MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_020568	AAAT	2	8	1415829	1415836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_020568	TGC	2	6	1415842	1415847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_020568	AGA	2	6	1415893	1415898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_020568	AGC	2	6	1415901	1415906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_020568	TATACA	2	12	1415909	1415920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8006	NC_020568	TAT	2	6	1416015	1416020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_020568	TAT	2	6	1416129	1416134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_020568	GA	3	6	1416151	1416156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_020568	ACAAA	2	10	1416157	1416166	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8010	NC_020568	ATTA	2	8	1416202	1416209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_020568	AATA	2	8	1416215	1416222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_020568	TGATG	2	10	1416237	1416246	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_020568	CTC	2	6	1416257	1416262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_020568	TTG	2	6	1448178	1448183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_020568	TGT	2	6	1448193	1448198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_020568	CATTC	2	10	1448243	1448252	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8017	NC_020568	ATTT	2	8	1448343	1448350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_020568	ATA	2	6	1448363	1448368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_020568	AT	3	6	1448376	1448381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_020568	TAA	2	6	1448412	1448417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_020568	TAAA	2	8	1448421	1448428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_020568	TAA	2	6	1448443	1448448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_020568	A	6	6	1448447	1448452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_020568	AAT	2	6	1448474	1448479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_020568	ATT	2	6	1452581	1452586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_020568	ATT	2	6	1453745	1453750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_020568	ATTA	3	12	1453781	1453792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_020568	TAA	2	6	1453816	1453821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_020568	AT	3	6	1453829	1453834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_020568	TATTCT	2	12	1453835	1453846	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8031	NC_020568	TATT	2	8	1453874	1453881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_020568	TAAT	2	8	1453932	1453939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_020568	T	6	6	1453948	1453953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_020568	TAA	2	6	1453958	1453963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_020568	ATTT	2	8	1453997	1454004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_020568	TATC	2	8	1454049	1454056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8037	NC_020568	TTAT	2	8	1454067	1454074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_020568	CTT	2	6	1455073	1455078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_020568	GTTC	2	8	1458538	1458545	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8040	NC_020568	TGCT	2	8	1458555	1458562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8041	NC_020568	TAT	2	6	1458628	1458633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_020568	GCT	2	6	1458651	1458656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_020568	AAT	2	6	1458671	1458676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_020568	TTC	2	6	1458682	1458687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_020568	ATC	2	6	1458729	1458734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_020568	AAAT	2	8	1458751	1458758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_020568	CA	3	6	1458775	1458780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_020568	GGGA	2	8	1458814	1458821	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_020568	TC	3	6	1460211	1460216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8050	NC_020568	TAA	2	6	1460239	1460244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_020568	T	6	6	1460284	1460289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_020568	A	6	6	1460302	1460307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_020568	AAG	2	6	1460323	1460328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_020568	CTT	2	6	1460338	1460343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_020568	T	6	6	1460364	1460369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_020568	TCA	2	6	1460397	1460402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_020568	TCA	2	6	1460420	1460425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_020568	CAT	2	6	1460460	1460465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_020568	T	6	6	1460494	1460499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_020568	T	6	6	1460613	1460618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_020568	A	6	6	1460625	1460630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_020568	AAC	2	6	1460659	1460664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_020568	T	7	7	1460691	1460697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_020568	CTC	2	6	1460711	1460716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8065	NC_020568	TAT	2	6	1460734	1460739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_020568	ATT	2	6	1460752	1460757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_020568	T	6	6	1461976	1461981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_020568	CAA	2	6	1461991	1461996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_020568	A	6	6	1462096	1462101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_020568	CAT	2	6	1462108	1462113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8072	NC_020568	TGTTC	2	10	1462153	1462162	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8073	NC_020568	TCA	2	6	1462171	1462176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_020568	GT	3	6	1462240	1462245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_020568	TCA	2	6	1462439	1462444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_020568	ATC	2	6	1462460	1462465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_020568	TG	3	6	1462472	1462477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_020568	TA	3	6	1462494	1462499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_020568	ATT	2	6	1462546	1462551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_020568	ATT	2	6	1462582	1462587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_020568	ATT	2	6	1462637	1462642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_020568	TGT	3	9	1462655	1462663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_020568	ATT	2	6	1462664	1462669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_020568	GAA	2	6	1462671	1462676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_020568	TTC	2	6	1462724	1462729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8089	NC_020568	T	6	6	1462795	1462800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_020568	T	6	6	1462927	1462932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_020568	AT	3	6	1463532	1463537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_020568	TTG	3	9	1463767	1463775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8101	NC_020568	T	6	6	1463864	1463869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_020568	TA	3	6	1463911	1463916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_020568	T	6	6	1463931	1463936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_020568	TA	3	6	1463979	1463984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_020568	TGT	2	6	1464006	1464011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_020568	TAA	2	6	1464036	1464041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_020568	CTG	2	6	1464065	1464070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8111	NC_020568	AATT	2	8	1464189	1464196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_020568	TG	3	6	1464202	1464207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_020568	TAT	2	6	1464234	1464239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_020568	ATT	2	6	1464243	1464248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_020568	TCT	2	6	1465018	1465023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_020568	TAA	2	6	1465041	1465046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_020568	TGG	2	6	1465047	1465052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_020568	A	6	6	1465065	1465070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_020568	T	7	7	1467236	1467242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_020568	TTC	2	6	1467246	1467251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_020568	TGG	2	6	1467260	1467265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_020568	T	7	7	1467284	1467290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_020568	TAG	2	6	1467318	1467323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8126	NC_020568	ATG	2	6	1467626	1467631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_020568	GACAC	2	10	1467666	1467675	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8128	NC_020568	TG	3	6	1467694	1467699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_020568	CATT	2	8	1467787	1467794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8130	NC_020568	TCTT	2	8	1467872	1467879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8131	NC_020568	AAT	2	6	1467965	1467970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8401	NC_020568	AAT	2	6	1528609	1528614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8402	NC_020568	ATT	2	6	1528645	1528650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8403	NC_020568	GTAA	2	8	1528674	1528681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8404	NC_020568	GATA	2	8	1528715	1528722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8442	NC_020568	ATT	2	6	1533746	1533751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8482	NC_020568	T	7	7	1543730	1543736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8483	NC_020568	ATC	3	9	1543772	1543780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8484	NC_020568	TTGTT	2	10	1543787	1543796	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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