MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020564	TGG	2	6	228066	228071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020564	TGAA	2	8	228078	228085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020564	TTGT	2	8	228137	228144	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020564	AAG	2	6	228146	228151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020564	TA	3	6	228160	228165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020564	TA	3	6	228222	228227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020564	ATA	2	6	228252	228257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020564	A	7	7	228257	228263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020564	TGT	2	6	228267	228272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020564	AATAT	2	10	228312	228321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020564	TGA	2	6	228364	228369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020564	TATT	2	8	228969	228976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020564	TAA	2	6	229036	229041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020564	AT	3	6	229074	229079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020564	AT	3	6	230598	230603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020564	CT	3	6	230749	230754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_020564	GAAA	2	8	230767	230774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020564	TGT	2	6	231469	231474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020564	TATTG	2	10	231516	231525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020564	AAT	2	6	231570	231575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020564	TCA	3	9	231580	231588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_020564	AAT	2	6	234156	234161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020564	TGT	2	6	234237	234242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020564	TTTG	2	8	234257	234264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020564	TATTT	2	10	234303	234312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020564	TA	3	6	234321	234326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020564	AT	3	6	234399	234404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020564	CAA	2	6	234442	234447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_020564	T	6	6	234451	234456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020564	AT	3	6	234465	234470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020564	TGT	2	6	234518	234523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020564	ACAT	2	8	234583	234590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_020564	TGA	2	6	234592	234597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020564	A	7	7	234619	234625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020564	CAA	2	6	234629	234634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_020564	AAAG	2	8	237754	237761	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020564	CTT	2	6	237794	237799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_020564	GTA	2	6	237830	237835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020564	ATC	2	6	237935	237940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_020564	TTA	2	6	237948	237953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020564	ATATGA	2	12	237966	237977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020564	GAT	2	6	239851	239856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020564	ATT	2	6	239982	239987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020564	AATTG	2	10	240016	240025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020564	ATTT	2	8	240156	240163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020564	TGCT	2	8	240243	240250	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_020564	TGT	2	6	240322	240327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020564	A	7	7	240361	240367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020564	AT	3	6	240442	240447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020564	GGA	2	6	240503	240508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020564	A	6	6	240512	240517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020564	ACA	2	6	242550	242555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_020564	ATG	2	6	242571	242576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020564	ATT	2	6	242623	242628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020564	AACAT	2	10	242646	242655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_020564	AT	3	6	242662	242667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020564	AAT	3	9	242723	242731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020564	AC	4	8	242778	242785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_020564	ATT	2	6	242850	242855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020564	ACC	2	6	242937	242942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_020564	T	6	6	242958	242963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020564	CA	3	6	242981	242986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_020564	TAA	2	6	242994	242999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020564	TTCA	2	8	243037	243044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_020564	CT	3	6	244278	244283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_020564	TCC	2	6	246565	246570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_020564	GATAA	2	10	246583	246592	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020564	ATTA	2	8	246631	246638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020564	T	6	6	246702	246707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020564	ATT	2	6	246732	246737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020564	ACA	2	6	248012	248017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_020564	ATAAC	2	10	251230	251239	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_020564	ATA	2	6	251277	251282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020564	TGAAT	2	10	251341	251350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020564	TA	3	6	251365	251370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020564	ATTAA	2	10	251482	251491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020564	TAT	2	6	251500	251505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020564	GGAATA	2	12	252827	252838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020564	A	6	6	252851	252856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_020564	TA	3	6	252892	252897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020564	TAA	2	6	252925	252930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020564	TCA	2	6	252946	252951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_020564	CT	3	6	254558	254563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_020564	CAA	2	6	254585	254590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_020564	TGT	2	6	254626	254631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020564	ATT	2	6	254644	254649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020564	AATT	2	8	254657	254664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020564	GTA	2	6	254665	254670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020564	AAAT	2	8	254685	254692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020564	AT	3	6	254737	254742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020564	CTG	2	6	254760	254765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_020564	TAC	2	6	254769	254774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_020564	TGC	2	6	254799	254804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_020564	AAT	2	6	254984	254989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_020564	TAT	2	6	255059	255064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020564	TGT	2	6	255149	255154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020564	GAC	2	6	255160	255165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_020564	AAAT	2	8	255167	255174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020564	ATC	2	6	255186	255191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_020564	A	6	6	255210	255215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020564	AAAGT	2	10	255226	255235	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020564	ATTT	2	8	255260	255267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020564	AATTA	2	10	255339	255348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020564	AAT	2	6	255360	255365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020564	CTC	2	6	256607	256612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_020564	ATT	2	6	256632	256637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_020564	CTA	2	6	256638	256643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_020564	AATT	2	8	256659	256666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020564	ATAA	2	8	256680	256687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020564	T	6	6	256722	256727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020564	CGA	2	6	256773	256778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_020564	GC	3	6	256781	256786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_020564	ATTT	2	8	256787	256794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020564	A	6	6	256804	256809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020564	TTG	2	6	256812	256817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020564	A	6	6	256827	256832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020564	ATA	2	6	256842	256847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020564	AAT	2	6	256864	256869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020564	TAAAA	2	10	256939	256948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020564	AAAT	2	8	256953	256960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020564	AAAT	2	8	257011	257018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020564	AGC	2	6	257106	257111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_020564	A	6	6	258175	258180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020564	GTT	2	6	258248	258253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020564	AAATT	2	10	258255	258264	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020564	GAT	2	6	258300	258305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020564	ATG	2	6	258343	258348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020564	CTT	2	6	258396	258401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_020564	ATT	2	6	259992	259997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020564	AT	4	8	260029	260036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020564	TTG	2	6	260107	260112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020564	AGGT	2	8	260167	260174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020564	CAC	2	6	260279	260284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_020564	ATAA	2	8	260285	260292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020564	AAC	2	6	260312	260317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_020564	AT	3	6	260331	260336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020564	TTAA	2	8	261281	261288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_020564	A	6	6	261404	261409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_020564	A	6	6	321876	321881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_020564	TAT	2	6	321884	321889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_020564	ATA	3	9	322137	322145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_020564	AAT	2	6	322185	322190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_020564	A	6	6	325181	325186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_020564	ATA	2	6	325632	325637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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