MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 7044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020540	TAT	2	6	1827030	1827035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_020540	GATT	2	8	1827040	1827047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_020540	T	8	8	1827046	1827053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_020540	T	6	6	1827062	1827067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_020540	A	8	8	1827068	1827075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_020540	T	8	8	1827081	1827088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_020540	GTCAA	2	10	1827101	1827110	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7008	NC_020540	GAA	2	6	1827194	1827199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_020540	GTC	2	6	1827200	1827205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_020540	TTC	2	6	1827243	1827248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_020540	GAG	2	6	1827294	1827299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_020540	CT	3	6	1827323	1827328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7013	NC_020540	GAA	2	6	1827334	1827339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_020540	TAAAC	2	10	1827384	1827393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7015	NC_020540	GATG	2	8	1827414	1827421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_020540	ACTG	2	8	1827431	1827438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7017	NC_020540	TCT	2	6	1827481	1827486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_020540	AATC	2	8	1827562	1827569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7019	NC_020540	AT	3	6	1827600	1827605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_020540	TTC	2	6	1827614	1827619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_020540	TCT	2	6	1827637	1827642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_020540	CTA	2	6	1827724	1827729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_020540	GAA	2	6	1827747	1827752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_020540	GTTT	2	8	1827754	1827761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_020540	TTTC	2	8	1827858	1827865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7026	NC_020540	AGC	2	6	1827879	1827884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_020540	GAT	2	6	1827922	1827927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_020540	T	6	6	1828010	1828015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_020540	T	6	6	1828060	1828065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_020540	AAAT	2	8	1828068	1828075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_020540	ATG	2	6	1828105	1828110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_020540	CTG	2	6	1828180	1828185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_020540	A	6	6	1828197	1828202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_020540	T	7	7	1828218	1828224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_020540	T	7	7	1828267	1828273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_020540	TAT	2	6	1828300	1828305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_020540	TAA	2	6	1828307	1828312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_020540	AGTT	2	8	1828322	1828329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_020540	ACT	2	6	1828891	1828896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_020540	TTA	2	6	1828922	1828927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_020540	AAAAG	2	10	1828931	1828940	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_020540	CTTTT	2	10	1828962	1828971	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7043	NC_020540	T	8	8	1828968	1828975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_020540	GGA	2	6	1829027	1829032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.