MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020536	T	6	6	219984	219989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020536	GTT	2	6	220055	220060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020536	A	7	7	220087	220093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020536	ATT	2	6	220095	220100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020536	TAA	2	6	220195	220200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020536	AT	3	6	220208	220213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020536	AGG	2	6	224848	224853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020536	CAT	2	6	225939	225944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_020536	AGG	2	6	225951	225956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020536	ATT	2	6	227006	227011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020536	AT	3	6	227012	227017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020536	AAG	2	6	227040	227045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020536	TGG	2	6	228068	228073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020536	TGAA	2	8	228080	228087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020536	TTGT	2	8	228139	228146	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020536	AAG	2	6	228148	228153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020536	TA	3	6	228162	228167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020536	TA	3	6	228224	228229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020536	ATA	2	6	228254	228259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020536	A	7	7	228259	228265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020536	TGT	2	6	228269	228274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020536	AATAT	2	10	228314	228323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020536	TGA	2	6	228366	228371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020536	TATT	2	8	228971	228978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020536	TAA	2	6	229038	229043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020536	AT	3	6	229076	229081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020536	AT	3	6	230600	230605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020536	CT	3	6	230751	230756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_020536	GAAA	2	8	230769	230776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020536	TGT	2	6	231471	231476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020536	TATTG	2	10	231518	231527	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020536	AAT	2	6	231572	231577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020536	TCA	3	9	231582	231590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_020536	AAT	2	6	234158	234163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020536	TGT	2	6	234239	234244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020536	TTTG	2	8	234259	234266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020536	TATTT	2	10	234305	234314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020536	TA	3	6	234323	234328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020536	AT	3	6	234401	234406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020536	CAA	2	6	234444	234449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_020536	T	6	6	234453	234458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020536	AT	3	6	234467	234472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020536	TGT	2	6	234520	234525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020536	ACAT	2	8	234585	234592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_020536	TGA	2	6	234594	234599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020536	A	7	7	234621	234627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020536	CAA	2	6	234631	234636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_020536	AAAG	2	8	237756	237763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020536	CTT	2	6	237796	237801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_020536	GTA	2	6	237832	237837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020536	ATC	2	6	237937	237942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_020536	TTA	2	6	237950	237955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020536	ATATGA	2	12	237968	237979	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020536	GAT	2	6	239853	239858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020536	ATT	2	6	239984	239989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020536	AATTG	2	10	240018	240027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020536	ATTT	2	8	240158	240165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020536	TGCT	2	8	240245	240252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_020536	TGT	2	6	240324	240329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020536	A	7	7	240363	240369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020536	AT	3	6	240444	240449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020536	GGA	2	6	240505	240510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020536	A	6	6	240514	240519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020536	ACA	2	6	242552	242557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_020536	ATG	2	6	242573	242578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020536	ATT	2	6	242625	242630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_020536	AACAT	2	10	242648	242657	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_020536	AT	3	6	242664	242669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020536	AAT	3	9	242725	242733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020536	AC	4	8	242780	242787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_020536	ATT	2	6	242852	242857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020536	ACC	2	6	242939	242944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_020536	T	6	6	242960	242965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020536	CA	3	6	242983	242988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_020536	TAA	2	6	242996	243001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020536	TTCA	2	8	243039	243046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_020536	CT	3	6	244280	244285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_020536	TCC	2	6	246567	246572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1080	NC_020536	ATTA	2	8	246633	246640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020536	T	6	6	246704	246709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020536	ATT	2	6	246734	246739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020536	ACA	2	6	248014	248019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_020536	ATAAC	2	10	251232	251241	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_020536	ATA	2	6	251279	251284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020536	TGAAT	2	10	251343	251352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020536	TA	3	6	251367	251372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020536	ATTAA	2	10	251484	251493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020536	TAT	2	6	251502	251507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020536	GGAATA	2	12	252829	252840	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020536	A	6	6	252853	252858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020536	TA	3	6	252894	252899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020536	TAA	2	6	252927	252932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020536	TCA	2	6	252948	252953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1096	NC_020536	CAA	2	6	254587	254592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_020536	TGT	2	6	254628	254633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020536	ATT	2	6	254646	254651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020536	AATT	2	8	254659	254666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020536	GTA	2	6	254667	254672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020536	AAAT	2	8	254687	254694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020536	AT	3	6	254739	254744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020536	CTG	2	6	254762	254767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_020536	TAC	2	6	254771	254776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_020536	TGC	2	6	254801	254806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_020536	AAT	2	6	254986	254991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_020536	TAT	2	6	255061	255066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020536	TGT	2	6	255151	255156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020536	GAC	2	6	255162	255167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_020536	AAAT	2	8	255169	255176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020536	ATC	2	6	255188	255193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_020536	A	6	6	255212	255217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020536	AAAGT	2	10	255228	255237	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020536	ATTT	2	8	255262	255269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020536	AATTA	2	10	255341	255350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020536	AAT	2	6	255362	255367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020536	CTC	2	6	256609	256614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_020536	ATT	2	6	256634	256639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020536	CTA	2	6	256640	256645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_020536	AATT	2	8	256661	256668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020536	ATAA	2	8	256682	256689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020536	T	6	6	256724	256729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020536	CGA	2	6	256775	256780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_020536	GC	3	6	256783	256788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_020536	ATTT	2	8	256789	256796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020536	A	6	6	256806	256811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020536	TTG	2	6	256814	256819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020536	A	6	6	256829	256834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020536	ATA	2	6	256844	256849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020536	AAT	2	6	256866	256871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020536	TAAAA	2	10	256941	256950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020536	AAAT	2	8	256955	256962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020536	AAAT	2	8	257013	257020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020536	AGC	2	6	257108	257113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_020536	A	6	6	258177	258182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020536	GTT	2	6	258250	258255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020536	AAATT	2	10	258257	258266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_020536	GAT	2	6	258302	258307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_020536	ATT	2	6	259994	259999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1152	NC_020536	AT	3	6	261426	261431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_020536	A	6	6	261473	261478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_020536	T	7	7	321298	321304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_020536	AAAT	2	8	321339	321346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_020536	ATG	2	6	321634	321639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1417	NC_020536	GTT	2	6	321686	321691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_020536	TAA	2	6	321693	321698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_020536	AAG	2	6	321803	321808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1421	NC_020536	A	6	6	321878	321883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_020536	T	6	6	325135	325140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1454	NC_020536	A	6	6	325183	325188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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