MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020566	AT	3	6	485245	485250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_020566	AGC	2	6	485304	485309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_020566	CAT	2	6	485310	485315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_020566	ACC	2	6	485630	485635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_020566	G	6	6	485655	485660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020566	GATTG	2	10	485686	485695	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020566	TAGA	2	8	485815	485822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020566	GAGC	2	8	485879	485886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2509	NC_020566	AGA	2	6	485961	485966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_020566	CGG	2	6	486119	486124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_020566	GA	3	6	486217	486222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_020566	TAGG	2	8	486335	486342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_020566	TGG	2	6	486381	486386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_020566	TAC	2	6	486389	486394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_020566	CAC	2	6	486421	486426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_020566	GTG	2	6	486432	486437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_020566	CCT	2	6	486476	486481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_020566	TCAT	2	8	486528	486535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2519	NC_020566	GGT	2	6	486612	486617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_020566	CGT	2	6	486807	486812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_020566	CGT	2	6	486833	486838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_020566	GAG	2	6	486856	486861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_020566	TG	3	6	486942	486947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_020566	C	6	6	486983	486988	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2525	NC_020566	GAT	2	6	487031	487036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020566	ATCG	2	8	487092	487099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_020566	AAAT	2	8	487112	487119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_020566	TACT	2	8	487143	487150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2529	NC_020566	AGG	2	6	487201	487206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_020566	A	6	6	487300	487305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_020566	T	8	8	487342	487349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_020566	AAAG	2	8	487381	487388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_020566	TAG	2	6	487449	487454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_020566	AAGC	2	8	487492	487499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2535	NC_020566	A	6	6	487576	487581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_020566	T	7	7	487618	487624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_020566	TAG	2	6	487725	487730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_020566	AAGC	2	8	487768	487775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2539	NC_020566	AATG	2	8	487858	487865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_020566	TAA	2	6	487899	487904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_020566	ATT	2	6	487917	487922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_020566	TAT	2	6	487963	487968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_020566	CAG	2	6	487979	487984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_020566	ATC	2	6	488006	488011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_020566	CTG	2	6	488015	488020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_020566	ATTA	2	8	488070	488077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_020566	AAG	2	6	488124	488129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_020566	TA	3	6	488136	488141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_020566	TAAA	2	8	488179	488186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_020566	AGA	2	6	490167	490172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020566	AAAATG	2	12	490181	490192	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_020566	CAAGAT	2	12	490208	490219	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2553	NC_020566	CAA	2	6	490263	490268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_020566	CAA	2	6	490275	490280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_020566	ACA	2	6	490307	490312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_020566	ATG	2	6	490329	490334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020566	AGTTGA	2	12	490447	490458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020566	ATC	2	6	490526	490531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_020566	TAA	2	6	490558	490563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_020566	TTA	2	6	490565	490570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_020566	GATTT	2	10	490614	490623	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_020566	AAT	2	6	490637	490642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020566	TTG	2	6	490661	490666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_020566	TA	3	6	490697	490702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_020566	ATT	2	6	492464	492469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_020566	A	6	6	492496	492501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_020566	TCAA	2	8	492523	492530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2568	NC_020566	TAG	2	6	492574	492579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_020566	ATG	2	6	492634	492639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_020566	ACT	2	6	492645	492650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_020566	ATT	2	6	492758	492763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_020566	TCTGT	2	10	492791	492800	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2573	NC_020566	TTATAA	2	12	492842	492853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_020566	TTA	3	9	492951	492959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_020566	ATATA	2	10	493032	493041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_020566	TA	3	6	493829	493834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_020566	TA	3	6	493859	493864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_020566	ATTA	2	8	494043	494050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_020566	ATG	2	6	494997	495002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_020566	A	7	7	495014	495020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_020566	TGA	2	6	495021	495026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_020566	T	6	6	495035	495040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_020566	AAAT	2	8	495047	495054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_020566	TAA	2	6	495065	495070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_020566	ATT	2	6	495151	495156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_020566	GAG	2	6	495173	495178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_020566	GA	3	6	497180	497185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020566	TTCT	2	8	498031	498038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2589	NC_020566	T	6	6	498042	498047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_020566	TACG	2	8	498073	498080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2591	NC_020566	CAAAG	2	10	499580	499589	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2592	NC_020566	AAATTT	2	12	499601	499612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_020566	TAT	2	6	499640	499645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2595	NC_020566	TTG	2	6	499810	499815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_020566	GA	3	6	499842	499847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_020566	TACA	2	8	499856	499863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_020566	ATC	2	6	499909	499914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2600	NC_020566	ATT	2	6	499991	499996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_020566	TTTA	2	8	500027	500034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_020566	T	6	6	500144	500149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_020566	A	7	7	500153	500159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_020566	A	6	6	500164	500169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_020566	ATC	2	6	500209	500214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_020566	TAT	2	6	501943	501948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_020566	ACA	2	6	501962	501967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_020566	ATGGT	2	10	502014	502023	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_020566	GTT	2	6	502118	502123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_020566	GAA	2	6	502127	502132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_020566	ATGA	2	8	502184	502191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_020566	A	6	6	502197	502202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_020566	AGTA	2	8	502303	502310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_020566	TAAA	2	8	502357	502364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_020566	AG	3	6	502367	502372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_020566	AT	3	6	502373	502378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_020566	G	6	6	502385	502390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_020566	CATTA	2	10	502464	502473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2619	NC_020566	TGA	2	6	502625	502630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_020566	ATG	2	6	502637	502642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_020566	AGT	2	6	502653	502658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_020566	AGA	2	6	502680	502685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_020566	AGA	2	6	502689	502694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_020566	TTGAT	2	10	502741	502750	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_020566	T	7	7	502783	502789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_020566	T	7	7	502804	502810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_020566	T	7	7	502825	502831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_020566	TAA	2	6	502848	502853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_020566	AT	3	6	502854	502859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_020566	ATG	2	6	502873	502878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_020566	ATT	2	6	502887	502892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_020566	ATG	2	6	502922	502927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_020566	A	6	6	502947	502952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_020566	GTT	2	6	502953	502958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_020566	TAA	2	6	503025	503030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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