MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020562	GC	3	6	285	290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020562	GC	3	6	2474	2479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020562	GT	3	6	2807	2812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020562	GC	5	10	3266	3275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020562	CG	3	6	3837	3842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020562	TG	3	6	4950	4955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020562	GC	4	8	8572	8579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020562	GC	3	6	12509	12514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020562	CG	3	6	12525	12530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020562	GC	3	6	12706	12711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020562	TA	4	8	14021	14028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020562	GA	3	6	14399	14404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020562	GT	3	6	16565	16570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020562	CG	3	6	16625	16630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020562	CT	3	6	16704	16709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020562	GC	4	8	18062	18069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020562	CA	3	6	19112	19117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020562	CG	3	6	19289	19294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020562	TC	3	6	27764	27769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020562	GC	3	6	28284	28289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020562	TC	3	6	28423	28428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020562	CT	3	6	29585	29590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020562	CT	3	6	29611	29616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020562	CT	3	6	30038	30043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020562	CG	3	6	30273	30278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020562	CG	4	8	30288	30295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020562	CG	3	6	30845	30850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020562	GC	3	6	31110	31115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020562	AG	3	6	31628	31633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020562	CG	3	6	32946	32951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020562	GC	4	8	32963	32970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020562	GC	3	6	33071	33076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020562	CG	3	6	36001	36006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020562	GC	3	6	39189	39194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020562	CG	3	6	53924	53929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020562	GT	3	6	54021	54026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020562	GC	3	6	59017	59022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020562	CT	4	8	60016	60023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020562	CG	3	6	60701	60706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020562	CG	3	6	62233	62238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020562	GC	3	6	65947	65952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020562	AG	3	6	66811	66816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020562	CG	3	6	67027	67032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020562	GT	3	6	70066	70071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020562	AC	3	6	70214	70219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020562	AG	4	8	70304	70311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020562	GA	3	6	70323	70328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020562	GC	3	6	71709	71714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020562	AT	3	6	73982	73987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020562	TA	3	6	79279	79284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020562	TA	4	8	79309	79316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020562	GC	3	6	81275	81280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020562	GC	3	6	81537	81542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020562	GC	3	6	82114	82119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020562	CG	3	6	82485	82490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020562	AT	3	6	82788	82793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020562	GC	3	6	83185	83190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020562	CT	3	6	83292	83297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020562	GC	3	6	83518	83523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020562	GC	3	6	83561	83566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020562	GC	3	6	83714	83719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020562	AT	3	6	84051	84056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020562	CG	3	6	84144	84149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020562	GC	3	6	86936	86941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020562	GC	3	6	89571	89576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020562	CG	3	6	98681	98686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020562	TA	3	6	105058	105063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020562	GA	3	6	108393	108398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020562	GC	3	6	108811	108816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020562	GC	3	6	108831	108836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020562	AC	3	6	108844	108849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020562	GC	3	6	109047	109052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020562	GC	3	6	121916	121921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020562	GC	3	6	122019	122024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020562	GC	3	6	125208	125213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020562	CG	3	6	125317	125322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020562	CG	3	6	126557	126562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020562	GC	3	6	126729	126734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020562	GC	3	6	128239	128244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020562	GC	3	6	130261	130266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020562	CT	3	6	130375	130380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020562	CT	3	6	131760	131765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020562	CG	3	6	131810	131815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020562	AG	3	6	131881	131886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020562	GA	3	6	132778	132783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020562	CG	3	6	132805	132810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020562	CG	3	6	133912	133917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020562	TC	3	6	133975	133980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020562	GC	4	8	137074	137081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020562	GC	3	6	137141	137146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020562	GC	3	6	137363	137368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020562	GC	3	6	137493	137498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020562	CG	3	6	139408	139413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020562	GT	3	6	139520	139525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020562	CG	3	6	139527	139532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020562	GT	3	6	142175	142180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020562	GA	3	6	142191	142196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020562	CG	3	6	142681	142686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020562	TC	3	6	142911	142916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020562	CG	3	6	157281	157286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020562	GC	3	6	158446	158451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020562	CG	3	6	160538	160543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020562	GC	4	8	160616	160623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020562	CG	3	6	161584	161589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020562	GC	4	8	161948	161955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020562	AG	3	6	162006	162011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020562	GC	3	6	162019	162024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020562	GC	4	8	165942	165949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020562	CT	3	6	166158	166163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020562	CA	3	6	166906	166911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.