MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 8563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021005	TCT	2	6	739598	739603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_021005	GGA	2	6	739676	739681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021005	AGA	2	6	739688	739693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021005	TGG	2	6	739766	739771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_021005	AGA	2	6	739789	739794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021005	A	6	6	739952	739957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021005	GC	3	6	739958	739963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_021005	GAAGTT	2	12	740009	740020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021005	TCAG	2	8	740082	740089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_021005	GAA	2	6	740162	740167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021005	GTT	2	6	740195	740200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021005	GGAA	2	8	740215	740222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021005	CTA	2	6	740315	740320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_021005	GTGA	2	8	740414	740421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021005	GAT	2	6	740423	740428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021005	AGTT	2	8	740455	740462	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_021005	TAC	2	6	740482	740487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_021005	CT	3	6	740513	740518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_021005	AGTC	2	8	740623	740630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_021005	AT	3	6	740633	740638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021005	AGA	2	6	740676	740681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021005	CTGAA	2	10	740776	740785	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3023	NC_021005	CTC	2	6	740797	740802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_021005	AGT	2	6	740841	740846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021005	ATAAA	2	10	740946	740955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_021005	GT	3	6	740968	740973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_021005	TTTGA	2	10	740974	740983	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_021005	CTGA	2	8	741015	741022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_021005	TCT	2	6	741065	741070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_021005	A	7	7	742374	742380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021005	ACTA	2	8	742657	742664	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_021005	TA	3	6	742671	742676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021005	A	7	7	743669	743675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_021005	TA	3	6	743709	743714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021005	TGA	2	6	743734	743739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021005	AGG	2	6	743803	743808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021005	ATA	2	6	744222	744227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021005	GAT	2	6	744243	744248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021005	TAT	2	6	744298	744303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_021005	GAA	2	6	744325	744330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021005	TTC	2	6	744350	744355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_021005	TAT	2	6	744370	744375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021005	CAAT	2	8	747384	747391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_021005	AGG	2	6	747424	747429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021005	T	6	6	748529	748534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021005	CTA	2	6	748574	748579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_021005	AAATA	2	10	748602	748611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021005	A	7	7	752185	752191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021005	C	6	6	752214	752219	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3050	NC_021005	A	6	6	752233	752238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021005	TAT	2	6	752259	752264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021005	ATG	2	6	752276	752281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021005	AAAT	2	8	752337	752344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021005	ATAA	2	8	752350	752357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_021005	ATTG	2	8	752382	752389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021005	A	6	6	752413	752418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021005	A	6	6	752421	752426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_021005	CTT	2	6	752536	752541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_021005	TTG	2	6	752579	752584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021005	AG	3	6	752640	752645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021005	A	6	6	752706	752711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021005	AGG	2	6	752732	752737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021005	AGAA	2	8	752744	752751	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021005	TCT	3	9	752798	752806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_021005	CTA	3	9	752834	752842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_021005	AAG	2	6	753064	753069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_021005	ATC	2	6	753344	753349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_021005	AG	3	6	753357	753362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021005	ATG	2	6	753415	753420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021005	CTT	2	6	753426	753431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_021005	TAC	2	6	753523	753528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_021005	ATA	2	6	753611	753616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021005	A	7	7	753668	753674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_021005	AGG	2	6	755804	755809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021005	GAAA	2	8	757761	757768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_021005	ATA	2	6	757769	757774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3086	NC_021005	GAA	2	6	757868	757873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_021005	GAA	2	6	760658	760663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021005	T	6	6	761819	761824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3094	NC_021005	T	6	6	765003	765008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3096	NC_021005	T	7	7	765300	765306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3098	NC_021005	GA	3	6	765344	765349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021005	CGG	2	6	765368	765373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_021005	TTCGGG	2	12	765390	765401	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3101	NC_021005	CT	4	8	765413	765420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_021005	TAA	2	6	765513	765518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021005	TATTT	2	10	765547	765556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021005	A	7	7	765608	765614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021005	TTG	2	6	765647	765652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021005	T	6	6	765658	765663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_021005	CTTT	2	8	766981	766988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_021005	T	6	6	766986	766991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021005	T	6	6	767016	767021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021005	TGA	2	6	767069	767074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021005	ATT	2	6	767076	767081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021005	TCTTT	2	10	767132	767141	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3113	NC_021005	GTG	2	6	767274	767279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021005	TGT	2	6	767494	767499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021005	TAA	2	6	767635	767640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021005	GAA	2	6	767674	767679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_021005	TTC	2	6	767704	767709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_021005	TGA	2	6	767722	767727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021005	CATCTC	2	12	767762	767773	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_021005	AGTTGA	2	12	767881	767892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021005	T	6	6	767952	767957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021005	TGA	2	6	767961	767966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_021005	CAT	2	6	768013	768018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3125	NC_021005	GAT	2	6	768181	768186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021005	TG	3	6	768192	768197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021005	TGA	2	6	768207	768212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021005	GTT	2	6	768297	768302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_021005	T	7	7	768334	768340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021005	ATA	2	6	768360	768365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_021005	T	6	6	768453	768458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021005	ATA	2	6	768462	768467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021005	ACA	2	6	770661	770666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_021005	TAT	3	9	770670	770678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_021005	GCT	2	6	770692	770697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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