MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 9260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020561	GGCAG	2	10	1388848	1388857	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3002	NC_020561	CCG	2	6	1388858	1388863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_020561	ATC	2	6	1388864	1388869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_020561	GCC	2	6	1389849	1389854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_020561	T	6	6	1389952	1389957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_020561	GA	4	8	1389962	1389969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_020561	TAT	2	6	1393217	1393222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_020561	GATGGC	2	12	1393225	1393236	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3009	NC_020561	CTT	2	6	1393282	1393287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_020561	CTCC	2	8	1393288	1393295	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3011	NC_020561	CAC	2	6	1393342	1393347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_020561	CCCG	2	8	1394657	1394664	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3013	NC_020561	GCC	2	6	1396792	1396797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_020561	TCC	2	6	1396802	1396807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_020561	GGCC	2	8	1397735	1397742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_020561	GCA	2	6	1397799	1397804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_020561	ACGG	2	8	1397818	1397825	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_020561	CCG	2	6	1397892	1397897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_020561	CCT	2	6	1398418	1398423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_020561	CA	3	6	1401492	1401497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_020561	TAT	2	6	1401507	1401512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_020561	GC	3	6	1401524	1401529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_020561	CAA	2	6	1401546	1401551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_020561	CCGA	3	12	1402020	1402031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_020561	GCC	2	6	1402090	1402095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_020561	GCC	2	6	1402103	1402108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_020561	GCC	2	6	1404850	1404855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_020561	GGC	2	6	1404880	1404885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_020561	TAT	2	6	1404910	1404915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_020561	GGA	2	6	1407766	1407771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_020561	AAC	2	6	1407820	1407825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_020561	CCG	2	6	1407901	1407906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_020561	GGC	2	6	1409762	1409767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_020561	CGC	2	6	1410052	1410057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_020561	AGC	2	6	1410068	1410073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_020561	CGA	2	6	1410088	1410093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_020561	CGG	2	6	1410120	1410125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_020561	AACGC	2	10	1410253	1410262	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3039	NC_020561	GGCC	2	8	1410278	1410285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_020561	CCG	2	6	1410292	1410297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_020561	ACG	2	6	1410332	1410337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_020561	GGA	2	6	1412615	1412620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_020561	CGC	2	6	1412654	1412659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_020561	GCG	2	6	1412803	1412808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_020561	CGGC	2	8	1412814	1412821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_020561	C	6	6	1412821	1412826	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3047	NC_020561	GCC	4	12	1412836	1412847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_020561	TCC	2	6	1416000	1416005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_020561	TCC	2	6	1416029	1416034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_020561	ATG	2	6	1417152	1417157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_020561	TCC	2	6	1417900	1417905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_020561	GCC	2	6	1420383	1420388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_020561	C	6	6	1420400	1420405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3054	NC_020561	CGACC	2	10	1422510	1422519	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3055	NC_020561	TCGA	2	8	1424706	1424713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_020561	TCC	2	6	1425161	1425166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_020561	GAC	2	6	1425173	1425178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_020561	CT	3	6	1425212	1425217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_020561	CTC	2	6	1425269	1425274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_020561	TGG	2	6	1425288	1425293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_020561	GCC	2	6	1425299	1425304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_020561	AAG	2	6	1425379	1425384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_020561	ATG	2	6	1425416	1425421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_020561	CTT	2	6	1426366	1426371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_020561	AGG	2	6	1426376	1426381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_020561	CGA	2	6	1426418	1426423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_020561	T	6	6	1426491	1426496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_020561	ACC	2	6	1426544	1426549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_020561	CCTTTC	2	12	1426554	1426565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_020561	AGG	2	6	1426590	1426595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_020561	CTT	2	6	1427484	1427489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_020561	AGG	2	6	1427494	1427499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_020561	CGA	2	6	1427536	1427541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_020561	TTTA	2	8	1427609	1427616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_020561	AACG	2	8	1427622	1427629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3076	NC_020561	CG	3	6	1427647	1427652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_020561	CCTT	2	8	1427687	1427694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_020561	CGGAG	2	10	1427719	1427728	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3079	NC_020561	CTT	2	6	1428668	1428673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_020561	AGG	2	6	1428678	1428683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_020561	CGA	2	6	1428720	1428725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_020561	TTTA	2	8	1428793	1428800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_020561	AACG	2	8	1428806	1428813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_020561	CG	3	6	1428831	1428836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_020561	CCTT	2	8	1428871	1428878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_020561	CGGAG	2	10	1428903	1428912	