MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020540	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020540	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020540	TTTA	2	8	1663	1670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020540	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020540	TTGA	2	8	3450	3457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020540	GAAC	2	8	8784	8791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020540	TACT	2	8	16576	16583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020540	AAAT	2	8	17019	17026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020540	ACCT	2	8	17193	17200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020540	GTGA	2	8	17474	17481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020540	TAAC	2	8	17557	17564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020540	AGCG	2	8	17645	17652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020540	TGGT	2	8	18310	18317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020540	AGCC	2	8	18527	18534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020540	AGCG	2	8	18873	18880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020540	GTAA	2	8	19123	19130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020540	ACTA	2	8	19165	19172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020540	GAAG	2	8	19205	19212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020540	GCGA	2	8	19279	19286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020540	ATTC	2	8	20145	20152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020540	CTAA	2	8	20501	20508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020540	TAGG	2	8	21156	21163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020540	TTGG	2	8	21339	21346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020540	AATC	2	8	21348	21355	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020540	GCGT	2	8	23195	23202	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020540	TAAA	2	8	23718	23725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020540	GTTA	2	8	24058	24065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020540	ATTC	2	8	24858	24865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020540	ATTA	2	8	27643	27650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020540	AACA	2	8	29697	29704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020540	TTAG	2	8	29857	29864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020540	GGAA	2	8	30724	30731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020540	AGAA	2	8	34619	34626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020540	TAGT	2	8	37259	37266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020540	AAAG	2	8	38013	38020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020540	AGAA	2	8	42438	42445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020540	GATT	2	8	49539	49546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020540	AAAG	2	8	52329	52336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020540	TATT	2	8	61324	61331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020540	AAGA	2	8	63209	63216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020540	TCGT	2	8	63550	63557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020540	TAAA	2	8	64986	64993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020540	TTAA	2	8	65226	65233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020540	TATT	2	8	69737	69744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020540	ACAA	2	8	70860	70867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020540	AAAT	2	8	73824	73831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020540	CGTA	2	8	73990	73997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020540	ACCT	2	8	73998	74005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020540	GTGA	2	8	74279	74286	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020540	TAAC	2	8	74362	74369	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020540	AGCG	2	8	74450	74457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020540	TGGT	2	8	75115	75122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020540	AGCC	2	8	75332	75339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020540	AGCG	2	8	75678	75685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020540	GTAA	2	8	75928	75935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020540	ACTA	2	8	75970	75977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020540	GAAG	2	8	76010	76017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020540	GCGA	2	8	76084	76091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020540	ATTC	2	8	76950	76957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020540	CTAA	2	8	77306	77313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020540	TAGG	2	8	77961	77968	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020540	TTGG	2	8	78144	78151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020540	AATC	2	8	78153	78160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020540	GCGT	2	8	79382	79389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020540	TGAT	2	8	80723	80730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020540	AAAT	2	8	80762	80769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020540	CAAT	2	8	80897	80904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020540	TTGC	2	8	81304	81311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020540	AAAC	2	8	81668	81675	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020540	CAAT	2	8	91738	91745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020540	TACG	2	8	98897	98904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020540	GATA	2	8	98905	98912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020540	TAAG	2	8	104533	104540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020540	TCTA	2	8	111187	111194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020540	CTTT	2	8	120679	120686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020540	TAAA	2	8	124957	124964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020540	GTCA	2	8	126074	126081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020540	TATC	2	8	126841	126848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020540	TTAA	2	8	128699	128706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020540	TTAG	2	8	133834	133841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020540	GCTT	2	8	137818	137825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020540	GAAA	2	8	140089	140096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020540	CCTG	2	8	140309	140316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020540	TAGT	2	8	141803	141810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020540	ATTA	2	8	149032	149039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020540	TAGC	2	8	149100	149107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020540	TAGC	2	8	149354	149361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020540	ATAA	2	8	149435	149442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020540	AAAT	2	8	149939	149946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020540	AAAT	2	8	150008	150015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020540	GGAT	2	8	159585	159592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020540	AGTC	2	8	161404	161411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020540	ATAG	2	8	168977	168984	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020540	CGTG	2	8	169458	169465	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020540	TAAA	2	8	169978	169985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020540	ATCA	2	8	170102	170109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020540	ATAA	2	8	170473	170480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020540	TTAG	2	8	175381	175388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020540	AACT	2	8	176477	176484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020540	AATC	2	8	176709	176716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020540	ATGG	2	8	178176	178183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020540	AAGA	2	8	181610	181617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020540	TTTA	2	8	185123	185130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020540	AGTA	2	8	185933	185940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020540	TAGA	2	8	186272	186279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020540	GATT	2	8	189673	189680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020540	AGGG	2	8	189801	189808	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020540	ATCA	2	8	190051	190058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020540	TAAT	2	8	200239	200246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020540	TTCG	2	8	200606	200613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020540	GTCT	2	8	200677	200684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020540	TACT	2	8	200878	200885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020540	TTAA	2	8	201793	201800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020540	AGTA	2	8	207184	207191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020540	AGAA	2	8	209516	209523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020540	ACCA	2	8	213109	213116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020540	AAAG	2	8	213969	213976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020540	AGGC	2	8	214004	214011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020540	GCAA	2	8	218202	218209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020540	TTGC	2	8	218224	218231	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020540	ACAA	2	8	219658	219665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020540	TTGA	2	8	219800	219807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020540	CTTT	2	8	220816	220823	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020540	TTTC	2	8	233982	233989	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020540	GAAA	2	8	240797	240804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020540	GCAA	2	8	240888	240895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020540	TAGC	2	8	250051	250058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020540	TCAA	2	8	255775	255782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020540	GAAA	2	8	256604	256611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020540	TCTT	2	8	258164	258171	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020540	TTTC	2	8	259300	259307	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020540	TGAT	2	8	259657	259664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020540	AAAG	2	8	259871	259878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020540	CAAA	2	8	260987	260994	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020540	TAAA	2	8	261045	261052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020540	AATA	2	8	261061	261068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020540	TTAA	2	8	261303	261310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020540	TTTA	2	8	268018	268025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020540	GGTT	2	8	268440	268447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020540	TTTG	2	8	268482	268489	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020540	TTAA	2	8	268493	268500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020540	AATA	2	8	270710	270717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020540	ATTG	2	8	275677	275684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020540	CAAA	2	8	275745	275752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020540	TAAA	2	8	275960	275967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020540	TAAA	2	8	276073	276080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020540	CATT	2	8	283355	283362	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020540	ACCT	2	8	283844	283851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020540	GTGA	2	8	284125	284132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020540	TAAC	2	8	284208	284215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020540	AGCG	2	8	284296	284303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_020540	TGGT	2	8	284961	284968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020540	AGCC	2	8	285178	285185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020540	AGCG	2	8	285524	285531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_020540	AAAT	2	8	310364	310371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020540	TTTC	2	8	311146	311153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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182	NC_020540	TAGT	2	8	329159	329166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_020540	AAGC	2	8	1122947	1122954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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