MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP0

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020542	CATCG	2	10	1241	1250	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020542	AGCGC	2	10	1260	1269	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_020542	GTGTT	2	10	1939	1948	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020542	CCCCT	2	10	2223	2232	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_020542	CCCTC	2	10	3144	3153	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_020542	AGCGC	2	10	3586	3595	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_020542	CCTGA	2	10	3721	3730	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_020542	CGCCC	2	10	28482	28491	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_020542	CTGCC	2	10	29375	29384	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_020542	AAATC	2	10	34794	34803	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020542	CGGCT	2	10	54612	54621	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_020542	TGGCC	2	10	54648	54657	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020542	CGCGC	2	10	56799	56808	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_020542	TGTCG	2	10	58530	58539	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020542	GCTGG	2	10	72429	72438	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020542	GATAT	2	10	74944	74953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020542	ATTCT	2	10	101526	101535	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020542	GGACG	2	10	102976	102985	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020542	GGCGC	2	10	105523	105532	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_020542	GGCCA	2	10	107675	107684	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_020542	AGCCG	2	10	107711	107720	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_020542	CGTCC	2	10	110153	110162	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_020542	GGCGC	2	10	111630	111639	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_020542	CGATC	2	10	113776	113785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020542	GCCGG	2	10	115411	115420	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_020542	GTCGG	2	10	116797	116806	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020542	GGCCG	2	10	117849	117858	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_020542	CGGCC	2	10	118864	118873	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_020542	GGGCC	2	10	121443	121452	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_020542	TCTCC	2	10	122449	122458	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_020542	TCCGC	2	10	142736	142745	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_020542	ACGGC	2	10	145129	145138	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_020542	CTGCG	2	10	148883	148892	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_020542	GCGCG	2	10	149839	149848	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_020542	CGCTG	2	10	251545	251554	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_020542	ATCGA	2	10	251575	251584	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020542	ACTCA	2	10	254814	254823	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_020542	GCTCG	2	10	256678	256687	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_020542	CGCGA	2	10	269553	269562	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.