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3087	NC_020561	TGT	2	6	1429845	1429850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_020561	CTT	2	6	1429855	1429860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_020561	AGG	2	6	1429865	1429870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_020561	ACG	2	6	1429906	1429911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_020561	GAA	2	6	1429945	1429950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_020561	GAT	2	6	1429975	1429980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_020561	AAT	2	6	1429996	1430001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_020561	GCA	2	6	1430037	1430042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_020561	AAG	2	6	1430052	1430057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_020561	GCC	2	6	1430155	1430160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_020561	AAT	2	6	1430167	1430172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_020561	AAT	2	6	1430199	1430204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_020561	AGC	2	6	1430336	1430341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_020561	CCG	2	6	1433406	1433411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_020561	A	6	6	1433423	1433428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_020561	CG	3	6	1435217	1435222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_020561	GGC	2	6	1435243	1435248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_020561	CGT	2	6	1435955	1435960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_020561	TCCC	2	8	1436618	1436625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3106	NC_020561	CGG	2	6	1436682	1436687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_020561	CCCG	2	8	1444152	1444159	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3108	NC_020561	CCA	2	6	1446481	1446486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_020561	GC	3	6	1446502	1446507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_020561	GCC	2	6	1448616	1448621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_020561	CCGGC	2	10	1451756	1451765	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3112	NC_020561	AGCG	2	8	1451830	1451837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_020561	CGG	2	6	1452411	1452416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_020561	CGC	2	6	1452419	1452424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_020561	GCC	2	6	1452445	1452450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_020561	CCCG	2	8	1452474	1452481	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3117	NC_020561	TCG	2	6	1452566	1452571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_020561	GATC	2	8	1452596	1452603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_020561	CGG	2	6	1452639	1452644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_020561	CCGC	2	8	1452661	1452668	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3121	NC_020561	CGG	2	6	1455500	1455505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_020561	GCGCC	2	10	1456944	1456953	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3123	NC_020561	GGC	2	6	1456997	1457002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_020561	TGA	2	6	1457008	1457013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_020561	TGCCC	2	10	1457022	1457031	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3126	NC_020561	CG	4	8	1457039	1457046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_020561	TCC	2	6	1458791	1458796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_020561	GGAGG	2	10	1458812	1458821	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_020561	CGG	2	6	1458833	1458838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_020561	TTCC	2	8	1465151	1465158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_020561	GGC	2	6	1465234	1465239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_020561	CTTG	2	8	1465352	1465359	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_020561	GGC	2	6	1465384	1465389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_020561	GC	3	6	1465388	1465393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3135	NC_020561	GCA	2	6	1465442	1465447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_020561	GCC	2	6	1466027	1466032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3137	NC_020561	TTG	2	6	1466066	1466071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_020561	GGACC	2	10	1468054	1468063	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3139	NC_020561	TGC	2	6	1469459	1469464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_020561	CCT	2	6	1469473	1469478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3141	NC_020561	CCCTT	2	10	1469545	1469554	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3142	NC_020561	GGC	2	6	1469562	1469567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3144	NC_020561	CGG	2	6	1470400	1470405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3146	NC_020561	GGAA	2	8	1472094	1472101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3150	NC_020561	CTCC	2	8	1472985	1472992	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3151	NC_020561	C	6	6	1472991	1472996	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3152	NC_020561	CGGC	2	8	1473011	1473018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3153	NC_020561	GCC	2	6	1473045	1473050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3155	NC_020561	TCA	2	6	1474756	1474761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3163	NC_020561	GCCC	2	8	1474981	1474988	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3164	NC_020561	GCT	2	6	1476857	1476862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3192	NC_020561	AT	3	6	1495646	1495651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3202	NC_020561	TCCCC	2	10	1509843	1509852	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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3244	NC_020561	CA	3	6	1542544	1542549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3250	NC_020561	G	6	6	1542969	1542974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_020561	CGTT	2	8	1546427	1546434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3252	NC_020561	CCCG	2	8	1547340	1547347	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3253	NC_020561	GTC	2	6	1547447	1547452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_020561	AGAGG	2	10	1547461	1547470	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_020561	AAG	2	6	1547483	1547488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_020561	CGC	2	6	1548085	1548090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3257	NC_020561	GAAT	2	8	1548092	1548099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_020561	CGC	2	6	1549107	1549112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3259	NC_020561	GGGAC	2	10	1549139	1549148	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3260	NC_020561	GGGCGC	2	12	1549149	1549160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_020561	GGA	2	6	1549246	1549251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_020561	CGG	3	9	1558542	1558550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3263	NC_020561	GCC	2	6	1558564	1558569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3396	NC_020561	ATC	2	6	1609517	1609522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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