TGA	2	6	1034655	1034660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4572	NC_021006	TGA	2	6	1034700	1034705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_021006	AGTC	2	8	1034706	1034713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4574	NC_021006	AT	3	6	1034716	1034721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_021006	ATG	2	6	1034741	1034746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_021006	TCTG	2	8	1034772	1034779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_021006	CTGA	2	8	1034780	1034787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4578	NC_021006	CAC	2	6	1034800	1034805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_021006	ATT	2	6	1034811	1034816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4581	NC_021006	GAG	2	6	1035063	1035068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_021006	GCTC	2	8	1035095	1035102	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_021006	TAT	2	6	1035107	1035112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_021006	GACT	2	8	1035180	1035187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4588	NC_021006	TAT	2	6	1035450	1035455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_021006	AAG	2	6	1035511	1035516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_021006	GACT	2	8	1035523	1035530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4591	NC_021006	A	6	6	1035567	1035572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_021006	ACTA	2	8	1035626	1035633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4593	NC_021006	TATT	2	8	1035670	1035677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_021006	T	6	6	1035676	1035681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4597	NC_021006	T	6	6	1039259	1039264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_021006	A	7	7	1039320	1039326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_021006	A	6	6	1039335	1039340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_021006	TATAT	2	10	1039372	1039381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_021006	CATT	2	8	1043853	1043860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4602	NC_021006	TTC	2	6	1043904	1043909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_021006	TA	3	6	1043926	1043931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_021006	ATA	2	6	1044073	1044078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_021006	AC	3	6	1044081	1044086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_021006	T	6	6	1044096	1044101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_021006	CT	3	6	1044151	1044156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_021006	AAT	2	6	1044164	1044169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_021006	AAT	2	6	1045068	1045073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_021006	GATAAA	2	12	1045092	1045103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_021006	CAA	2	6	1045153	1045158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_021006	AAT	2	6	1045214	1045219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_021006	GA	3	6	1045279	1045284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_021006	AAC	2	6	1045287	1045292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_021006	T	6	6	1045399	1045404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_021006	A	6	6	1045410	1045415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_021006	TAT	2	6	1045432	1045437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4619	NC_021006	GTT	2	6	1045467	1045472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_021006	AAG	2	6	1045483	1045488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_021006	TTAG	3	12	1045489	1045500	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_021006	AAT	2	6	1045504	1045509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021006	A	7	7	1045614	1045620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_021006	TCG	2	6	1045641	1045646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_021006	AAAT	2	8	1045683	1045690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_021006	CAC	2	6	1045736	1045741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_021006	CGG	2	6	1045762	1045767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_021006	CGTT	2	8	1047142	1047149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4629	NC_021006	GTT	2	6	1047185	1047190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_021006	ACT	2	6	1047228	1047233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_021006	GTT	2	6	1047261	1047266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4633	NC_021006	CCT	2	6	1047497	1047502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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