MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020568	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020568	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020568	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020568	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020568	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020568	TTTCA	2	10	34313	34322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020568	TAAAA	2	10	35766	35775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020568	AGATA	2	10	35924	35933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020568	ATGAG	2	10	37066	37075	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020568	CAAAA	2	10	38094	38103	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020568	TTTGT	2	10	43472	43481	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020568	TTTTG	2	10	45118	45127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020568	AAGTA	2	10	56290	56299	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020568	TTTTA	2	10	56654	56663	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020568	CATTT	2	10	62273	62282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020568	TTTTA	2	10	65133	65142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020568	GTGTT	2	10	70941	70950	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020568	ATTCA	2	10	73533	73542	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020568	GTAAT	2	10	95630	95639	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020568	AGATG	2	10	102226	102235	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020568	ATTTT	2	10	117778	117787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020568	TGATT	2	10	160118	160127	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020568	CAAAA	2	10	160371	160380	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020568	CAAAA	2	10	162482	162491	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020568	TAAAG	2	10	162831	162840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020568	TATCA	2	10	172859	172868	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020568	ATCAT	2	10	180991	181000	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020568	CAACT	2	10	193123	193132	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020568	GCTTT	2	10	197635	197644	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020568	TGAAG	2	10	197837	197846	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020568	AAAAT	2	10	197908	197917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020568	TGATT	2	10	197981	197990	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020568	GAAAA	2	10	208629	208638	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020568	TAACA	2	10	209000	209009	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020568	AATAT	2	10	228195	228204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020568	TATTG	2	10	231399	231408	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020568	TATTT	2	10	234186	234195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020568	AATTG	2	10	239899	239908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020568	AACAT	2	10	242529	242538	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020568	GATAA	2	10	246466	246475	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020568	ATAAC	2	10	251113	251122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020568	TGAAT	2	10	251224	251233	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020568	ATTAA	2	10	251365	251374	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020568	AAAGT	2	10	255109	255118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020568	AATTA	2	10	255222	255231	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020568	TAAAA	2	10	256822	256831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020568	AAATT	2	10	258138	258147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020568	TAAAA	2	10	272284	272293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020568	GAAAA	2	10	280074	280083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020568	ATAAA	2	10	280192	280201	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020568	TCATA	2	10	288654	288663	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020568	ATTTA	2	10	302577	302586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020568	ACTCG	2	10	306438	306447	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_020568	AATTT	2	10	312849	312858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020568	AATTA	2	10	314230	314239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020568	TAAAT	2	10	333369	333378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020568	ATTTT	2	10	338926	338935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020568	ATAGA	2	10	345170	345179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020568	TGACA	2	10	345362	345371	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020568	AAGAT	2	10	346421	346430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020568	GATAA	2	10	357667	357676	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020568	TAAAA	2	10	369107	369116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020568	TTGTT	2	10	369412	369421	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020568	TATCA	3	15	372409	372423	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020568	GAATG	2	10	386671	386680	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020568	AGATA	2	10	393541	393550	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020568	AGAAT	2	10	393782	393791	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020568	TAAGG	2	10	393846	393855	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020568	ATTGT	2	10	395065	395074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020568	TAAAT	2	10	401304	401313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020568	AGATA	2	10	401407	401416	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020568	ACAGT	2	10	405398	405407	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020568	CATAA	2	10	415882	415891	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020568	TAAAA	2	10	416106	416115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020568	AAAGT	2	10	429059	429068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020568	AAATT	2	10	432238	432247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020568	GAAAA	2	10	442946	442955	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020568	ATAGC	2	10	443813	443822	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020568	TGAAA	2	10	443827	443836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020568	AATGC	2	10	443930	443939	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020568	TAAAG	2	10	444023	444032	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020568	CTCAC	2	10	445928	445937	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_020568	CAAAG	2	10	445953	445962	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020568	CTTAA	2	10	463579	463588	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020568	TGGTG	2	10	481398	481407	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020568	CAACT	2	10	481969	481978	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_020568	TCGTG	2	10	483262	483271	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020568	TTAAT	2	10	483903	483912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020568	GATTG	2	10	485705	485714	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020568	GATTT	2	10	490634	490643	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020568	TCTGT	2	10	492811	492820	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020568	ATATA	2	10	493052	493061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020568	CAAAG	2	10	499600	499609	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020568	ATGGT	2	10	502034	502043	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020568	CATTA	2	10	502484	502493	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020568	TTGAT	2	10	502761	502770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020568	AAAAG	2	10	513977	513986	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020568	AGACA	2	10	516743	516752	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020568	AAGTA	2	10	519178	519187	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020568	TTAAA	2	10	521301	521310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020568	GATAA	2	10	521340	521349	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020568	GGTAA	2	10	526872	526881	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020568	TCGTG	2	10	527691	527700	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020568	GATTG	2	10	530090	530099	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020568	ATATA	2	10	536704	536713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020568	AAAAT	2	10	541479	541488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020568	TTTAT	2	10	541588	541597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020568	TTATG	2	10	544594	544603	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020568	ATTTA	2	10	544739	544748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020568	ACAAT	2	10	546544	546553	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020568	AAATA	2	10	549033	549042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020568	TGAAT	2	10	551011	551020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020568	GTATA	2	10	551068	551077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020568	TATAA	2	10	554785	554794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020568	GTTTA	2	10	570928	570937	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020568	TAAAG	2	10	575122	575131	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020568	GAAGC	2	10	576478	576487	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020568	ATATT	2	10	581259	581268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020568	TTAAC	2	10	584171	584180	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020568	AATTT	2	10	584256	584265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020568	ATAAA	2	10	592578	592587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020568	TAAAA	2	10	608043	608052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020568	TTATA	2	10	608476	608485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020568	CACAT	2	10	608872	608881	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_020568	AGCAG	2	10	610672	610681	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020568	GTAAA	2	10	610881	610890	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020568	ATGAT	2	10	617895	617904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020568	TAATT	2	10	621382	621391	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020568	TAAAT	2	10	630783	630792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020568	AAATT	2	10	632787	632796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020568	TAAAA	2	10	639682	639691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020568	CTATC	2	10	640484	640493	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_020568	ATTAA	2	10	641870	641879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020568	TTATT	2	10	641919	641928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020568	CAATA	2	10	641985	641994	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020568	TTAAT	2	10	644611	644620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020568	AAATA	2	10	646876	646885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020568	ATTTT	2	10	646898	646907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020568	ATAAA	2	10	653485	653494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020568	TTTTA	2	10	657271	657280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020568	AAAGG	2	10	657592	657601	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020568	ATATA	2	10	660829	660838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020568	AAACT	2	10	664354	664363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_020568	TTCAC	2	10	669567	669576	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_020568	TTTGT	2	10	673473	673482	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020568	AATGA	2	10	673546	673555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020568	GGTTG	2	10	680548	680557	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020568	TAAAC	2	10	688474	688483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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