MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020536	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020536	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020536	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020536	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020536	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020536	TTTCA	2	10	34313	34322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020536	TAAAA	2	10	35766	35775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020536	AGATA	2	10	35924	35933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020536	ATGAG	2	10	37186	37195	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020536	CAAAA	2	10	38214	38223	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020536	TTTGT	2	10	43592	43601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020536	TTTTG	2	10	45238	45247	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020536	AAGTA	2	10	56410	56419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020536	TTTTA	2	10	56774	56783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020536	CATTT	2	10	62395	62404	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020536	TTTTA	2	10	65255	65264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020536	GTGTT	2	10	71063	71072	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020536	ATTCA	2	10	73655	73664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020536	ATATA	2	10	81101	81110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020536	GTAAT	2	10	95751	95760	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020536	AGATG	2	10	102347	102356	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020536	ATTTT	2	10	117899	117908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020536	TTGTA	2	10	134181	134190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020536	TGATT	2	10	160237	160246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020536	CAAAA	2	10	160490	160499	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020536	CAAAA	2	10	162601	162610	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020536	TAAAG	2	10	162950	162959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020536	TATCA	2	10	172978	172987	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020536	ATCAT	2	10	181110	181119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020536	CAACT	2	10	193242	193251	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_020536	GCTTT	2	10	197754	197763	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020536	TGAAG	2	10	197956	197965	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020536	AAAAT	2	10	198027	198036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020536	TGATT	2	10	198100	198109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020536	GAAAA	2	10	208748	208757	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020536	TAACA	2	10	209119	209128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020536	AATAT	2	10	228314	228323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020536	TATTG	2	10	231518	231527	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020536	TATTT	2	10	234305	234314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020536	AATTG	2	10	240018	240027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020536	AACAT	2	10	242648	242657	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020536	GATAA	2	10	246585	246594	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020536	ATAAC	2	10	251232	251241	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020536	TGAAT	2	10	251343	251352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020536	ATTAA	2	10	251484	251493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020536	AAAGT	2	10	255228	255237	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020536	AATTA	2	10	255341	255350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020536	TAAAA	2	10	256941	256950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020536	AAATT	2	10	258257	258266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020536	TAAAA	2	10	272403	272412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020536	GAAAA	2	10	280193	280202	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020536	ATAAA	2	10	280311	280320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020536	TCATA	2	10	288773	288782	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_020536	ATTTA	2	10	302696	302705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020536	ACTCG	2	10	306557	306566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_020536	AATTT	2	10	312968	312977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020536	AATTA	2	10	314349	314358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020536	TAAAT	2	10	333450	333459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020536	ATTTT	2	10	339007	339016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020536	AGCCA	2	10	339331	339340	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_020536	ATAGA	2	10	345249	345258	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020536	TGACA	2	10	345441	345450	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020536	AAGAT	2	10	346500	346509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020536	GATAA	2	10	357746	357755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020536	TAAAA	2	10	369186	369195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020536	TTGTT	2	10	369491	369500	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020536	TATCA	3	15	372488	372502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020536	GAATG	2	10	386750	386759	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020536	AGATA	2	10	393620	393629	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020536	AGAAT	2	10	393861	393870	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020536	TAAGG	2	10	393925	393934	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020536	ATTGT	2	10	395144	395153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020536	TAAAT	2	10	401383	401392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020536	AGATA	2	10	401486	401495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020536	ACAGT	2	10	405477	405486	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020536	CATAA	2	10	415961	415970	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_020536	TAAAA	2	10	416185	416194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020536	AAAGT	2	10	429138	429147	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020536	AAATT	2	10	432317	432326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020536	GAAAA	2	10	443012	443021	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020536	ATAGC	2	10	443879	443888	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020536	TGAAA	2	10	443893	443902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020536	AATGC	2	10	443996	444005	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020536	TAAAG	2	10	444089	444098	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020536	CTCAC	2	10	445994	446003	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_020536	CAAAG	2	10	446019	446028	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020536	CTTAA	2	10	463645	463654	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020536	TGGTG	2	10	481464	481473	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020536	CAACT	2	10	482035	482044	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_020536	TCGTG	2	10	483328	483337	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020536	TTAAT	2	10	483969	483978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020536	GATTG	2	10	485771	485780	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020536	GATTT	2	10	490700	490709	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020536	TCTGT	2	10	492877	492886	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020536	ATATA	2	10	493118	493127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020536	CAAAG	2	10	499666	499675	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020536	ATGGT	2	10	502100	502109	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020536	CATTA	2	10	502550	502559	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020536	TTGAT	2	10	502827	502836	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020536	AAAAG	2	10	514043	514052	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020536	AGACA	2	10	516809	516818	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020536	AAGTA	2	10	519244	519253	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020536	TTAAA	2	10	521367	521376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020536	GATAA	2	10	521406	521415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020536	GGTAA	2	10	526938	526947	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020536	TCGTG	2	10	527757	527766	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_020536	GATTG	2	10	530063	530072	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020536	ATATA	2	10	536677	536686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020536	AAAAT	2	10	541452	541461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020536	TTTAT	2	10	541561	541570	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020536	TTATG	2	10	544567	544576	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020536	ATTTA	2	10	544712	544721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020536	ACAAT	2	10	546517	546526	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_020536	AAATA	2	10	549006	549015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020536	TGAAT	2	10	550984	550993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020536	GTATA	2	10	551041	551050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020536	TATAA	2	10	554758	554767	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020536	GTTTA	2	10	570901	570910	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020536	TAAAG	2	10	575095	575104	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020536	GAAGC	2	10	576451	576460	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020536	ATATT	2	10	581232	581241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020536	TTAAC	2	10	584144	584153	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_020536	AATTT	2	10	584229	584238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020536	ATAAA	2	10	592552	592561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020536	TAAAA	2	10	608017	608026	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020536	TTATA	2	10	608450	608459	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020536	CACAT	2	10	608846	608855	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_020536	AGCAG	2	10	610646	610655	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_020536	GTAAA	2	10	610855	610864	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020536	ATGAT	2	10	617869	617878	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020536	TAATT	2	10	621356	621365	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020536	TAAAT	2	10	630757	630766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020536	AAATT	2	10	632761	632770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020536	TAAAA	2	10	639656	639665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020536	CTATC	2	10	640458	640467	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_020536	ATTAA	2	10	641844	641853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020536	TTATT	2	10	641893	641902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020536	CAATA	2	10	641959	641968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_020536	TTAAT	2	10	644585	644594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020536	AAATA	2	10	646850	646859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020536	ATTTT	2	10	646872	646881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020536	ATAAA	2	10	653564	653573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020536	TTTTA	2	10	657350	657359	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020536	AAAGG	2	10	657671	657680	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020536	ATATA	2	10	660908	660917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020536	AAACT	2	10	664433	664442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_020536	TTCAC	2	10	669646	669655	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_020536	TTTGT	2	10	673552	673561	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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