MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 2440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020564	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020564	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020564	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020564	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020564	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020564	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020564	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020564	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020564	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020564	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020564	TAAA	2	8	14546	14553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020564	AGTA	2	8	20567	20574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020564	ATTC	2	8	20652	20659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020564	TTTG	2	8	23804	23811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020564	ATCT	2	8	24139	24146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020564	GCCT	2	8	24267	24274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020564	ATTT	2	8	24599	24606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020564	ATCA	2	8	30940	30947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020564	TTCT	2	8	34392	34399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020564	ATAA	2	8	34430	34437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020564	TAAA	2	8	35807	35814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020564	AAAT	2	8	36632	36639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020564	TTAA	2	8	37304	37311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020564	AAGA	2	8	38162	38169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020564	GCAT	2	8	38342	38349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020564	AGCA	2	8	41946	41953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020564	TCTT	2	8	44370	44377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020564	GATA	2	8	44692	44699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020564	ACTT	2	8	45122	45129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020564	TTAT	3	12	45142	45153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020564	TGGT	2	8	45712	45719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020564	TTTC	2	8	46577	46584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020564	GTAA	2	8	46703	46710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020564	ATCC	2	8	46991	46998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020564	TCAA	2	8	48493	48500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020564	AATT	2	8	50544	50551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020564	CTTG	2	8	50595	50602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020564	AATT	2	8	50634	50641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020564	AATG	2	8	54969	54976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020564	TAAT	2	8	55211	55218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020564	ATTT	2	8	56027	56034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020564	TTAT	2	8	56088	56095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020564	CTAA	2	8	56191	56198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020564	GATT	2	8	62450	62457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020564	TAGA	2	8	62637	62644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020564	TTCA	2	8	63029	63036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020564	ATAA	2	8	63235	63242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020564	ATAA	2	8	63245	63252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020564	ATCA	2	8	63370	63377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020564	AACA	2	8	65297	65304	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020564	ATTG	2	8	65414	65421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020564	CTTG	2	8	65574	65581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020564	ATTT	2	8	65733	65740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020564	CATA	2	8	66121	66128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020564	ATTA	2	8	66978	66985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020564	TCCT	2	8	67122	67129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020564	TAAT	2	8	71261	71268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020564	TGAC	2	8	71296	71303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020564	ATTT	2	8	72988	72995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020564	AAGA	2	8	73206	73213	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020564	ATTT	2	8	73222	73229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020564	AAGA	2	8	73262	73269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020564	TATT	2	8	73286	73293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020564	ATTT	2	8	73456	73463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020564	AATA	2	8	74457	74464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020564	AGCT	2	8	78285	78292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020564	TAAT	2	8	78359	78366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020564	TAAT	2	8	78431	78438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020564	AGAA	2	8	78450	78457	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020564	TTGT	2	8	79569	79576	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020564	AATC	2	8	82959	82966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020564	ATAA	2	8	83762	83769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020564	ATAA	2	8	86207	86214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020564	TTAT	2	8	88992	88999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020564	ATAA	2	8	89287	89294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020564	CAAT	2	8	91159	91166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020564	AGGG	2	8	94213	94220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020564	ATAA	2	8	96336	96343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020564	TATT	2	8	96374	96381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020564	AGTA	2	8	98316	98323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020564	TTGT	2	8	98459	98466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020564	AAAT	2	8	99958	99965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020564	ATTG	2	8	101204	101211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020564	GTTA	2	8	101326	101333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020564	TCAG	2	8	108417	108424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020564	TAAA	2	8	115971	115978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020564	TAAA	2	8	116009	116016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020564	GAAA	2	8	116842	116849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020564	ATAA	2	8	117660	117667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020564	TAAA	2	8	117907	117914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020564	AAAT	2	8	123819	123826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020564	ATTA	2	8	123853	123860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020564	ATTA	2	8	124692	124699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020564	TAAA	2	8	124716	124723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020564	GAGC	2	8	125629	125636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020564	TGAA	2	8	125692	125699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020564	ATAG	2	8	126603	126610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020564	TAAA	2	8	128880	128887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020564	CTTT	2	8	133311	133318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020564	CTTT	2	8	134568	134575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020564	ATTT	2	8	134655	134662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020564	AAGA	2	8	136241	136248	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020564	GAGT	2	8	136264	136271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020564	ACTT	2	8	137826	137833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020564	ATTT	2	8	140164	140171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020564	TATT	2	8	143008	143015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020564	TAAT	2	8	143168	143175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020564	ATTA	2	8	147243	147250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020564	TAAA	2	8	157293	157300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020564	TAAA	2	8	160411	160418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020564	AATA	2	8	162517	162524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020564	GTTT	2	8	162797	162804	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020564	TAAC	2	8	162897	162904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020564	AAAT	2	8	164364	164371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020564	GTTT	2	8	164405	164412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020564	TGTA	2	8	164519	164526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020564	TTTA	2	8	164644	164651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020564	GAGT	2	8	166395	166402	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020564	TCAT	2	8	171143	171150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020564	TTTG	2	8	171226	171233	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020564	ATTT	2	8	172592	172599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020564	ATTT	2	8	172604	172611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020564	ATGT	2	8	172835	172842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020564	TTAA	2	8	172956	172963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020564	AGTA	2	8	172998	173005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020564	ATCA	2	8	181142	181149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020564	TAAA	2	8	181867	181874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020564	ATGT	2	8	186404	186411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020564	TTAA	2	8	187884	187891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020564	AATA	2	8	187964	187971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020564	TGTA	2	8	192722	192729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020564	CTTA	2	8	192811	192818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020564	TAAT	2	8	192837	192844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020564	TTTG	2	8	192927	192934	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020564	AAAG	2	8	193108	193115	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020564	AGTT	2	8	197607	197614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020564	ATGA	2	8	197855	197862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020564	GTAG	2	8	197908	197915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020564	CTTT	2	8	205353	205360	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020564	CTAT	2	8	208515	208522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020564	ACAA	2	8	208562	208569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020564	ATTT	2	8	208851	208858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020564	GAAA	2	8	208874	208881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020564	ATAA	2	8	208957	208964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020564	TAGT	2	8	209095	209102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020564	TAGT	2	8	217399	217406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020564	ATGA	2	8	217442	217449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020564	TGAA	2	8	228078	228085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020564	TTGT	2	8	228137	228144	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020564	TATT	2	8	228969	228976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020564	GAAA	2	8	230767	230774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020564	TTTG	2	8	234257	234264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020564	ACAT	2	8	234583	234590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_020564	AAAG	2	8	237754	237761	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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