MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH1

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020894	GC	3	6	1	6	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020894	CG	4	8	3155	3162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020894	CG	3	6	3173	3178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020894	GC	3	6	3718	3723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020894	TC	3	6	9051	9056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020894	TG	4	8	14143	14150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020894	CG	4	8	14246	14253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020894	GT	3	6	15730	15735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020894	GC	3	6	16883	16888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020894	AG	3	6	18274	18279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020894	CG	3	6	19132	19137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020894	CG	3	6	19218	19223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020894	TG	3	6	20290	20295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020894	GC	3	6	21212	21217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020894	TG	5	10	21300	21309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020894	CG	4	8	23238	23245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020894	GC	4	8	31953	31960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020894	CG	3	6	32013	32018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020894	GC	3	6	32610	32615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020894	AC	3	6	33634	33639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020894	GC	3	6	34376	34381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020894	GC	3	6	35115	35120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020894	AC	3	6	35247	35252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020894	GC	3	6	36175	36180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020894	GC	3	6	38133	38138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020894	CG	4	8	38400	38407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020894	CG	3	6	40641	40646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020894	CG	3	6	40702	40707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020894	CG	3	6	40763	40768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020894	CG	3	6	40824	40829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020894	GT	3	6	41087	41092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020894	CA	3	6	50938	50943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020894	GC	3	6	51126	51131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020894	CG	3	6	51464	51469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020894	GC	3	6	52188	52193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020894	GC	3	6	52319	52324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020894	CG	3	6	52988	52993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020894	CG	3	6	53049	53054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020894	CG	3	6	53171	53176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020894	GC	3	6	58989	58994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020894	AC	3	6	61693	61698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020894	CG	3	6	61731	61736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020894	CA	3	6	65953	65958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020894	AC	3	6	67429	67434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020894	CA	3	6	72483	72488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020894	GC	3	6	73388	73393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020894	GA	3	6	73469	73474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020894	GC	3	6	73948	73953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020894	AC	3	6	78297	78302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020894	CG	3	6	88692	88697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020894	AG	3	6	92777	92782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020894	CG	3	6	94767	94772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020894	AC	3	6	97509	97514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020894	CG	3	6	103630	103635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020894	GC	3	6	106403	106408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020894	CT	3	6	124408	124413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020894	GC	3	6	127775	127780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020894	TC	3	6	129149	129154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020894	TC	3	6	133953	133958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020894	CG	3	6	135469	135474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020894	GC	3	6	135566	135571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020894	CG	3	6	137235	137240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020894	CG	3	6	137698	137703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020894	GC	3	6	137872	137877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020894	GC	3	6	138909	138914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020894	CT	3	6	140643	140648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020894	GT	3	6	143372	143377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020894	CA	3	6	146386	146391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020894	CT	3	6	148063	148068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020894	CG	3	6	149512	149517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020894	TC	3	6	150741	150746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020894	GC	3	6	152982	152987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020894	CG	3	6	154960	154965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020894	GC	3	6	156935	156940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020894	GC	3	6	157197	157202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020894	GC	4	8	164223	164230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.