MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020564	CATTAT	2	12	646240	646251	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3502	NC_020564	AAT	2	6	646276	646281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_020564	A	7	7	646286	646292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_020564	ATG	2	6	646329	646334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_020564	CTTT	2	8	646374	646381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_020564	GTT	3	9	646411	646419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_020564	AAT	2	6	646425	646430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_020564	CTA	2	6	646487	646492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_020564	GTT	2	6	646533	646538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_020564	TCC	2	6	646618	646623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_020564	TGA	2	6	646644	646649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_020564	TGTT	2	8	646762	646769	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_020564	ATA	2	6	646797	646802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_020564	CCT	2	6	646840	646845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_020564	TA	3	6	646853	646858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_020564	AAATA	2	10	646862	646871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_020564	ATTTT	2	10	646884	646893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_020564	A	6	6	646911	646916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_020564	AT	3	6	646925	646930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_020564	AGG	2	6	647556	647561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_020564	TTG	2	6	649997	650002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_020564	TATT	2	8	650003	650010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_020564	TCT	2	6	650033	650038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_020564	ATA	2	6	650048	650053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020564	TGG	3	9	650058	650066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_020564	TGG	2	6	650073	650078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_020564	GATT	2	8	650151	650158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_020564	ATT	2	6	650173	650178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_020564	ATC	2	6	650190	650195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_020564	ATA	2	6	650206	650211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020564	T	6	6	650218	650223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020564	AAC	2	6	650250	650255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_020564	GTT	2	6	650329	650334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020564	TGT	2	6	650354	650359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_020564	ATT	2	6	650390	650395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_020564	AT	3	6	650429	650434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_020564	ATCA	2	8	650441	650448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3538	NC_020564	AT	3	6	650478	650483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_020564	ATT	2	6	650502	650507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_020564	TAG	2	6	650531	650536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_020564	TAA	2	6	650548	650553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_020564	TGG	2	6	650555	650560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_020564	TTGT	2	8	650568	650575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_020564	TACTTG	2	12	650641	650652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3545	NC_020564	AGA	2	6	650678	650683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_020564	G	6	6	650701	650706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_020564	ACAA	2	8	652694	652701	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_020564	ATT	2	6	652716	652721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_020564	ATT	2	6	652731	652736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_020564	ATC	2	6	652752	652757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_020564	TTTA	2	8	652760	652767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_020564	ACA	2	6	652785	652790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_020564	ACA	2	6	652815	652820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_020564	GT	3	6	652846	652851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_020564	TTTC	2	8	652873	652880	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_020564	TGG	2	6	652946	652951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_020564	G	6	6	652950	652955	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_020564	T	6	6	653510	653515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_020564	TAT	2	6	653517	653522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_020564	TGT	2	6	653530	653535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_020564	GTT	2	6	653549	653554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_020564	ACAA	2	8	653562	653569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_020564	ATAAA	2	10	653576	653585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_020564	AAT	2	6	653590	653595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_020564	AT	3	6	653624	653629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_020564	AG	3	6	653729	653734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_020564	TGA	2	6	655809	655814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_020564	CCA	2	6	655826	655831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_020564	TGG	2	6	655836	655841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_020564	TA	3	6	655843	655848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_020564	A	7	7	657285	657291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_020564	CCA	2	6	657310	657315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_020564	GAA	2	6	657324	657329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_020564	TCA	2	6	657351	657356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_020564	TTTTA	2	10	657362	657371	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_020564	ATAG	2	8	657382	657389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_020564	ATT	2	6	657405	657410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_020564	GGA	2	6	657448	657453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_020564	A	6	6	657500	657505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_020564	G	6	6	657552	657557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_020564	ATT	2	6	657611	657616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_020564	AAAGG	2	10	657683	657692	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_020564	TAG	2	6	657747	657752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_020564	TAGT	2	8	657817	657824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_020564	CG	3	6	657844	657849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_020564	GT	3	6	657868	657873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_020564	AGA	2	6	657901	657906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_020564	TTAA	2	8	657954	657961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_020564	AGC	2	6	658005	658010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_020564	TTAA	2	8	658087	658094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_020564	ACC	2	6	658147	658152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_020564	TA	4	8	658174	658181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_020564	AGG	2	6	658187	658192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_020564	AT	4	8	658196	658203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_020564	CATCAA	2	12	658291	658302	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_020564	TCG	2	6	659147	659152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_020564	TAC	2	6	659154	659159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_020564	ACC	2	6	659196	659201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_020564	GCA	2	6	659212	659217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_020564	TAA	2	6	659226	659231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_020564	TAA	3	9	659235	659243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_020564	TAAA	2	8	660067	660074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_020564	CCT	2	6	660841	660846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_020564	TAAT	2	8	660868	660875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_020564	TAA	2	6	660880	660885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_020564	ATATA	2	10	660920	660929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_020564	ATGT	2	8	660934	660941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_020564	CTT	2	6	661662	661667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_020564	T	6	6	661666	661671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_020564	TTA	2	6	662473	662478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_020564	TAATTT	2	12	662531	662542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_020564	ATA	2	6	662633	662638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_020564	ATG	2	6	663432	663437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_020564	ATAAAA	2	12	663438	663449	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_020564	T	6	6	663480	663485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_020564	CCTT	2	8	664292	664299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_020564	TAC	2	6	664325	664330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_020564	GTT	2	6	664337	664342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_020564	TGT	2	6	664356	664361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_020564	AGA	2	6	664371	664376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_020564	TTA	2	6	664382	664387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_020564	ATC	2	6	664418	664423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_020564	AAACT	2	10	664445	664454	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3624	NC_020564	TAA	2	6	664493	664498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_020564	AAT	2	6	664522	664527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_020564	ACA	2	6	664560	664565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_020564	ATT	2	6	664566	664571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_020564	ATA	2	6	664572	664577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_020564	TAA	2	6	665475	665480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_020564	TAA	2	6	666671	666676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_020564	CAA	2	6	666682	666687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_020564	TGA	2	6	667713	667718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_020564	ATG	2	6	667736	667741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_020564	GAG	2	6	667751	667756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_020564	TAA	2	6	667776	667781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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