MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 8563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021005	GAT	2	6	355547	355552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021005	GAAG	2	8	355557	355564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021005	T	6	6	355646	355651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021005	TTCT	2	8	358269	358276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_021005	ATAAA	2	10	358294	358303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021005	GCAGTT	2	12	360459	360470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1507	NC_021005	T	6	6	360481	360486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021005	GAG	2	6	360487	360492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021005	TA	3	6	360497	360502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021005	TAC	2	6	360523	360528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_021005	AGG	2	6	360538	360543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021005	AT	3	6	360544	360549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021005	GGA	2	6	361580	361585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021005	TA	3	6	361586	361591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021005	AAG	2	6	362758	362763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021005	TGT	2	6	362770	362775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021005	TAT	2	6	364102	364107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021005	AGT	2	6	365000	365005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021005	TTAC	2	8	365033	365040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_021005	GAA	2	6	365060	365065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021005	TCCT	2	8	365070	365077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_021005	T	7	7	365157	365163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_021005	ATT	2	6	365176	365181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021005	TAG	2	6	365197	365202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021005	TCAA	2	8	365290	365297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_021005	ACA	3	9	365306	365314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_021005	TAA	2	6	365315	365320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021005	ATA	2	6	365361	365366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021005	CTA	2	6	365446	365451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021005	TA	3	6	365455	365460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021005	ATT	2	6	365551	365556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021005	A	6	6	365573	365578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021005	AAG	2	6	365927	365932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021005	T	7	7	365956	365962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021005	ATA	2	6	365971	365976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021005	ATAG	2	8	365979	365986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021005	T	6	6	366020	366025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021005	T	7	7	369855	369861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021005	T	6	6	369883	369888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021005	GAG	2	6	372282	372287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021005	AGC	2	6	372293	372298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_021005	A	6	6	372309	372314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021005	TTTTC	2	10	372348	372357	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1544	NC_021005	GAAA	2	8	372375	372382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021005	A	7	7	372413	372419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021005	GCT	2	6	372488	372493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_021005	TGG	2	6	372572	372577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021005	AGT	2	6	372601	372606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021005	AGA	2	6	372637	372642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021005	AAT	2	6	372643	372648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021005	ATA	2	6	372783	372788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021005	ACC	2	6	372813	372818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_021005	GTT	2	6	372820	372825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021005	AGA	2	6	372834	372839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021005	T	6	6	372893	372898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021005	ACT	2	6	372930	372935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_021005	AAGC	2	8	373011	373018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_021005	GGT	2	6	373102	373107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021005	TAG	2	6	373124	373129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1561	NC_021005	AAT	2	6	373176	373181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021005	GAA	2	6	373182	373187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_021005	A	6	6	373198	373203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021005	ATT	2	6	373216	373221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021005	GAA	2	6	373288	373293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021005	TTC	2	6	373338	373343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1568	NC_021005	TAT	2	6	373397	373402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021005	ATG	2	6	373408	373413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021005	ATA	2	6	373429	373434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021005	TAT	2	6	373479	373484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021005	GAAT	2	8	373498	373505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021005	AGGG	2	8	373511	373518	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1582	NC_021005	CAT	2	6	373834	373839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_021005	TCA	2	6	373853	373858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_021005	A	6	6	373872	373877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_021005	TGA	2	6	373889	373894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021005	ATG	2	6	373954	373959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021005	GTA	2	6	373971	373976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021005	TTAAA	2	10	374023	374032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_021005	TAG	2	6	374260	374265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_021005	TTTA	2	8	374884	374891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_021005	A	6	6	374919	374924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021005	TAA	2	6	376232	376237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021005	TGG	2	6	376257	376262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021005	TTCTG	2	10	378680	378689	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1604	NC_021005	AGA	3	9	378725	378733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021005	TAA	2	6	383690	383695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021005	T	6	6	383717	383722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021005	GA	3	6	383819	383824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021005	AGGC	2	8	383847	383854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_021005	CTTT	2	8	383951	383958	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_021005	CA	3	6	385314	385319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_021005	T	7	7	385330	385336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021005	AAT	2	6	385344	385349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021005	AT	3	6	385363	385368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021005	AT	4	8	385370	385377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021005	AAC	2	6	385412	385417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_021005	GA	3	6	385429	385434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021005	AAT	2	6	385487	385492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021005	AAT	2	6	385502	385507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_021005	AAT	2	6	386101	386106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021005	T	7	7	386116	386122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021005	ATC	2	6	386125	386130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_021005	ATT	2	6	386167	386172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021005	A	6	6	388397	388402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021005	TCCA	2	8	388441	388448	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_021005	TGTA	2	8	388473	388480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021005	CCT	2	6	388511	388516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_021005	AGA	3	9	388548	388556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_021005	AGTA	2	8	390346	390353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021005	AGAA	2	8	390371	390378	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021005	T	6	6	390383	390388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021005	GAA	2	6	390393	390398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021005	T	6	6	390459	390464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021005	A	6	6	390481	390486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021005	AAT	2	6	390505	390510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021005	TAAAA	2	10	390638	390647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_021005	TA	3	6	474495	474500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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