MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP4

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020563	GGAC	2	8	6025	6032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020563	TGCC	2	8	7569	7576	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020563	AGCG	2	8	7665	7672	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020563	GACG	2	8	7706	7713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020563	CGGC	2	8	8815	8822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020563	GGAC	2	8	9424	9431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020563	TCCG	2	8	13172	13179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020563	GTCA	2	8	13720	13727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020563	GCTG	2	8	15435	15442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020563	AGCC	2	8	15605	15612	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020563	AGAC	2	8	16320	16327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020563	CATC	2	8	16754	16761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020563	AGGC	2	8	17861	17868	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020563	GGAC	2	8	18019	18026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020563	TCCG	2	8	23494	23501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020563	GGCC	2	8	25737	25744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020563	TCCC	2	8	32402	32409	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_020563	CAAA	2	8	32784	32791	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020563	CAGG	2	8	32957	32964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.