MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_020564	TTTTCT	2	12	2619088	2619099	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15502	NC_020564	CTT	2	6	2619112	2619117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_020564	TAA	2	6	2619128	2619133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_020564	TCC	2	6	2619139	2619144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15505	NC_020564	GATTC	2	10	2619205	2619214	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15506	NC_020564	AATTAA	2	12	2619278	2619289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_020564	T	6	6	2619346	2619351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_020564	TGT	2	6	2619381	2619386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_020564	T	7	7	2621252	2621258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_020564	TAA	2	6	2621276	2621281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_020564	ACT	2	6	2622415	2622420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_020564	TTTA	2	8	2622444	2622451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_020564	CTC	2	6	2622474	2622479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15514	NC_020564	ACT	2	6	2622484	2622489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_020564	ACT	2	6	2622493	2622498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_020564	ATT	2	6	2622499	2622504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_020564	TCC	2	6	2623020	2623025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15518	NC_020564	TAT	2	6	2623035	2623040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_020564	TAT	2	6	2623063	2623068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_020564	TCAAT	2	10	2623079	2623088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15521	NC_020564	ACA	2	6	2623110	2623115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_020564	GTTAA	2	10	2623133	2623142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_020564	AAAT	2	8	2623160	2623167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_020564	CAT	2	6	2623223	2623228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15525	NC_020564	ATA	2	6	2623252	2623257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_020564	ATAAAA	2	12	2623289	2623300	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_020564	CTA	2	6	2623328	2623333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15528	NC_020564	AAT	2	6	2623395	2623400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_020564	TTCA	2	8	2623410	2623417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15530	NC_020564	TCT	2	6	2623450	2623455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_020564	CAA	2	6	2623502	2623507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_020564	TGC	2	6	2623515	2623520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_020564	CAAA	2	8	2623527	2623534	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15534	NC_020564	ATT	4	12	2623587	2623598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_020564	AATC	2	8	2623652	2623659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15536	NC_020564	TAC	2	6	2623664	2623669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_020564	TCA	2	6	2623721	2623726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_020564	GTA	2	6	2624573	2624578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_020564	TAT	2	6	2625427	2625432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_020564	GAAAG	2	10	2625460	2625469	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_020564	AAG	3	9	2625467	2625475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_020564	AT	3	6	2626341	2626346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_020564	ACC	2	6	2626378	2626383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15544	NC_020564	ACT	2	6	2627189	2627194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15545	NC_020564	ATA	2	6	2627255	2627260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_020564	ATT	3	9	2627270	2627278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_020564	TGCT	2	8	2627305	2627312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15548	NC_020564	A	7	7	2627313	2627319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_020564	AT	3	6	2627374	2627379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_020564	TAAT	2	8	2627383	2627390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_020564	CCTAA	2	10	2628374	2628383	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15552	NC_020564	ATTT	2	8	2628388	2628395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_020564	ATTTT	2	10	2628445	2628454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_020564	AATA	2	8	2628528	2628535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_020564	T	7	7	2628645	2628651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_020564	TA	3	6	2628691	2628696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_020564	CCT	2	6	2628698	2628703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15558	NC_020564	TCA	2	6	2628720	2628725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15559	NC_020564	CAT	2	6	2628735	2628740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_020564	A	6	6	2628891	2628896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_020564	ATT	2	6	2628975	2628980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_020564	A	6	6	2629002	2629007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_020564	GGA	2	6	2629037	2629042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_020564	A	7	7	2630504	2630510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_020564	T	6	6	2630549	2630554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_020564	GCAA	2	8	2631948	2631955	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15567	NC_020564	CT	3	6	2631962	2631967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15568	NC_020564	TAA	2	6	2632042	2632047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_020564	AT	3	6	2632063	2632068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_020564	TGC	2	6	2632202	2632207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15571	NC_020564	TCAT	2	8	2632218	2632225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15572	NC_020564	TGT	2	6	2632243	2632248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_020564	TAA	2	6	2632255	2632260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_020564	CAAT	2	8	2632262	2632269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15575	NC_020564	TAT	2	6	2632285	2632290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_020564	AT	3	6	2632328	2632333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_020564	ATA	2	6	2632341	2632346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_020564	ATTT	2	8	2632371	2632378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_020564	CTAT	2	8	2632418	2632425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15580	NC_020564	TTAT	2	8	2632446	2632453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_020564	TATT	2	8	2632474	2632481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_020564	ATT	2	6	2632530	2632535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_020564	AATAA	2	10	2632580	2632589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_020564	TTAA	2	8	2632595	2632602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_020564	ATT	2	6	2632610	2632615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_020564	T	6	6	2633620	2633625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_020564	ACT	2	6	2633633	2633638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15588	NC_020564	T	6	6	2633683	2633688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_020564	GTAT	2	8	2633708	2633715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_020564	A	7	7	2633726	2633732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_020564	ATC	2	6	2635325	2635330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15592	NC_020564	TAGT	2	8	2635425	2635432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_020564	AGCA	2	8	2635452	2635459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15594	NC_020564	GTAAAT	2	12	2635463	2635474	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_020564	ATT	2	6	2635479	2635484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_020564	AT	3	6	2635498	2635503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_020564	AGA	2	6	2635520	2635525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_020564	ATCAA	2	10	2635531	2635540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15599	NC_020564	ATT	2	6	2635546	2635551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_020564	ACA	2	6	2635554	2635559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15601	NC_020564	ATCA	2	8	2635642	2635649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15602	NC_020564	ATT	2	6	2635711	2635716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_020564	TTA	2	6	2635801	2635806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_020564	GAC	2	6	2635898	2635903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15605	NC_020564	CAT	2	6	2635910	2635915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15606	NC_020564	ATC	2	6	2635940	2635945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15607	NC_020564	TGA	2	6	2637609	2637614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_020564	TA	4	8	2637638	2637645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_020564	ATTC	2	8	2638270	2638277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15610	NC_020564	TATT	2	8	2638281	2638288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_020564	CTT	2	6	2638308	2638313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_020564	ATT	2	6	2638406	2638411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_020564	TTTTA	2	10	2638463	2638472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_020564	TGA	2	6	2638568	2638573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_020564	GAAT	2	8	2638615	2638622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15616	NC_020564	TCT	2	6	2638625	2638630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15617	NC_020564	ATC	2	6	2638666	2638671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15618	NC_020564	TA	3	6	2638684	2638689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_020564	TC	3	6	2638714	2638719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15620	NC_020564	TA	3	6	2638728	2638733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_020564	ATC	2	6	2638835	2638840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15622	NC_020564	CA	3	6	2638878	2638883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15623	NC_020564	ACA	2	6	2638894	2638899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15624	NC_020564	A	6	6	2638927	2638932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_020564	CAATA	2	10	2638942	2638951	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15626	NC_020564	CTA	2	6	2638969	2638974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15627	NC_020564	TA	3	6	2638973	2638978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_020564	AAT	2	6	2640837	2640842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15629	NC_020564	ATCA	2	8	2640873	2640880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15630	NC_020564	ACAAA	2	10	2640897	2640906	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15631	NC_020564	CAA	2	6	2642444	2642449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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