MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces davawensis JCM 4913 plasmid pSDA1

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020545	ACG	2	6	4545	4550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020545	GCG	2	6	5243	5248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020545	CGG	2	6	5271	5276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020545	GCC	2	6	7229	7234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020545	GAC	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020545	AGT	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020545	TCG	2	6	8516	8521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020545	CGG	2	6	9317	9322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020545	TCC	2	6	9324	9329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_020545	GCT	2	6	9334	9339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020545	CGC	2	6	9651	9656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_020545	TCG	2	6	10759	10764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020545	TCC	2	6	14424	14429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_020545	CGT	2	6	14435	14440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020545	GCC	2	6	14513	14518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020545	GCC	2	6	14533	14538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_020545	GGC	2	6	14556	14561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020545	CGC	2	6	14636	14641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_020545	CTG	2	6	14664	14669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020545	AGC	2	6	14716	14721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020545	GTC	2	6	16072	16077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020545	GGA	2	6	16114	16119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020545	CAC	2	6	16930	16935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_020545	GCC	2	6	16991	16996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_020545	GTC	3	9	17049	17057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020545	CCG	2	6	17072	17077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_020545	CCG	2	6	17261	17266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_020545	GCC	2	6	18136	18141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020545	GCT	2	6	19229	19234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020545	CTC	2	6	19254	19259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_020545	GGC	2	6	19864	19869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020545	TCC	2	6	19915	19920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020545	CTC	2	6	20094	20099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020545	GCA	2	6	20417	20422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020545	GTT	2	6	22661	22666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020545	CAG	2	6	22755	22760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020545	GCC	2	6	22774	22779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_020545	TGC	2	6	23016	23021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020545	CCA	2	6	23045	23050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020545	CAA	2	6	23051	23056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020545	CAG	2	6	23106	23111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020545	AAG	2	6	25268	25273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020545	CTT	2	6	25312	25317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020545	GCG	2	6	26473	26478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020545	CGA	2	6	29989	29994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020545	GGC	2	6	30009	30014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020545	CCT	2	6	30744	30749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_020545	AGT	2	6	30751	30756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020545	CGG	2	6	32351	32356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020545	AGA	2	6	32365	32370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020545	GTC	2	6	33055	33060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020545	CGG	2	6	33152	33157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020545	ATG	2	6	33158	33163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020545	GCC	2	6	33265	33270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_020545	GCT	2	6	33788	33793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020545	CGG	2	6	33838	33843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020545	TCC	2	6	33871	33876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020545	CGT	2	6	33913	33918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020545	CGG	2	6	33927	33932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020545	GGC	2	6	33950	33955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020545	CGC	2	6	33968	33973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020545	GTA	2	6	34290	34295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020545	GCT	2	6	35114	35119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020545	GAT	2	6	36197	36202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020545	CAG	2	6	36206	36211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020545	CGG	3	9	36214	36222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020545	GGT	3	9	36239	36247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020545	TGG	2	6	36303	36308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020545	GGC	2	6	38482	38487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020545	GCC	2	6	38502	38507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020545	TCC	2	6	38964	38969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_020545	TCC	2	6	41063	41068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_020545	CGG	2	6	41101	41106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020545	CGG	2	6	41134	41139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020545	CGC	2	6	41157	41162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_020545	CCG	3	9	41186	41194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020545	GTC	2	6	41197	41202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020545	GTC	2	6	41206	41211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020545	CCG	2	6	41311	41316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_020545	TCC	2	6	42137	42142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_020545	TGG	2	6	42151	42156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020545	GCA	2	6	42181	42186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020545	GCC	2	6	44401	44406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_020545	GCG	2	6	44415	44420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020545	CTC	2	6	44807	44812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020545	CGG	2	6	44838	44843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020545	GCC	2	6	44881	44886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_020545	CGG	2	6	44892	44897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020545	GTG	2	6	45363	45368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020545	CGT	2	6	45842	45847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020545	TGG	2	6	45860	45865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020545	AGC	2	6	45951	45956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020545	TGG	2	6	46961	46966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020545	GGT	2	6	47012	47017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020545	GCC	2	6	47054	47059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_020545	CCT	2	6	47132	47137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_020545	AAG	2	6	47151	47156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020545	GAT	2	6	47166	47171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020545	GCA	2	6	49900	49905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020545	AGA	2	6	50069	50074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020545	GCA	2	6	50082	50087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020545	GCC	2	6	50119	50124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_020545	GCC	2	6	50127	50132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_020545	CGG	2	6	50150	50155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020545	CAC	2	6	50189	50194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_020545	GCG	2	6	50202	50207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020545	TCG	2	6	50326	50331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020545	CGA	2	6	50338	50343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020545	CGG	2	6	51910	51915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020545	GCT	2	6	51960	51965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020545	TCT	2	6	52038	52043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020545	GTG	2	6	52092	52097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020545	CCG	2	6	52404	52409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020545	GCG	2	6	52523	52528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020545	CTG	2	6	52530	52535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020545	GGA	2	6	52631	52636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020545	GCC	2	6	52653	52658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_020545	AGG	2	6	52737	52742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020545	CGT	2	6	52744	52749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020545	ACG	2	6	52758	52763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020545	AGC	2	6	52841	52846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020545	GCT	2	6	52877	52882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020545	GCC	2	6	52920	52925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_020545	GCT	2	6	53044	53049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020545	GTC	2	6	53091	53096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020545	TGC	2	6	53107	53112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020545	CGG	2	6	53185	53190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020545	CAG	2	6	53191	53196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020545	GGC	2	6	55804	55809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020545	CGG	2	6	55819	55824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020545	GCG	2	6	55831	55836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020545	GGA	2	6	55844	55849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020545	CCG	3	9	55892	55900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_020545	GCT	3	9	55928	55936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020545	GCG	2	6	57617	57622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020545	ACA	2	6	57676	57681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020545	TTC	2	6	58334	58339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020545	CAC	2	6	58372	58377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_020545	GCA	2	6	58410	58415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020545	CAG	2	6	59462	59467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_020545	CGG	2	6	59522	59527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020545	GAG	2	6	59573	59578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_020545	CCT	2	6	77779	77784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_020545	GTG	2	6	77811	77816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_020545	GGC	2	6	77857	77862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_020545	CCG	2	6	77869	77874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.