MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020566	TATAA	2	10	554717	554726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_020566	TTATAA	2	12	554772	554783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_020566	GTTATA	2	12	555443	555454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_020566	GT	3	6	555480	555485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_020566	TTAA	2	8	555508	555515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_020566	AATA	2	8	555517	555524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_020566	TCA	2	6	555542	555547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_020566	TTA	2	6	555576	555581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_020566	TGA	2	6	559238	559243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_020566	TAAA	2	8	559269	559276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_020566	ATCA	2	8	559282	559289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_020566	AGG	2	6	559314	559319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_020566	TTGA	2	8	559328	559335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_020566	AAT	2	6	559340	559345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_020566	TA	3	6	562956	562961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3017	NC_020566	GGA	2	6	563075	563080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_020566	ATT	2	6	563084	563089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_020566	AACA	2	8	563115	563122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_020566	AAAG	2	8	563162	563169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_020566	ATT	2	6	563187	563192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_020566	ATCA	2	8	563238	563245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_020566	T	6	6	563264	563269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_020566	TAG	2	6	563323	563328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_020566	TACT	2	8	563359	563366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_020566	TTTA	2	8	563371	563378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_020566	ACC	2	6	563391	563396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_020566	TG	3	6	563401	563406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_020566	AG	3	6	563421	563426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_020566	A	6	6	563488	563493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_020566	TAAA	2	8	563510	563517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_020566	A	6	6	563536	563541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_020566	CAC	2	6	563558	563563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_020566	GTG	2	6	563570	563575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3039	NC_020566	GACG	2	8	563800	563807	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_020566	CTTAAA	2	12	563875	563886	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3041	NC_020566	AAGG	2	8	563898	563905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_020566	GT	3	6	564410	564415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_020566	CTAG	2	8	566609	566616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_020566	ATC	2	6	566654	566659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3047	NC_020566	ATG	2	6	566739	566744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3049	NC_020566	ATT	2	6	566777	566782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_020566	GA	3	6	566797	566802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_020566	TA	3	6	568014	568019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_020566	AGA	2	6	568023	568028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_020566	T	7	7	568047	568053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_020566	AGA	2	6	568086	568091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_020566	AAT	2	6	568094	568099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_020566	TGA	2	6	568100	568105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_020566	GACT	2	8	568108	568115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_020566	ATA	2	6	568133	568138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_020566	TAAA	2	8	568144	568151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_020566	TTG	2	6	568153	568158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_020566	T	6	6	568198	568203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_020566	AATT	2	8	568261	568268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_020566	AAT	2	6	569471	569476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_020566	ATGA	2	8	569539	569546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_020566	TA	3	6	569614	569619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_020566	ATTT	3	12	570811	570822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3068	NC_020566	GTTTA	2	10	570860	570869	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_020566	T	6	6	570955	570960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_020566	ATT	2	6	570979	570984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_020566	GT	3	6	571023	571028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_020566	TAG	2	6	571044	571049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_020566	TA	3	6	571054	571059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_020566	ATTA	2	8	571964	571971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_020566	GAG	2	6	571972	571977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_020566	ACATGT	2	12	573849	573860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3083	NC_020566	TAT	2	6	573885	573890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_020566	ATT	2	6	573892	573897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_020566	TA	3	6	573938	573943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_020566	T	6	6	575066	575071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_020566	TTAA	2	8	575163	575170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_020566	ATT	2	6	575248	575253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_020566	GAAGC	2	10	576410	576419	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3094	NC_020566	TAA	2	6	576424	576429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_020566	TTA	3	9	576475	576483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_020566	TAC	2	6	576512	576517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3098	NC_020566	AAAT	3	12	576566	576577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_020566	AAGA	2	8	577279	577286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3102	NC_020566	AT	4	8	578742	578749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_020566	GAA	2	6	578768	578773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_020566	A	6	6	578777	578782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_020566	ATC	2	6	578816	578821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_020566	GAT	2	6	578828	578833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3108	NC_020566	GTC	2	6	579023	579028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_020566	GAT	2	6	579038	579043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_020566	GGT	2	6	579050	579055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_020566	CAA	2	6	579083	579088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_020566	ATC	2	6	579099	579104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_020566	TTG	2	6	579111	579116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_020566	AAG	2	6	579132	579137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_020566	ATT	2	6	579148	579153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_020566	AAC	2	6	579154	579159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_020566	T	6	6	579161	579166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_020566	CCA	2	6	579192	579197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_020566	TA	3	6	579296	579301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_020566	A	8	8	580220	580227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_020566	A	6	6	580811	580816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_020566	T	7	7	580889	580895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_020566	TGT	2	6	580931	580936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_020566	TTA	2	6	580945	580950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_020566	AG	3	6	580997	581002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_020566	ATAA	2	8	581017	581024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_020566	A	7	7	581041	581047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_020566	AAT	2	6	581122	581127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_020566	TA	3	6	581179	581184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_020566	ATATT	2	10	581191	581200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_020566	TAT	2	6	581227	581232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_020566	TTAAC	2	10	584103	584112	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3133	NC_020566	T	6	6	584131	584136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_020566	A	6	6	584164	584169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_020566	AATTT	2	10	584188	584197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_020566	ATA	2	6	584257	584262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_020566	T	6	6	584266	584271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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