MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020536	ATTC	2	8	720330	720337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_020536	ATTTA	2	10	720378	720387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_020536	TAA	2	6	720404	720409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020536	TAA	2	6	720449	720454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020536	AAAGT	2	10	720471	720480	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020536	TGAA	2	8	720520	720527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020536	CAG	2	6	720565	720570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_020536	TAA	2	6	720683	720688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020536	TTC	2	6	720722	720727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_020536	GTT	2	6	720738	720743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020536	TCA	2	6	720768	720773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_020536	GTT	2	6	720828	720833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020536	TCT	2	6	720849	720854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_020536	TAG	2	6	720869	720874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_020536	T	6	6	720889	720894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_020536	ATTA	2	8	720934	720941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_020536	A	6	6	720976	720981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_020536	TGT	2	6	721000	721005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_020536	AGA	2	6	721064	721069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_020536	A	6	6	721096	721101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_020536	TAAAG	2	10	722306	722315	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_020536	ATGA	2	8	722325	722332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_020536	TTA	2	6	722357	722362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_020536	A	6	6	722442	722447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020536	TAA	2	6	722458	722463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020536	GAT	2	6	722535	722540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020536	A	6	6	722541	722546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020536	A	6	6	722580	722585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020536	TTG	2	6	722600	722605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020536	GTTT	2	8	722620	722627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020536	TTA	2	6	722635	722640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020536	CAA	2	6	722648	722653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_020536	TGAA	2	8	722780	722787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020536	AAAT	2	8	722829	722836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_020536	AGAA	2	8	722916	722923	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_020536	ATA	2	6	723010	723015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_020536	ATA	2	6	723021	723026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_020536	AAT	2	6	723071	723076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_020536	ATG	2	6	723108	723113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_020536	GAA	2	6	723173	723178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_020536	AACG	2	8	723215	723222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_020536	AGA	2	6	723281	723286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_020536	GCT	2	6	723429	723434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_020536	TTGG	2	8	723435	723442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_020536	AGA	2	6	723445	723450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_020536	GTG	2	6	723502	723507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_020536	ATGA	2	8	723586	723593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_020536	TAA	2	6	723595	723600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_020536	CAA	2	6	723601	723606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_020536	TTGA	2	8	723679	723686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_020536	ATG	2	6	727494	727499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_020536	AT	3	6	727549	727554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_020536	TTTTTA	2	12	727646	727657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_020536	ATGA	2	8	727663	727670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_020536	T	6	6	727698	727703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_020536	TAAA	2	8	727775	727782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_020536	TAT	2	6	729035	729040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_020536	T	7	7	729062	729068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_020536	AT	3	6	730554	730559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_020536	TGGT	2	8	730590	730597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_020536	T	7	7	730600	730606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_020536	T	6	6	730671	730676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_020536	TTG	2	6	730707	730712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_020536	GA	3	6	730756	730761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020536	AAAT	2	8	731657	731664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_020536	TAAA	2	8	731718	731725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_020536	A	7	7	732726	732732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_020536	CTT	2	6	732753	732758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_020536	ATTTT	2	10	732771	732780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_020536	ATAA	2	8	732781	732788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_020536	ATATCA	2	12	734397	734408	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4072	NC_020536	CTT	2	6	734428	734433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_020536	GTT	2	6	734448	734453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_020536	TTCT	2	8	734995	735002	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_020536	TG	3	6	735009	735014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_020536	TA	3	6	735020	735025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_020536	AAAC	2	8	735105	735112	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_020536	A	7	7	735123	735129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_020536	TA	4	8	735172	735179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_020536	A	6	6	735183	735188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_020536	G	6	6	735213	735218	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_020536	TGT	2	6	735295	735300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_020536	ATT	2	6	735326	735331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_020536	GCC	2	6	735342	735347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_020536	T	6	6	735363	735368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_020536	TCA	2	6	735385	735390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4088	NC_020536	T	6	6	735484	735489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_020536	TGA	2	6	735519	735524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_020536	TAGT	2	8	735529	735536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_020536	GTTTT	2	10	735617	735626	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_020536	TCT	2	6	735646	735651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_020536	T	6	6	735659	735664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_020536	GAATTA	2	12	735691	735702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_020536	A	6	6	735748	735753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_020536	CTC	2	6	735773	735778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_020536	TTC	2	6	735781	735786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_020536	TAAGT	2	10	735794	735803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_020536	ATA	2	6	735819	735824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_020536	GAA	2	6	735874	735879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_020536	AAT	2	6	735882	735887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_020536	TGAAAA	2	12	735889	735900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_020536	TAAA	2	8	735914	735921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_020536	AGG	2	6	735938	735943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_020536	T	7	7	735947	735953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_020536	TCAA	2	8	736655	736662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_020536	TAT	2	6	736664	736669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_020536	AT	3	6	736678	736683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_020536	ACA	2	6	737472	737477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_020536	TTG	2	6	737482	737487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_020536	TGGT	2	8	737519	737526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_020536	ATC	2	6	737652	737657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_020536	AAG	2	6	737682	737687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_020536	AGTA	2	8	737731	737738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020536	CTT	2	6	737767	737772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_020536	ATGTG	2	10	737781	737790	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020536	TTTA	2	8	737810	737817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020536	TGT	2	6	737856	737861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020536	TAA	2	6	738557	738562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020536	TAA	2	6	738566	738571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_020536	TAAAA	2	10	738609	738618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020536	A	7	7	738615	738621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020536	GAAA	2	8	738645	738652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_020536	AT	4	8	738668	738675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_020536	T	6	6	738716	738721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020536	GAATA	2	10	738768	738777	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020536	AT	3	6	738782	738787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_020536	CTA	2	6	739487	739492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_020536	AAG	2	6	739545	739550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_020536	CTA	2	6	739558	739563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_020536	ATA	2	6	741234	741239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_020536	ATG	2	6	741249	741254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_020536	ATT	2	6	741292	741297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_020536	TGT	2	6	741311	741316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_020536	AT	3	6	741373	741378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_020536	GTT	2	6	741379	741384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_020536	TGT	2	6	741459	741464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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