MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI8T7 complete sequence

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020539	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020539	GTG	2	6	95	100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020539	TCA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020539	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020539	TTA	2	6	189	194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020539	GCT	2	6	761	766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020539	TTC	2	6	827	832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020539	CTT	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020539	ATC	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020539	TCA	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020539	CTT	2	6	3162	3167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020539	ACC	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_020539	ATG	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020539	TTC	2	6	3391	3396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020539	ATC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020539	TAT	2	6	3474	3479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020539	TCA	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020539	ATA	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020539	AAT	2	6	3617	3622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020539	ATT	2	6	3721	3726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020539	TGA	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020539	TAT	2	6	3816	3821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020539	ATA	2	6	3888	3893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020539	ATA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020539	ATA	2	6	3949	3954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020539	AAG	2	6	6809	6814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020539	TCA	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020539	AGA	2	6	6918	6923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020539	TAA	2	6	6957	6962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020539	GAA	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020539	GAA	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020539	ATA	2	6	7097	7102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020539	TTA	2	6	7126	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020539	TAA	2	6	7144	7149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020539	TTG	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020539	ATT	2	6	8711	8716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020539	TAA	2	6	8729	8734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020539	TAA	2	6	8790	8795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020539	TAT	3	9	8916	8924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020539	ACA	2	6	8997	9002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020539	ATT	2	6	9415	9420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020539	GTA	3	9	9477	9485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020539	ATA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020539	AAT	2	6	10180	10185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020539	ATT	2	6	10304	10309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020539	ACT	2	6	10325	10330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020539	ATT	2	6	11948	11953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020539	TAA	2	6	11985	11990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020539	TAA	2	6	12008	12013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020539	TTA	2	6	12015	12020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020539	TAA	2	6	12025	12030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020539	GAT	2	6	12041	12046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020539	GAT	2	6	12755	12760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020539	TTC	2	6	12816	12821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020539	TGA	2	6	12856	12861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020539	TAC	2	6	13781	13786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020539	ACT	2	6	13794	13799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020539	GTG	2	6	13854	13859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020539	TAA	2	6	13993	13998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020539	TAT	2	6	14041	14046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020539	TTA	2	6	14103	14108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020539	ATC	2	6	15136	15141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020539	TGA	2	6	15154	15159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020539	CGA	2	6	15160	15165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020539	TGG	2	6	15228	15233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020539	TGA	2	6	15303	15308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020539	GAA	3	9	15325	15333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020539	ATT	3	9	15377	15385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020539	AAT	2	6	15464	15469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020539	TTA	2	6	15471	15476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020539	ATT	2	6	15541	15546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020539	AAT	2	6	15551	15556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020539	TGA	2	6	15577	15582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020539	TTG	2	6	15702	15707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020539	GTT	2	6	16288	16293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020539	AAT	2	6	16315	16320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020539	TCT	2	6	16352	16357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020539	GTT	2	6	16389	16394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020539	GAT	3	9	16419	16427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020539	GAA	2	6	16440	16445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020539	GAC	2	6	16476	16481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020539	GAA	2	6	16514	16519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020539	ATT	2	6	16649	16654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020539	CTG	2	6	16726	16731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020539	TTA	2	6	16761	16766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020539	TTA	2	6	16773	16778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020539	TAT	2	6	16847	16852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020539	ATA	2	6	17073	17078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020539	TCT	2	6	17160	17165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020539	TTG	2	6	17214	17219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020539	TAT	2	6	17245	17250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020539	TTA	3	9	17271	17279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020539	AGA	2	6	17413	17418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020539	TGA	2	6	17461	17466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020539	GAA	2	6	17467	17472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020539	AGA	2	6	17500	17505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020539	CAT	2	6	17564	17569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020539	ATT	2	6	17628	17633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020539	TTA	2	6	17634	17639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020539	TCT	2	6	17707	17712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020539	ATA	2	6	17887	17892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020539	CTA	2	6	17893	17898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020539	ATA	2	6	17920	17925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020539	AAC	2	6	17956	17961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020539	ATG	2	6	18068	18073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020539	TTC	2	6	18284	18289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020539	CGT	2	6	18321	18326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020539	AAT	2	6	18459	18464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020539	TCT	2	6	18600	18605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020539	ATA	2	6	18872	18877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020539	TCA	2	6	19032	19037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020539	CAA	2	6	19963	19968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020539	TAT	2	6	20668	20673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020539	TAT	2	6	20756	20761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020539	GAA	3	9	20810	20818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020539	ACC	2	6	20852	20857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_020539	GTT	2	6	20924	20929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020539	TGA	2	6	20931	20936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020539	TTA	2	6	20996	21001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020539	GAC	2	6	21263	21268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020539	ATG	2	6	21477	21482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020539	CAC	2	6	21627	21632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_020539	GTG	2	6	21658	21663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020539	TAA	3	9	22277	22285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020539	GGA	2	6	22307	22312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020539	AGT	2	6	23005	23010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020539	TGA	2	6	23032	23037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020539	TAA	2	6	23059	23064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020539	TGA	2	6	23237	23242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020539	TCT	2	6	23257	23262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020539	GAC	2	6	23303	23308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020539	TAA	2	6	23348	23353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020539	TCA	2	6	23443	23448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020539	TTG	2	6	23458	23463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020539	TAG	2	6	23605	23610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020539	ATT	2	6	23657	23662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020539	TCT	2	6	23733	23738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.