MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020564	A	6	6	78419	78424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020564	TAAT	2	8	78431	78438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020564	AGAA	2	8	78450	78457	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020564	AAT	2	6	79460	79465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020564	ATT	2	6	79501	79506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020564	ACT	2	6	79510	79515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_020564	TAA	2	6	79537	79542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020564	CAA	2	6	79545	79550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_020564	TAT	2	6	79551	79556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020564	TTGT	2	8	79569	79576	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020564	ATA	2	6	79587	79592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020564	AT	3	6	79623	79628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020564	AACAAA	2	12	79635	79646	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
514	NC_020564	AGA	2	6	79658	79663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020564	TAA	2	6	82109	82114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020564	AGA	2	6	82150	82155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020564	AATC	2	8	82959	82966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_020564	ATA	3	9	82975	82983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020564	ATG	2	6	83567	83572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020564	TTG	2	6	83635	83640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020564	TCA	2	6	83665	83670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_020564	A	6	6	83707	83712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020564	T	7	7	83724	83730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020564	ATAA	2	8	83762	83769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020564	AAT	2	6	83820	83825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020564	T	6	6	86145	86150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020564	A	6	6	86171	86176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020564	TGT	2	6	86194	86199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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530	NC_020564	ATG	2	6	86228	86233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020564	AATATA	2	12	88935	88946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020564	TTAT	2	8	88992	88999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020564	GTT	2	6	89003	89008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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535	NC_020564	TA	4	8	89040	89047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020564	ATT	2	6	89163	89168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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539	NC_020564	A	6	6	89274	89279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020564	ATAA	2	8	89287	89294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020564	ATT	2	6	91047	91052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020564	AT	3	6	91058	91063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020564	TTA	2	6	91097	91102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020564	ATG	2	6	91153	91158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020564	CAAT	2	8	91159	91166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_020564	TCA	2	6	91181	91186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_020564	A	7	7	91186	91192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_020564	A	6	6	94151	94156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020564	AGGG	2	8	94213	94220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020564	AGA	2	6	94221	94226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020564	AAT	2	6	94267	94272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020564	AAT	2	6	95631	95636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020564	GTAAT	2	10	95747	95756	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020564	ATG	2	6	96301	96306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020564	ATT	2	6	96330	96335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020564	ATAA	2	8	96336	96343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020564	AT	3	6	96368	96373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020564	TATT	2	8	96374	96381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020564	ATC	2	6	96469	96474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_020564	TA	3	6	96526	96531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020564	AG	3	6	96533	96538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020564	TGT	2	6	98151	98156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020564	ATT	2	6	98187	98192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020564	T	6	6	98241	98246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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567	NC_020564	AGTA	2	8	98316	98323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020564	A	6	6	98328	98333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020564	CAA	2	6	98343	98348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_020564	GAT	2	6	98370	98375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020564	TA	3	6	98411	98416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020564	TTGT	2	8	98459	98466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020564	TTAAAT	2	12	99927	99938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020564	AAAT	2	8	99958	99965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020564	TAA	2	6	100030	100035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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582	NC_020564	ATA	2	6	101100	101105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_020564	ATC	2	6	109720	109725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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609	NC_020564	TAAA	2	8	116009	116016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020564	GA	3	6	116669	116674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020564	A	7	7	116678	116684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020564	TGT	2	6	116800	116805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_020564	GAG	2	6	116853	116858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020564	ATAA	2	8	117660	117667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020564	T	6	6	117705	117710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020564	TAA	2	6	117745	117750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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620	NC_020564	ATTTT	2	10	117895	117904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020564	TAAA	2	8	117907	117914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020564	A	6	6	117912	117917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020564	AT	3	6	117955	117960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020564	ATA	3	9	118980	118988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020564	GAA	2	6	119024	119029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020564	TAA	2	6	119627	119632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020564	CAT	2	6	119731	119736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020564	TGA	2	6	119767	119772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_020564	T	6	6	123706	123711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020564	TA	3	6	123801	123806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020564	AAAT	2	8	123819	123826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020564	AAT	3	9	123824	123832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020564	AC	3	6	123842	123847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_020564	ATTA	2	8	123853	123860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020564	AGG	2	6	123882	123887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020564	T	6	6	124542	124547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020564	ATA	2	6	124608	124613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_020564	TTG	2	6	124644	124649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020564	ATG	2	6	124656	124661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_020564	TA	3	6	124672	124677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_020564	ACA	2	6	124684	124689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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