MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020566	TGA	2	6	332115	332120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020566	TAAAT	2	10	333360	333369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020566	CAT	2	6	333413	333418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_020566	ATA	2	6	335929	335934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020566	AAG	2	6	336928	336933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020566	GA	3	6	336967	336972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020566	TGT	2	6	336980	336985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020566	CA	3	6	336992	336997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_020566	CAAC	2	8	337031	337038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_020566	A	6	6	337096	337101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020566	A	6	6	337120	337125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020566	GAT	2	6	337154	337159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020566	TAC	2	6	337188	337193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_020566	TAT	2	6	338026	338031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020566	AT	3	6	338030	338035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020566	AT	3	6	338086	338091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020566	A	6	6	338110	338115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020566	A	7	7	338817	338823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020566	CAT	2	6	338833	338838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_020566	TGAA	2	8	338870	338877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020566	TGTT	2	8	338899	338906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020566	ATTTT	2	10	338917	338926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020566	ATT	2	6	340371	340376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020566	TA	4	8	340402	340409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020566	TAA	2	6	340428	340433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020566	TGT	3	9	340449	340457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020566	ATT	2	6	340492	340497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020566	TAT	2	6	340543	340548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020566	TTA	2	6	340556	340561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020566	A	6	6	340579	340584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020566	AT	3	6	340587	340592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020566	GTT	2	6	340615	340620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020566	A	7	7	340642	340648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020566	TCT	2	6	342748	342753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_020566	TAA	2	6	342903	342908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020566	AAT	2	6	342917	342922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020566	ATG	2	6	342948	342953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020566	T	6	6	342964	342969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_020566	GAAT	2	8	345132	345139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020566	ATG	2	6	345145	345150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020566	ATAGA	2	10	345161	345170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020566	AATG	2	8	345205	345212	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020566	ATATGA	2	12	345231	345242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020566	TGACA	2	10	345353	345362	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1545	NC_020566	AGA	2	6	346397	346402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020566	AAGAT	2	10	346412	346421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020566	ATT	2	6	346436	346441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020566	GAT	2	6	346498	346503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020566	GAT	2	6	346555	346560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020566	ATT	2	6	346624	346629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020566	GAA	3	9	346648	346656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020566	AGA	2	6	346683	346688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020566	GTT	2	6	346695	346700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020566	GAT	2	6	346708	346713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020566	AAG	2	6	346721	346726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020566	AT	3	6	348497	348502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020566	CAT	2	6	349609	349614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_020566	TTA	2	6	349632	349637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020566	TTCATT	2	12	349686	349697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1560	NC_020566	TA	3	6	349698	349703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020566	CTA	2	6	349722	349727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_020566	TA	3	6	349737	349742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020566	TAAG	2	8	350846	350853	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020566	TA	3	6	350904	350909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020566	CCT	2	6	352277	352282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_020566	GTT	2	6	352297	352302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020566	TGT	2	6	352323	352328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020566	CTT	2	6	352498	352503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_020566	ACT	2	6	352526	352531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_020566	TAC	2	6	352550	352555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_020566	T	6	6	352609	352614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020566	GA	3	6	352719	352724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020566	TCA	2	6	352738	352743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_020566	TGCAAT	2	12	352818	352829	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1575	NC_020566	ATCA	2	8	352872	352879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_020566	AAT	2	6	352902	352907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020566	GTA	2	6	352916	352921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020566	ATG	2	6	352978	352983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020566	GTT	2	6	352987	352992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020566	TCC	2	6	354980	354985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_020566	TTGTAA	2	12	354989	355000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020566	AAAT	2	8	355101	355108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020566	TTAG	2	8	355149	355156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020566	TGG	2	6	355170	355175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020566	TATT	2	8	355202	355209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020566	CAA	2	6	355313	355318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1589	NC_020566	GACT	2	8	355458	355465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_020566	TGA	2	6	355507	355512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020566	GAA	3	9	355544	355552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020566	ATT	2	6	355680	355685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020566	TCGG	2	8	357096	357103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_020566	A	7	7	357118	357124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020566	AT	3	6	357128	357133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_020566	A	6	6	357146	357151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_020566	AT	3	6	357195	357200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_020566	GAA	2	6	357208	357213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020566	GAA	2	6	357235	357240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020566	TGA	2	6	357426	357431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020566	T	6	6	357447	357452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020566	ATT	2	6	357465	357470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020566	GTG	2	6	357537	357542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020566	CAG	2	6	357560	357565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_020566	T	7	7	357594	357600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020566	TAA	2	6	357607	357612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020566	AT	3	6	357644	357649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020566	GATAA	2	10	357658	357667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020566	T	6	6	357681	357686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020566	TCC	2	6	359055	359060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_020566	A	6	6	359183	359188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020566	ATT	2	6	359221	359226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020566	TGA	2	6	363929	363934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020566	TTTA	2	8	363956	363963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020566	GTT	2	6	363981	363986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020566	TAT	2	6	363992	363997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020566	ATT	2	6	364024	364029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020566	GGA	2	6	364051	364056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020566	ATC	2	6	364066	364071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_020566	TAT	2	6	364087	364092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020566	ATA	2	6	364144	364149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020566	T	7	7	367967	367973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020566	TTG	2	6	368001	368006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_020566	TGGT	2	8	368026	368033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020566	TGC	2	6	368149	368154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1627	NC_020566	ATG	2	6	368802	368807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1630	NC_020566	TGT	2	6	368919	368924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020566	GT	3	6	368941	368946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020566	TCT	2	6	368967	368972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_020566	T	6	6	369029	369034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_020566	AAT	2	6	369044	369049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_020566	TTG	2	6	369079	369084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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