MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020562	GCT	2	6	118366	118371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_020562	GGC	2	6	118451	118456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_020562	CGC	2	6	118476	118481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_020562	TTCC	2	8	118501	118508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_020562	CGG	2	6	118509	118514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_020562	GGT	2	6	118528	118533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020562	GGC	2	6	118591	118596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020562	CATT	2	8	118620	118627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_020562	CGCA	2	8	118697	118704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
510	NC_020562	AGAGGG	2	12	118746	118757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020562	AGG	2	6	118774	118779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020562	CAT	2	6	119527	119532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020562	GGC	2	6	119567	119572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020562	CGG	2	6	121853	121858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_020562	CGC	3	9	121893	121901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_020562	GC	3	6	121916	121921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_020562	CCT	2	6	121939	121944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_020562	CCG	2	6	121962	121967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_020562	GC	3	6	122019	122024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_020562	GC	3	6	125208	125213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_020562	GACCGA	2	12	125295	125306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_020562	CTC	2	6	125311	125316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_020562	CG	3	6	125317	125322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_020562	CGC	2	6	125326	125331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_020562	CGCA	2	8	125344	125351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
526	NC_020562	GAG	2	6	125430	125435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020562	CCG	2	6	126443	126448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_020562	CCA	2	6	126457	126462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_020562	GAA	2	6	126498	126503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020562	CG	3	6	126557	126562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_020562	ATC	2	6	126581	126586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_020562	CTG	2	6	126600	126605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_020562	CGA	2	6	126608	126613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_020562	GGGGT	2	10	126623	126632	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020562	GATC	2	8	126665	126672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_020562	GC	3	6	126729	126734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_020562	GAG	2	6	126753	126758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020562	AGG	2	6	126759	126764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020562	AGGA	2	8	126768	126775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020562	CAT	2	6	126803	126808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_020562	C	6	6	127366	127371	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
542	NC_020562	GGC	2	6	127458	127463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_020562	GCG	2	6	128207	128212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_020562	GC	3	6	128239	128244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_020562	GGAC	2	8	128252	128259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
546	NC_020562	CCG	2	6	128260	128265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_020562	GGC	2	6	128310	128315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_020562	ATC	2	6	128323	128328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_020562	GGC	2	6	128357	128362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_020562	AGG	2	6	128395	128400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020562	GGC	2	6	128574	128579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_020562	CAC	2	6	128589	128594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_020562	GCG	2	6	128633	128638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_020562	GGC	2	6	129057	129062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_020562	GCC	2	6	129071	129076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_020562	CTC	2	6	129077	129082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_020562	CAAG	2	8	129355	129362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
558	NC_020562	GCCA	2	8	130007	130014	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_020562	ACC	2	6	130034	130039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_020562	CGG	2	6	130047	130052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_020562	GCGCT	2	10	130128	130137	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
562	NC_020562	ATGGGG	2	12	130160	130171	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020562	ATGG	2	8	130179	130186	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020562	GCC	3	9	130245	130253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_020562	GC	3	6	130261	130266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_020562	GTT	2	6	130340	130345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020562	CT	3	6	130375	130380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_020562	C	7	7	130434	130440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
569	NC_020562	GCC	2	6	130453	130458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_020562	GCG	2	6	130517	130522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_020562	ACC	2	6	130578	130583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_020562	CGG	2	6	131744	131749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_020562	CT	3	6	131760	131765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_020562	CGC	2	6	131786	131791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_020562	CG	3	6	131810	131815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_020562	AAGGG	2	10	131864	131873	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020562	AG	3	6	131881	131886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020562	CCG	2	6	132762	132767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_020562	CGG	2	6	132768	132773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_020562	GA	3	6	132778	132783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020562	CG	3	6	132805	132810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_020562	GCA	2	6	132963	132968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_020562	ACCA	2	8	132997	133004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_020562	C	7	7	133171	133177	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
585	NC_020562	GCC	2	6	133184	133189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_020562	GCTCC	2	10	133190	133199	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
587	NC_020562	CAA	2	6	133209	133214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_020562	TTTC	2	8	133869	133876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_020562	GCTC	2	8	133898	133905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
590	NC_020562	CG	3	6	133912	133917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_020562	CGCA	2	8	133930	133937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
592	NC_020562	CGA	2	6	133960	133965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_020562	TC	3	6	133975	133980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_020562	CGG	2	6	134024	134029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020562	CCA	2	6	134034	134039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_020562	CGG	2	6	134047	134052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_020562	GCG	2	6	134060	134065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_020562	TCGGCG	2	12	134074	134085	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_020562	GCC	2	6	134086	134091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_020562	GAA	2	6	134092	134097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020562	CCG	2	6	134112	134117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_020562	GCC	2	6	134155	134160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_020562	CGC	2	6	134166	134171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_020562	GGC	2	6	134442	134447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_020562	T	6	6	134461	134466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020562	CGG	2	6	134532	134537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_020562	CAT	2	6	134784	134789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_020562	GGC	2	6	134824	134829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_020562	CCT	2	6	136804	136809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_020562	CGC	2	6	136852	136857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_020562	GTT	2	6	136874	136879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020562	ATA	2	6	136909	136914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020562	GC	4	8	137074	137081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_020562	GC	3	6	137141	137146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_020562	GAC	2	6	137161	137166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_020562	AATC	2	8	137185	137192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_020562	AGC	2	6	137258	137263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_020562	TGC	2	6	137335	137340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_020562	TCG	2	6	137343	137348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_020562	GC	3	6	137363	137368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_020562	G	6	6	137384	137389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020562	CAT	2	6	137392	137397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020562	CCG	2	6	137465	137470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_020562	GC	3	6	137493	137498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_020562	CGC	2	6	137681	137686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_020562	AAG	2	6	137710	137715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020562	ATT	2	6	137762	137767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020562	ATC	2	6	137840	137845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_020562	AGCC	2	8	137849	137856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
630	NC_020562	GGA	2	6	137881	137886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020562	TGG	2	6	139204	139209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020562	CACC	2	8	139244	139251	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
633	NC_020562	TCG	2	6	139320	139325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_020562	CG	3	6	139408	139413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_020562	GT	3	6	139520	139525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020562	CG	3	6	139527	139532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_020562	CAC	2	6	139546	139551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_020562	AGCAA	2	10	139560	139569	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
639	NC_020562	CGGAA	2	10	139591	139600	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
640	NC_020562	CAAT	2	8	142144	142151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
641	NC_020562	GT	3	6	142175	142180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020562	GA	3	6	142191	142196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
643	NC_020562	GAT	2	6	142632	142637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_020562	CG	3	6	142681	142686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
645	NC_020562	ATGA	2	8	142708	142715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
646	NC_020562	GAG	2	6	142786	142791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
647	NC_020562	CGGTC	2	10	142818	142827	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
648	NC_020562	GCCG	2	8	142868	142875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
649	NC_020562	CGT	2	6	142893	142898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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651	NC_020562	TC	3	6	142911	142916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
652	NC_020562	TCA	2	6	142958	142963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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662	NC_020562	CGG	2	6	144120	144125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_020562	TCG	2	6	144132	144137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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678	NC_020562	CGCT	2	8	151817	151824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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680	NC_020562	CGG	2	6	151885	151890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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684	NC_020562	TCT	2	6	155661	155666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
685	NC_020562	GAG	2	6	155802	155807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
686	NC_020562	GAT	2	6	157050	157055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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724	NC_020562	GCG	2	6	161980	161985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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742	NC_020562	CGGA	2	8	169171	169178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
743	NC_020562	AAT	2	6	172126	172131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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