MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020564	TTA	2	6	1060383	1060388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_020564	ATC	2	6	1060412	1060417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_020564	TTAA	2	8	1060426	1060433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_020564	ATC	2	6	1060490	1060495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_020564	TAT	2	6	1060514	1060519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_020564	GTA	2	6	1060582	1060587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_020564	TTA	2	6	1060591	1060596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_020564	AAAG	2	8	1060608	1060615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_020564	TAGTAT	2	12	1060666	1060677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_020564	TATT	3	12	1060678	1060689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_020564	GAA	2	6	1060742	1060747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_020564	ACA	2	6	1060802	1060807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_020564	ATT	2	6	1060823	1060828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_020564	TTA	2	6	1060829	1060834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_020564	TTAAT	2	10	1060938	1060947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_020564	TGA	2	6	1060971	1060976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_020564	A	6	6	1060991	1060996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_020564	A	7	7	1061057	1061063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_020564	GTT	2	6	1061079	1061084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_020564	ATT	2	6	1061086	1061091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_020564	CAAC	2	8	1061097	1061104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_020564	CTT	2	6	1062491	1062496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_020564	ATA	2	6	1062506	1062511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_020564	TAA	2	6	1062515	1062520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_020564	ATTT	2	8	1062540	1062547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_020564	T	6	6	1062550	1062555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_020564	ATT	2	6	1062566	1062571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_020564	A	6	6	1062599	1062604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_020564	TAT	2	6	1062637	1062642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_020564	CCT	2	6	1063278	1063283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_020564	AAG	2	6	1063372	1063377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_020564	TAA	2	6	1063402	1063407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_020564	ATA	2	6	1064318	1064323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_020564	TG	3	6	1064369	1064374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_020564	T	6	6	1064433	1064438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_020564	GTA	2	6	1064443	1064448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_020564	ATC	2	6	1064491	1064496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_020564	ATA	2	6	1064531	1064536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_020564	ACA	2	6	1064545	1064550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_020564	T	8	8	1064586	1064593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_020564	ATA	2	6	1064642	1064647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_020564	A	6	6	1064647	1064652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_020564	ATA	2	6	1066556	1066561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_020564	ATA	2	6	1066608	1066613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_020564	TAT	2	6	1066635	1066640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_020564	GTT	2	6	1066715	1066720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_020564	GT	3	6	1066724	1066729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_020564	ATC	2	6	1066746	1066751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_020564	TA	3	6	1067460	1067465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_020564	CAA	2	6	1067494	1067499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_020564	TGA	2	6	1067537	1067542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_020564	GAA	2	6	1067604	1067609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_020564	AAG	2	6	1067641	1067646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_020564	CAAA	2	8	1067690	1067697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6055	NC_020564	AT	3	6	1067763	1067768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_020564	TTTATA	2	12	1067816	1067827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_020564	TGT	2	6	1067856	1067861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_020564	CTT	2	6	1067862	1067867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_020564	GTCA	2	8	1067876	1067883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_020564	TA	3	6	1067983	1067988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_020564	TA	3	6	1069364	1069369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_020564	TGA	2	6	1069388	1069393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_020564	AAC	2	6	1069420	1069425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_020564	TTTTG	2	10	1069438	1069447	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_020564	AAACA	2	10	1069483	1069492	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6066	NC_020564	TGG	2	6	1069537	1069542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_020564	ATG	2	6	1069556	1069561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_020564	ATA	2	6	1069585	1069590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_020564	ATTTT	2	10	1069608	1069617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_020564	T	6	6	1069621	1069626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_020564	CAA	2	6	1069654	1069659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_020564	TGT	2	6	1069674	1069679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_020564	ATT	3	9	1069698	1069706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_020564	TAT	2	6	1069800	1069805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_020564	TTAG	2	8	1069810	1069817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_020564	TAAAA	2	10	1073309	1073318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_020564	ACA	2	6	1073328	1073333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_020564	A	6	6	1073389	1073394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_020564	T	6	6	1073435	1073440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_020564	T	7	7	1074535	1074541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_020564	TTA	2	6	1074619	1074624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_020564	TAAAT	2	10	1074653	1074662	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_020564	ATTTTA	2	12	1074712	1074723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_020564	AGG	2	6	1074781	1074786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_020564	ATTA	2	8	1075705	1075712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_020564	TTGG	2	8	1075796	1075803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_020564	AAAT	2	8	1075823	1075830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_020564	ATGTT	2	10	1075841	1075850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_020564	T	6	6	1075875	1075880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_020564	CAA	2	6	1075988	1075993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_020564	TGG	2	6	1075995	1076000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_020564	ATT	2	6	1076020	1076025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_020564	TTA	3	9	1076122	1076130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_020564	TAT	2	6	1076135	1076140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_020564	T	6	6	1076241	1076246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6097	NC_020564	T	7	7	1076300	1076306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_020564	TAA	2	6	1076323	1076328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_020564	GAT	2	6	1076411	1076416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6101	NC_020564	GTT	2	6	1076473	1076478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_020564	T	6	6	1076477	1076482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_020564	GGT	2	6	1076505	1076510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_020564	GAT	2	6	1077600	1077605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_020564	TGA	2	6	1077608	1077613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_020564	TGATA	2	10	1077620	1077629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_020564	CAT	2	6	1077649	1077654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_020564	ATCA	2	8	1077706	1077713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_020564	ATG	2	6	1077736	1077741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_020564	ATC	2	6	1077763	1077768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_020564	AGACA	2	10	1077793	1077802	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6112	NC_020564	TGA	2	6	1077878	1077883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_020564	GTT	2	6	1077885	1077890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_020564	A	6	6	1078003	1078008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_020564	GGT	2	6	1078025	1078030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_020564	ACTA	2	8	1078041	1078048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6117	NC_020564	TCC	2	6	1079001	1079006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_020564	TG	3	6	1079056	1079061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_020564	GAATT	2	10	1079087	1079096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_020564	ATG	2	6	1079103	1079108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_020564	TAA	2	6	1079181	1079186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_020564	ATGAT	2	10	1079191	1079200	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_020564	AAAT	2	8	1079210	1079217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_020564	TTTA	2	8	1079263	1079270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_020564	TTCA	2	8	1079317	1079324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6126	NC_020564	TATG	2	8	1079348	1079355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_020564	AT	3	6	1079475	1079480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_020564	ATT	2	6	1079488	1079493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_020564	AC	3	6	1079524	1079529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_020564	TATAA	2	10	1079542	1079551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_020564	TGGATA	2	12	1079657	1079668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6133	NC_020564	ATC	2	6	1079814	1079819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6399	NC_020564	TA	4	8	1116896	1116903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6400	NC_020564	TCA	2	6	1116946	1116951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6402	NC_020564	TTA	2	6	1116985	1116990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6431	NC_020564	ATTA	2	8	1120562	1120569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6432	NC_020564	TCG	2	6	1120581	1120586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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