MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020568	ATA	2	6	228135	228140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020568	A	7	7	228140	228146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020568	TGT	2	6	228150	228155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020568	AATAT	2	10	228195	228204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020568	TGA	2	6	228247	228252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020568	TATT	2	8	228852	228859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020568	TAA	2	6	228919	228924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020568	AT	3	6	228957	228962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020568	AT	3	6	230481	230486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020568	CT	3	6	230632	230637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_020568	GAAA	2	8	230650	230657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020568	TGT	2	6	231352	231357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020568	TATTG	2	10	231399	231408	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020568	AAT	2	6	231453	231458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020568	TCA	3	9	231463	231471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_020568	AAT	2	6	234039	234044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020568	TGT	2	6	234120	234125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020568	TTTG	2	8	234140	234147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020568	TATTT	2	10	234186	234195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020568	TA	3	6	234204	234209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020568	AT	3	6	234282	234287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020568	CAA	2	6	234325	234330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020568	T	6	6	234334	234339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020568	AT	3	6	234348	234353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020568	TGT	2	6	234401	234406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020568	ACAT	2	8	234466	234473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_020568	TGA	2	6	234475	234480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020568	A	7	7	234502	234508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020568	CAA	2	6	234512	234517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_020568	AAAG	2	8	237637	237644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020568	CTT	2	6	237677	237682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_020568	GTA	2	6	237713	237718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020568	ATC	2	6	237818	237823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_020568	TTA	2	6	237831	237836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020568	ATATGA	2	12	237849	237860	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020568	GAT	2	6	239734	239739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020568	ATT	2	6	239865	239870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020568	AATTG	2	10	239899	239908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020568	ATTT	2	8	240039	240046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020568	TGCT	2	8	240126	240133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_020568	TGT	2	6	240205	240210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020568	A	7	7	240244	240250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020568	AT	3	6	240325	240330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020568	GGA	2	6	240386	240391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020568	A	6	6	240395	240400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020568	ACA	2	6	242433	242438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_020568	ATG	2	6	242454	242459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020568	ATT	2	6	242506	242511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020568	AACAT	2	10	242529	242538	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1050	NC_020568	AT	3	6	242545	242550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020568	AAT	3	9	242606	242614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020568	AC	4	8	242661	242668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_020568	ATT	2	6	242733	242738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020568	ACC	2	6	242820	242825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_020568	T	6	6	242841	242846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020568	CA	3	6	242864	242869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_020568	TAA	2	6	242877	242882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020568	TTCA	2	8	242920	242927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_020568	CT	3	6	244161	244166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_020568	TCC	2	6	246448	246453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_020568	GATAA	2	10	246466	246475	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020568	ATTA	2	8	246514	246521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020568	T	6	6	246585	246590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020568	ATT	2	6	246615	246620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020568	ACA	2	6	247895	247900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_020568	ATAAC	2	10	251113	251122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_020568	ATA	2	6	251160	251165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020568	TGAAT	2	10	251224	251233	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020568	TA	3	6	251248	251253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020568	ATTAA	2	10	251365	251374	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020568	TAT	2	6	251383	251388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020568	GGAATA	2	12	252710	252721	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020568	A	6	6	252734	252739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020568	TA	3	6	252775	252780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020568	TAA	2	6	252808	252813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020568	TCA	2	6	252829	252834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_020568	CAA	2	6	254468	254473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_020568	TGT	2	6	254509	254514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_020568	ATT	2	6	254527	254532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020568	AATT	2	8	254540	254547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020568	GTA	2	6	254548	254553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020568	AAAT	2	8	254568	254575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020568	AT	3	6	254620	254625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020568	CTG	2	6	254643	254648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_020568	TAC	2	6	254652	254657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_020568	TGC	2	6	254682	254687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_020568	TAT	2	6	254942	254947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020568	TGT	2	6	255032	255037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020568	GAC	2	6	255043	255048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_020568	ATC	2	6	255069	255074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1095	NC_020568	AAAGT	2	10	255109	255118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020568	ATTT	2	8	255143	255150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020568	AATTA	2	10	255222	255231	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020568	AAT	2	6	255243	255248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020568	CTC	2	6	256490	256495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_020568	ATT	2	6	256515	256520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020568	CTA	2	6	256521	256526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_020568	AATT	2	8	256542	256549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020568	ATAA	2	8	256563	256570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020568	T	6	6	256605	256610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020568	CGA	2	6	256656	256661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_020568	GC	3	6	256664	256669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_020568	ATTT	2	8	256670	256677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020568	A	6	6	256687	256692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020568	TTG	2	6	256695	256700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020568	A	6	6	256710	256715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020568	ATA	2	6	256725	256730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020568	AAT	2	6	256747	256752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020568	TAAAA	2	10	256822	256831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020568	AAAT	2	8	256836	256843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020568	AAAT	2	8	256894	256901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020568	AGC	2	6	256989	256994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_020568	A	6	6	258058	258063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020568	GTT	2	6	258131	258136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020568	AAATT	2	10	258138	258147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020568	GAT	2	6	258183	258188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020568	ATG	2	6	258226	258231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020568	CTT	2	6	258279	258284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_020568	ATT	2	6	259875	259880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020568	AT	4	8	259912	259919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020568	TTG	2	6	259990	259995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020568	AGGT	2	8	260050	260057	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020568	CAC	2	6	260162	260167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_020568	ATAA	2	8	260168	260175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020568	AAC	2	6	260195	260200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_020568	AT	3	6	260214	260219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020568	TTAA	2	8	261164	261171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020568	ATGT	2	8	261267	261274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020568	A	6	6	261287	261292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020568	AT	3	6	261307	261312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020568	A	6	6	261354	261359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020568	TGT	2	6	261377	261382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_020568	GT	3	6	261432	261437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1406	NC_020568	TAT	2	6	321805	321810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1412	NC_020568	AAT	2	6	322106	322111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_020568	AGC	2	6	322166	322171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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