MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020564	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020564	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020564	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020564	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020564	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020564	AAAAAT	2	12	37312	37323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020564	AATGAA	2	12	38548	38559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020564	GCTAAA	2	12	41852	41863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020564	ATTTGG	2	12	45097	45108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020564	ATTTAT	2	12	66055	66066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020564	AACAAA	2	12	79635	79646	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020564	AATATA	2	12	88935	88946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020564	TTAAAT	2	12	99927	99938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020564	TAACAA	2	12	101284	101295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020564	AATGTA	2	12	124823	124834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020564	CTGTAA	2	12	126644	126655	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020564	GTTTTT	2	12	137850	137861	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020564	TGTAAT	2	12	160181	160192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020564	TCCCAC	2	12	164393	164404	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020564	TTTATA	2	12	186247	186258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020564	ATTAAT	2	12	186270	186281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020564	TTTTTA	2	12	207098	207109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020564	GATTTT	2	12	217251	217262	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020564	ATATGA	2	12	237966	237977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020564	GGAATA	2	12	252827	252838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020564	TGGTAT	2	12	264407	264418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020564	ATATAG	2	12	274054	274065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020564	ATTTTC	2	12	279371	279382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020564	ATAATT	2	12	280320	280331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020564	AACGAT	2	12	287690	287701	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020564	TAACTT	2	12	296065	296076	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020564	TAATTA	2	12	306788	306799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020564	ATATGA	2	12	345319	345330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020564	TTCATT	2	12	349774	349785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020564	TGCAAT	2	12	352906	352917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020564	TTGTAA	2	12	355077	355088	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020564	AAGTAC	2	12	369368	369379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020564	GAAGAC	2	12	387458	387469	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020564	AATGTA	2	12	393078	393089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020564	AATTTG	2	12	393185	393196	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020564	TAAAGA	2	12	395173	395184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020564	ATGAAA	2	12	417372	417383	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020564	TGAAAT	2	12	418094	418105	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020564	TTTAAT	2	12	423098	423109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020564	TGTATA	2	12	432330	432341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020564	TTTTTA	2	12	446970	446981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020564	TTAACA	2	12	462804	462815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020564	ACGTTG	2	12	472767	472778	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020564	AAAATA	2	12	473489	473500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020564	CAAGAA	2	12	480547	480558	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020564	AAAATG	2	12	490280	490291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020564	CAAGAT	2	12	490307	490318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020564	AGTTGA	2	12	490546	490557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020564	TTATAA	2	12	492941	492952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020564	AAATTT	2	12	499700	499711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020564	TGAAAG	2	12	523081	523092	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020564	CATTTA	2	12	552411	552422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020564	CAGTAG	2	12	554464	554475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020564	TTATAA	2	12	554826	554837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020564	GTTATA	2	12	555497	555508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020564	TTGTAC	2	12	563768	563779	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020564	CTTAAA	2	12	563929	563940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020564	ACATGT	2	12	573903	573914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020564	ATTGCG	2	12	604733	604744	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020564	AATGAT	2	12	608651	608662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020564	TAGATG	2	12	608724	608735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020564	CATGAC	2	12	610674	610685	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020564	TAAAAT	2	12	624044	624055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020564	TTATTT	2	12	630162	630173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020564	GAAAAA	2	12	634487	634498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020564	CATTAT	2	12	646240	646251	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020564	TACTTG	2	12	650641	650652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020564	CATCAA	2	12	658291	658302	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020564	TAATTT	2	12	662531	662542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020564	ATAAAA	2	12	663438	663449	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020564	TGAATA	2	12	679007	679018	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020564	ATTTAT	2	12	698356	698367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020564	AATTGA	2	12	698435	698446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020564	TTAAAA	2	12	705016	705027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020564	GAAAAA	2	12	705206	705217	