MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI6T6 complete sequence

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020567	ACAT	2	8	273	280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020567	AAGA	2	8	507	514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020567	CGTA	2	8	3200	3207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020567	GTAA	2	8	3290	3297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020567	TCTT	2	8	3423	3430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020567	TTCA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020567	ATTT	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020567	GCAA	2	8	3501	3508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020567	TGAA	2	8	3514	3521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020567	AAGT	2	8	3530	3537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020567	AACG	2	8	3562	3569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020567	TAAA	2	8	3681	3688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020567	AAAT	2	8	3874	3881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020567	TATT	2	8	3977	3984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020567	ATTT	2	8	6893	6900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020567	AAGA	2	8	7935	7942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020567	TATT	2	8	8023	8030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020567	ATTG	2	8	8658	8665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020567	TAAC	2	8	8955	8962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020567	AATA	2	8	9348	9355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020567	CATT	2	8	9430	9437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020567	AACG	2	8	9507	9514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020567	AAAC	2	8	12665	12672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020567	TAAT	2	8	12918	12925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020567	CCAA	2	8	17327	17334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020567	TTTA	2	8	17783	17790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020567	TAGA	2	8	17861	17868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020567	TATT	2	8	18125	18132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020567	GTAT	2	8	18548	18555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020567	TTAG	2	8	18707	18714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020567	TGAA	2	8	18851	18858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020567	TTAC	2	8	18973	18980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020567	TTTA	2	8	19113	19120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020567	CTAG	2	8	19906	19913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020567	TAAA	2	8	20277	20284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020567	ATAA	2	8	20319	20326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020567	AAAT	2	8	20495	20502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020567	CAAA	2	8	20517	20524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020567	TACA	2	8	20811	20818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020567	TCGG	2	8	21678	21685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020567	GTGG	2	8	22728	22735	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020567	ATTT	2	8	22748	22755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020567	ATTT	2	8	22763	22770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020567	AGGT	2	8	23054	23061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020567	TGTA	2	8	23380	23387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020567	TATT	2	8	25043	25050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020567	TATT	2	8	26991	26998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020567	TAGA	2	8	27024	27031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020567	CATC	2	8	29853	29860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020567	TACA	2	8	29906	29913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020567	ATTT	2	8	31175	31182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020567	TTAT	2	8	31694	31701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.