MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 8563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021005	A	6	6	1998765	1998770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_021005	T	6	6	1999853	1999858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_021005	CCT	2	6	1999888	1999893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8504	NC_021005	T	7	7	2000714	2000720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_021005	CTT	2	6	2000724	2000729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_021005	TCA	2	6	2000773	2000778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_021005	TAT	2	6	2000787	2000792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_021005	CTT	2	6	2002113	2002118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_021005	A	7	7	2002141	2002147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_021005	TAA	2	6	2002152	2002157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_021005	CTT	2	6	2007386	2007391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_021005	TAT	2	6	2007401	2007406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_021005	CCT	2	6	2009953	2009958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8514	NC_021005	TA	3	6	2009959	2009964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_021005	TAT	2	6	2009973	2009978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_021005	TC	4	8	2010050	2010057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8517	NC_021005	TCTT	2	8	2013119	2013126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8518	NC_021005	TATC	2	8	2013152	2013159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8519	NC_021005	TAAA	2	8	2013197	2013204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_021005	A	6	6	2013202	2013207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_021005	TTC	2	6	2013215	2013220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_021005	T	7	7	2014317	2014323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_021005	AAAT	2	8	2014347	2014354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_021005	TAG	2	6	2014447	2014452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_021005	AATA	2	8	2014453	2014460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_021005	T	7	7	2018746	2018752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_021005	TCT	2	6	2018755	2018760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_021005	TTG	2	6	2018835	2018840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_021005	TTGT	2	8	2018848	2018855	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_021005	GTA	2	6	2018959	2018964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_021005	A	6	6	2018982	2018987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_021005	GAT	2	6	2019053	2019058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_021005	AATA	2	8	2019062	2019069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_021005	TCTCA	2	10	2019071	2019080	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8535	NC_021005	CTC	2	6	2019109	2019114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8536	NC_021005	ATTT	2	8	2019152	2019159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_021005	TTA	2	6	2019504	2019509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_021005	ACTG	2	8	2019544	2019551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8539	NC_021005	TGA	2	6	2020301	2020306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_021005	AAT	2	6	2020358	2020363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_021005	GTT	2	6	2020368	2020373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_021005	T	8	8	2020372	2020379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_021005	T	6	6	2020414	2020419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_021005	ATA	2	6	2020444	2020449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_021005	A	6	6	2020461	2020466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_021005	A	6	6	2020482	2020487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_021005	AGG	2	6	2020522	2020527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_021005	TCTA	2	8	2021104	2021111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8549	NC_021005	CAT	2	6	2021141	2021146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_021005	CTA	2	6	2021163	2021168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_021005	CCG	2	6	2021222	2021227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8552	NC_021005	T	7	7	2023556	2023562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_021005	TC	3	6	2023621	2023626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8554	NC_021005	T	7	7	2023635	2023641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_021005	T	6	6	2023656	2023661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_021005	A	6	6	2023665	2023670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_021005	TAT	2	6	2023694	2023699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_021005	CAG	2	6	2023708	2023713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_021005	ATT	2	6	2023783	2023788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_021005	T	6	6	2024323	2024328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_021005	A	6	6	2024348	2024353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_021005	AAAG	2	8	2025676	2025683	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_021005	T	7	7	2026492	2026498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.