MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP4

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020563	GCC	2	6	2	7	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020563	TGC	2	6	83	88	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020563	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_020563	TCG	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020563	GTC	3	9	2122	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020563	GCG	2	6	2174	2179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020563	AGT	2	6	2259	2264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020563	AGC	2	6	2340	2345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020563	TGC	2	6	2402	2407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020563	CAT	2	6	2433	2438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020563	CTC	2	6	3682	3687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_020563	ATC	2	6	7236	7241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020563	CCG	2	6	7599	7604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_020563	GGC	2	6	7617	7622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020563	CGC	2	6	7714	7719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020563	ATT	2	6	7803	7808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020563	GGA	2	6	7852	7857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020563	TGC	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020563	AGC	2	6	7960	7965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020563	GAT	2	6	8776	8781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020563	GCC	2	6	10233	10238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020563	CGA	2	6	10288	10293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020563	GCT	2	6	11353	11358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020563	GGC	2	6	12368	12373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020563	ATG	2	6	14547	14552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020563	CGC	2	6	15266	15271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_020563	CCA	2	6	15387	15392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_020563	TGC	2	6	15429	15434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020563	GTC	2	6	15574	15579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020563	GAC	2	6	15619	15624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020563	AGA	2	6	16659	16664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020563	GGC	2	6	16702	16707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020563	TCG	2	6	17885	17890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020563	GCC	2	6	18828	18833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_020563	GTC	2	6	18858	18863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020563	CGC	2	6	18908	18913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020563	ATG	2	6	19901	19906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020563	GCC	2	6	25620	25625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_020563	GCC	2	6	25640	25645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020563	GCT	2	6	25682	25687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020563	GCA	2	6	25695	25700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020563	AAT	2	6	25852	25857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020563	GCC	2	6	26355	26360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020563	ATC	2	6	26395	26400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020563	TGT	2	6	26455	26460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020563	GCG	2	6	26532	26537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020563	GGC	2	6	26663	26668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020563	CTT	2	6	30617	30622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020563	CGC	2	6	30687	30692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_020563	GCC	2	6	31078	31083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_020563	TGC	2	6	32113	32118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020563	CGA	2	6	32143	32148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020563	CAG	2	6	32168	32173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020563	CAT	2	6	32357	32362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020563	ATG	2	6	32385	32390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020563	GAT	2	6	32510	32515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020563	GCC	2	6	32552	32557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020563	TGC	2	6	32580	32585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020563	CAC	2	6	32686	32691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_020563	GTG	2	6	32762	32767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020563	CGG	2	6	32800	32805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020563	CAT	2	6	32814	32819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020563	GGA	2	6	32834	32839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020563	GGC	2	6	32857	32862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020563	CGG	2	6	32877	32882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020563	TTC	6	18	32905	32922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020563	GCG	2	6	32935	32940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020563	TTC	2	6	33015	33020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.