MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 8563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_021005	AAGC	2	8	1846635	1846642	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8003	NC_021005	TCC	2	6	1846643	1846648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_021005	CGC	2	6	1846678	1846683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_021005	T	7	7	1846764	1846770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_021005	TAC	2	6	1846781	1846786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_021005	TGT	2	6	1846793	1846798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_021005	TC	3	6	1846855	1846860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8009	NC_021005	T	6	6	1846909	1846914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_021005	T	7	7	1846928	1846934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_021005	T	7	7	1846939	1846945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_021005	CCG	2	6	1847003	1847008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_021005	GTT	2	6	1847049	1847054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_021005	TAT	2	6	1847070	1847075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_021005	ACT	2	6	1847098	1847103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_021005	T	7	7	1847112	1847118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_021005	T	8	8	1847121	1847128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_021005	TAT	2	6	1849087	1849092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_021005	TATAT	2	10	1849117	1849126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_021005	AG	3	6	1849162	1849167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_021005	TCT	2	6	1849194	1849199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_021005	TTC	2	6	1850552	1850557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_021005	TCT	2	6	1850568	1850573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_021005	T	7	7	1850598	1850604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_021005	A	6	6	1850683	1850688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_021005	AGAA	2	8	1850693	1850700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_021005	TATCA	2	10	1851443	1851452	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8028	NC_021005	T	8	8	1851478	1851485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_021005	T	6	6	1851502	1851507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_021005	CTT	2	6	1851540	1851545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_021005	CTC	2	6	1853319	1853324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8032	NC_021005	TTATA	2	10	1853326	1853335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_021005	TCC	2	6	1853406	1853411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_021005	TCA	2	6	1853581	1853586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_021005	CTGGA	2	10	1853686	1853695	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8036	NC_021005	TTC	2	6	1853696	1853701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_021005	TCAG	2	8	1853708	1853715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8038	NC_021005	GATT	2	8	1853720	1853727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_021005	GAA	2	6	1853734	1853739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_021005	GGTA	2	8	1853767	1853774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_021005	CAT	2	6	1853858	1853863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_021005	A	7	7	1853873	1853879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_021005	A	6	6	1853906	1853911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_021005	A	6	6	1853974	1853979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_021005	ATC	2	6	1854015	1854020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8047	NC_021005	A	6	6	1855795	1855800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_021005	TG	3	6	1855846	1855851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_021005	A	6	6	1855865	1855870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_021005	AAG	2	6	1855885	1855890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_021005	TC	3	6	1858471	1858476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_021005	A	7	7	1859025	1859031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_021005	T	6	6	1859048	1859053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_021005	CTT	2	6	1859054	1859059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8057	NC_021005	CGT	2	6	1860920	1860925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8059	NC_021005	CTT	2	6	1861111	1861116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8061	NC_021005	ATA	2	6	1861170	1861175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_021005	TGAT	2	8	1861206	1861213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_021005	ATTC	2	8	1861229	1861236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8064	NC_021005	GAT	2	6	1861255	1861260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_021005	GTT	2	6	1861269	1861274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_021005	TC	3	6	1861325	1861330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8067	NC_021005	AT	3	6	1861415	1861420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_021005	AAC	2	6	1861494	1861499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8077	NC_021005	GTA	2	6	1864461	1864466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8083	NC_021005	A	6	6	1868647	1868652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_021005	GAG	2	6	1868686	1868691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_021005	AAAG	2	8	1868737	1868744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_021005	TGA	2	6	1868862	1868867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_021005	GTT	2	6	1869657	1869662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8098	NC_021005	AGAA	2	8	1869823	1869830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_021005	AGG	2	6	1869839	1869844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_021005	A	6	6	1871806	1871811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_021005	T	6	6	1871821	1871826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_021005	TTTC	2	8	1871839	1871846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8103	NC_021005	TCC	2	6	1874204	1874209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8104	NC_021005	T	6	6	1874248	1874253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_021005	CCT	2	6	1874968	1874973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8106	NC_021005	A	6	6	1875002	1875007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_021005	T	6	6	1875049	1875054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_021005	AAGC	2	8	1875086	1875093	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8109	NC_021005	GAAAA	2	10	1876120	1876129	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_021005	A	6	6	1876126	1876131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_021005	ATTG	2	8	1876142	1876149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_021005	TAT	2	6	1878652	1878657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_021005	TTC	2	6	1878693	1878698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8117	NC_021005	ATT	2	6	1882471	1882476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_021005	CGTA	2	8	1883484	1883491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8119	NC_021005	TAA	2	6	1883773	1883778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_021005	TAC	2	6	1883794	1883799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_021005	ATAA	2	8	1883879	1883886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_021005	ATA	2	6	1883894	1883899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_021005	AAT	2	6	1883900	1883905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_021005	TCC	2	6	1883919	1883924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8125	NC_021005	AATC	2	8	1883927	1883934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8126	NC_021005	TCGAT	2	10	1883974	1883983	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8127	NC_021005	TGA	2	6	1884062	1884067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8129	NC_021005	T	7	7	1884163	1884169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_021005	ATA	2	6	1884173	1884178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_021005	T	7	7	1884184	1884190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_021005	TAA	2	6	1884196	1884201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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