MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020568	AT	3	6	340596	340601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020568	GTT	2	6	340624	340629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020568	A	7	7	340651	340657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020568	TCT	2	6	342757	342762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_020568	TAA	2	6	342912	342917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020568	AAT	2	6	342926	342931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020568	ATG	2	6	342957	342962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020568	T	6	6	342973	342978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020568	GAAT	2	8	345141	345148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020568	ATG	2	6	345154	345159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020568	ATAGA	2	10	345170	345179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020568	AATG	2	8	345214	345221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020568	ATATGA	2	12	345240	345251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020568	TGACA	2	10	345362	345371	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_020568	AGA	2	6	346406	346411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020568	AAGAT	2	10	346421	346430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020568	ATT	2	6	346445	346450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020568	GAT	2	6	346507	346512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020568	GAT	2	6	346564	346569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020568	ATT	2	6	346633	346638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020568	GAA	3	9	346657	346665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020568	AGA	2	6	346692	346697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020568	GTT	2	6	346704	346709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020568	GAT	2	6	346717	346722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020568	AAG	2	6	346730	346735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1531	NC_020568	CTA	2	6	349731	349736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_020568	TA	3	6	349746	349751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020568	TAAG	2	8	350855	350862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020568	TA	3	6	350913	350918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1541	NC_020568	T	6	6	352618	352623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020568	GA	3	6	352728	352733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020568	TCA	2	6	352747	352752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_020568	TGCAAT	2	12	352827	352838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1545	NC_020568	ATCA	2	8	352881	352888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_020568	AAT	2	6	352911	352916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020568	GTA	2	6	352925	352930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020568	ATG	2	6	352987	352992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020568	GTT	2	6	352996	353001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020568	TCC	2	6	354989	354994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_020568	TTGTAA	2	12	354998	355009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020568	AAAT	2	8	355110	355117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020568	TTAG	2	8	355158	355165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020568	TGG	2	6	355179	355184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020568	TATT	2	8	355211	355218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1557	NC_020568	TTA	2	6	355391	355396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020568	GAA	2	6	355452	355457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020568	GACT	2	8	355467	355474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1561	NC_020568	GAA	3	9	355553	355561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020568	ATT	2	6	355689	355694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020568	TCGG	2	8	357105	357112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_020568	A	7	7	357127	357133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020568	AT	3	6	357137	357142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020568	A	6	6	357155	357160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020568	AT	3	6	357204	357209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020568	GAA	2	6	357217	357222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020568	GAA	2	6	357244	357249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020568	TGA	2	6	357435	357440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020568	T	6	6	357456	357461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020568	ATT	2	6	357474	357479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020568	GTG	2	6	357546	357551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_020568	AT	3	6	357653	357658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_020568	ATC	2	6	364075	364080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_020568	GT	3	6	368950	368955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020568	TCT	2	6	368976	368981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_020568	T	6	6	369038	369043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020568	AAT	2	6	369053	369058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020568	GAC	2	6	369077	369082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_020568	TTG	2	6	369088	369093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020568	TAAAA	2	10	369107	369116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020568	GTTA	2	8	369119	369126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020568	CTCA	2	8	369141	369148	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_020568	AGT	2	6	369151	369156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020568	AAT	2	6	369210	369215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020568	ATA	2	6	369261	369266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020568	AAGTAC	2	12	369289	369300	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1616	NC_020568	TTGTT	2	10	369412	369421	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020568	GAT	2	6	369439	369444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1620	NC_020568	TTG	2	6	369587	369592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020568	TTG	2	6	369599	369604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020568	ATA	2	6	369627	369632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020568	CAT	2	6	369670	369675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_020568	GTT	2	6	369752	369757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020568	CATA	2	8	369767	369774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_020568	T	7	7	369789	369795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020568	TAT	2	6	370047	370052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020568	GAG	2	6	370054	370059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_020568	ATA	2	6	372310	372315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020568	ATC	2	6	372345	372350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_020568	GAT	2	6	372383	372388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020568	TATCA	3	15	372409	372423	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1633	NC_020568	AGA	2	6	372433	372438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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