MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020566	A	6	6	219932	219937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020566	TG	3	6	219950	219955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020566	T	6	6	219981	219986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020566	GTT	2	6	220052	220057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020566	A	7	7	220084	220090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020566	ATT	2	6	220092	220097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020566	TAA	2	6	220192	220197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020566	AT	3	6	220205	220210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020566	AGG	2	6	224845	224850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020566	CAT	2	6	225936	225941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_020566	AGG	2	6	225948	225953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020566	ATT	2	6	227003	227008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020566	AT	3	6	227009	227014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020566	AAG	2	6	227037	227042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020566	TGG	2	6	228065	228070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020566	TGAA	2	8	228077	228084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020566	TTGT	2	8	228136	228143	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020566	AAG	2	6	228145	228150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020566	TA	3	6	228159	228164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020566	TA	3	6	228221	228226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020566	ATA	2	6	228251	228256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020566	A	7	7	228256	228262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020566	TGT	2	6	228266	228271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020566	AATAT	2	10	228311	228320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020566	TGA	2	6	228363	228368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020566	TATT	2	8	228968	228975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020566	TAA	2	6	229035	229040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020566	AT	3	6	229073	229078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020566	AT	3	6	230597	230602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020566	CT	3	6	230748	230753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_020566	GAAA	2	8	230766	230773	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020566	TGT	2	6	231468	231473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020566	TATTG	2	10	231515	231524	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020566	AAT	2	6	231569	231574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020566	TCA	3	9	231579	231587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_020566	AAT	2	6	234155	234160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020566	TGT	2	6	234236	234241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020566	TTTG	2	8	234256	234263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020566	TATTT	2	10	234302	234311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020566	TA	3	6	234320	234325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020566	AT	3	6	234398	234403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020566	CAA	2	6	234441	234446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_020566	T	6	6	234450	234455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020566	AT	3	6	234464	234469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020566	TGT	2	6	234517	234522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020566	ACAT	2	8	234582	234589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_020566	TGA	2	6	234591	234596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020566	A	7	7	234618	234624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020566	CAA	2	6	234628	234633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_020566	AAAG	2	8	237753	237760	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020566	CTT	2	6	237793	237798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_020566	GTA	2	6	237829	237834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020566	ATC	2	6	237934	237939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_020566	TTA	2	6	237947	237952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020566	ATATGA	2	12	237965	237976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020566	GAT	2	6	239850	239855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020566	ATT	2	6	239981	239986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020566	AATTG	2	10	240015	240024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020566	ATTT	2	8	240155	240162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020566	TGCT	2	8	240242	240249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_020566	TGT	2	6	240321	240326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020566	A	7	7	240360	240366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020566	AT	3	6	240441	240446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020566	GGA	2	6	240502	240507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020566	A	6	6	240511	240516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020566	A	7	7	242166	242172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_020566	AAAC	2	8	242181	242188	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_020566	AAC	2	6	242200	242205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_020566	AAG	2	6	242249	242254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020566	AAC	2	6	242281	242286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_020566	A	7	7	242328	242334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020566	AAAC	2	8	242343	242350	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_020566	AAC	2	6	242362	242367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_020566	AAAT	2	8	242408	242415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020566	ACA	2	6	242467	242472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_020566	ATG	2	6	242488	242493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020566	ATT	2	6	242540	242545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020566	AACAT	2	10	242563	242572	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1079	NC_020566	AT	3	6	242579	242584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_020566	AAT	3	9	242640	242648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020566	AC	4	8	242695	242702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_020566	ATT	2	6	242767	242772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020566	ACC	2	6	242854	242859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_020566	T	6	6	242875	242880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020566	CA	3	6	242898	242903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1087	NC_020566	TTCA	2	8	242954	242961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_020566	CT	3	6	244195	244200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_020566	TCC	2	6	246482	246487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_020566	GATAA	2	10	246500	246509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020566	ATTA	2	8	246548	246555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020566	T	6	6	246619	246624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020566	ATT	2	6	246649	246654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020566	ACA	2	6	247929	247934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_020566	ATAAC	2	10	251147	251156	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_020566	ATA	2	6	251194	251199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020566	TGAAT	2	10	251258	251267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020566	TA	3	6	251282	251287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020566	ATTAA	2	10	251399	251408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020566	TAT	2	6	251417	251422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020566	GGAATA	2	12	252744	252755	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020566	A	6	6	252768	252773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020566	TA	3	6	252809	252814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020566	TAA	2	6	252842	252847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020566	TCA	2	6	252863	252868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_020566	CT	3	6	254475	254480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_020566	CAA	2	6	254502	254507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_020566	TGT	2	6	254543	254548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020566	ATT	2	6	254561	254566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020566	AATT	2	8	254574	254581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020566	GTA	2	6	254582	254587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020566	AAAT	2	8	254602	254609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020566	AT	3	6	254654	254659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020566	CTG	2	6	254677	254682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_020566	TAC	2	6	254686	254691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_020566	TGC	2	6	254716	254721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_020566	AAT	2	6	254901	254906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020566	TAT	2	6	254976	254981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020566	TGT	2	6	255066	255071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020566	GAC	2	6	255077	255082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_020566	AAAT	2	8	255084	255091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020566	ATC	2	6	255103	255108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_020566	A	6	6	255127	255132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020566	AAAGT	2	10	255143	255152	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020566	ATTT	2	8	255177	255184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020566	AATTA	2	10	255256	255265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020566	AAT	2	6	255277	255282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020566	CTC	2	6	256524	256529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_020566	ATT	2	6	256549	256554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020566	CTA	2	6	256555	256560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_020566	AATT	2	8	256576	256583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020566	ATAA	2	8	256597	256604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020566	T	6	6	256639	256644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020566	CGA	2	6	256690	256695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_020566	GC	3	6	256698	256703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_020566	ATTT	2	8	256704	256711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020566	A	6	6	256721	256726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_020566	TTG	2	6	256729	256734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_020566	A	6	6	256744	256749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_020566	AT	3	6	320923	320928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_020566	AGA	2	6	320976	320981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1417	NC_020566	TTA	2	6	321017	321022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_020566	CAT	2	6	321040	321045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_020566	T	6	6	321155	321160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_020566	TA	3	6	321191	321196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_020566	T	7	7	321208	321214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_020566	TAA	2	6	321603	321608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_020566	ATT	2	6	322290	322295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_020566	TAA	2	6	322369	322374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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