MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020540	AGTGTA	2	12	21880	21891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020540	ACTAAT	2	12	21908	21919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020540	TATTTT	2	12	58750	58761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020540	AAATTA	2	12	67463	67474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020540	ATTGAA	2	12	70537	70548	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020540	AGTGTA	2	12	78685	78696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020540	ACTAAT	2	12	78713	78724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020540	TTCGGG	2	12	79655	79666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020540	ATAAAA	2	12	106812	106823	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020540	AATAGC	2	12	124733	124744	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020540	AGATAA	2	12	128851	128862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020540	CTTTAT	2	12	154538	154549	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020540	CTCTTT	2	12	156402	156413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020540	GGTGTT	2	12	159468	159479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020540	TGACAC	2	12	183265	183276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020540	CAGTTC	2	12	187904	187915	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020540	TTTAAA	2	12	189753	189764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020540	CTTTTG	2	12	215437	215448	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020540	AAACAT	2	12	260997	261008	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020540	ATAAAA	2	12	261203	261214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020540	TTTAAC	2	12	273395	273406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020540	AGTGTA	2	12	288531	288542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020540	ACTAAT	2	12	288559	288570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020540	TTAAAA	2	12	310300	310311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020540	TTTAAT	2	12	327378	327389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020540	TTTTAG	2	12	341382	341393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020540	AAGACC	2	12	356525	356536	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020540	GCTTTG	2	12	370184	370195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020540	ATTTAA	2	12	391338	391349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020540	GTTAAA	2	12	415349	415360	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020540	TCCTTT	2	12	417414	417425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020540	AGAAAT	2	12	424557	424568	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020540	ATTTTA	2	12	455842	455853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020540	GAGTAA	2	12	461631	461642	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020540	TAAAAA	2	12	477546	477557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020540	AGGACT	2	12	482669	482680	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020540	TAAAAA	2	12	502077	502088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020540	AAAAGA	2	12	502260	502271	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020540	TCAGGT	2	12	569596	569607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020540	CCTTGT	2	12	578382	578393	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020540	ACGTAA	2	12	619336	619347	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020540	TAAATA	2	12	692318	692329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020540	AGGTAA	2	12	703118	703129	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020540	TTCGGG	2	12	738191	738202	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020540	GAAAAA	2	12	792002	792013	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020540	TTATCA	2	12	826016	826027	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020540	ATGTTA	2	12	862913	862924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020540	TTAAAA	2	12	866620	866631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020540	TCCCAA	2	12	977313	977324	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020540	TTTAAA	2	12	980859	980870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020540	AGTCTT	2	12	983720	983731	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020540	TTGTTT	2	12	1048237	1048248	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020540	ATATGA	2	12	1081796	1081807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020540	AGTCTT	2	12	1097841	1097852	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020540	TCTTTT	2	12	1125110	1125121	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020540	CCTTGG	2	12	1157113	1157124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020540	TCTGGA	2	12	1180512	1180523	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020540	TCTGCT	2	12	1189823	1189834	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020540	AAATTT	2	12	1195025	1195036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020540	TGACTT	2	12	1213655	1213666	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020540	ATGATA	2	12	1220162	1220173	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020540	TAGAAT	2	12	1230006	1230017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020540	AGCAGA	2	12	1258682	1258693	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020540	TCCTTC	2	12	1299595	1299606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020540	AATGTT	2	12	1303274	1303285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020540	TATTAG	2	12	1305071	1305082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020540	TACACT	2	12	1305100	1305111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020540	GAAAAA	2	12	1310538	1310549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020540	CAATTC	2	12	1329627	1329638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020540	TATTTT	2	12	1330701	1330712	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020540	AATACC	2	12	1339719	1339730	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020540	CTTTTC	2	12	1390093	1390104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020540	GGATTA	2	12	1426122	1426133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020540	ATATTT	2	12	1432518	1432529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020540	GGTTTT	2	12	1432680	1432691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020540	TTCCTT	2	12	1441166	1441177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020540	AACAAT	2	12	1453105	1453116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020540	TACAAT	2	12	1478053	1478064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020540	ATTCCA	2	12	1481927	1481938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020540	CTAGTC	2	12	1533195	1533206	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020540	AATATT	2	12	1551703	1551714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020540	TTTGCT	2	12	1567448	1567459	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_020540	TAACAA	2	12	1582721	1582732	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020540	TTTTTC	2	12	1585107	1585118	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020540	AGAAAA	2	12	1587803	1587814	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020540	TATTAG	2	12	1594133	1594144	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020540	TACACT	2	12	1594162	1594173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020540	TTGCCA	2	12	1621974	1621985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020540	TCCGTA	2	12	1633987	1633998	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020540	TAAAAA	2	12	1655880	1655891	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020540	GAGCCA	2	12	1685819	1685830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020540	CCTTTA	2	12	1705309	1705320	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020540	AAAACC	2	12	1720242	1720253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020540	TTAATA	2	12	1748068	1748079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020540	ATTTTA	2	12	1758492	1758503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020540	TTTTCA	2	12	1765686	1765697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020540	TAAAAA	2	12	1777666	1777677	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020540	AATTTA	3	18	1789138	1789155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020540	GAAAAA	2	12	1826888	1826899	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.