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020564	AAAGAT	2	12	705320	705331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020564	TAGTTA	2	12	709451	709462	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020564	TTTTTA	2	12	727658	727669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020564	ATATCA	2	12	734409	734420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020564	GAATTA	2	12	735703	735714	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020564	TGAAAA	2	12	735901	735912	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020564	TTAATT	2	12	790059	790070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020564	ACAAAA	2	12	804817	804828	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020564	AAACAA	2	12	817324	817335	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020564	TTTATT	2	12	822491	822502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020564	TAAAAA	2	12	824183	824194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020564	TATCAA	2	12	832161	832172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020564	TTTTGA	2	12	835981	835992	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020564	CTGTTT	2	12	836759	836770	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020564	TCATTT	2	12	841973	841984	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020564	TAAAAA	2	12	845061	845072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020564	AGAAAA	2	12	849099	849110	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020564	AGTGAA	2	12	853539	853550	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020564	ATAAAG	2	12	853922	853933	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020564	AAATTA	2	12	858696	858707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020564	AAGCAC	2	12	867429	867440	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020564	TAAAAT	2	12	876797	876808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020564	TGTAAT	2	12	881558	881569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020564	TTACAT	2	12	919551	919562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020564	ATTTAG	2	12	932839	932850	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020564	ATTCAA	2	12	933004	933015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020564	TTTAAT	2	12	949324	949335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020564	TTGTTT	2	12	955413	955424	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020564	AAATTA	2	12	956458	956469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020564	ACAATA	2	12	966725	966736	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020564	AACGGA	2	12	981248	981259	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020564	AAAAGC	2	12	985846	985857	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_020564	CACTTG	2	12	995230	995241	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020564	CTAAAT	2	12	1000243	1000254	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020564	CATTTA	2	12	1009396	1009407	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020564	ATCATA	2	12	1011291	1011302	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020564	TCAAAA	2	12	1017799	1017810	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020564	ATTGCA	2	12	1018928	1018939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020564	TTTTCT	2	12	1031658	1031669	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020564	TAGTAT	2	12	1060666	1060677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020564	TTTATA	2	12	1067816	1067827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020564	ATTTTA	2	12	1074712	1074723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020564	TGGATA	2	12	1079657	1079668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020564	ATTTTT	2	12	1091766	1091777	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020564	ATAATT	2	12	1092563	1092574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020564	TCATTA	2	12	1097776	1097787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_020564	TAATGA	2	12	1105862	1105873	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020564	GATTGC	2	12	1117059	1117070	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_020564	ATTTAT	2	12	1126427	1126438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020564	AAATTT	2	12	1131146	1131157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020564	GATTTT	2	12	1135235	1135246	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020564	AAGTAA	2	12	1152851	1152862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020564	TCGTTT	2	12	1155978	1155989	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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249	NC_020564	TTCTAT	2	12	2141540	2141551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_020564	TTTTCT	2	12	2151973	2151984	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_020564	AATTAA	2	12	2152163	2152174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_020564	GAATGT	2	12	2157655	2157666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_020564	TTTAAT	2	12	2159970	2159981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_020564	CAAATA	2	12	2162190	2162201	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_020564	TAAATG	2	12	2166244	2166255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_020564	AATTAA	2	12	2175621	2175632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_020564	ATCATT	2	12	2203379	2203390	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_020564	AGTTAA	2	12	2206963	2206974	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
259	NC_020564	TAAACA	2	12	2219129	2219140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_020564	ATTCAC	2	12	2219321	2219332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_020564	TTTATT	2	12	2221409	2221420	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_020564	AAATTT	2	12	2223266	2223277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_020564	AATATT	2	12	2227090	2227101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_020564	TGTCAT	2	12	2251941	2251952	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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280	NC_020564	CATAAT	2	12	2311719	2311730	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
281	NC_020564	ATCATT	2	12	2317830	2317841	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
282	NC_020564	TTTACG	2	12	2331639	2331650	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
283	NC_020564	AATATA	2	12	2345574	2345585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020564	TGAAAT	2	12	2348041	2348052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_020564	TATATT	2	12	2371835	2371846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.