MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020536	TAAT	2	8	78363	78370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020536	A	6	6	78423	78428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020536	TAAT	2	8	78435	78442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020536	AGAA	2	8	78454	78461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020536	AAT	2	6	79464	79469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020536	ATT	2	6	79505	79510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020536	ACT	2	6	79514	79519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020536	TAA	2	6	79541	79546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020536	CAA	2	6	79549	79554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_020536	TAT	2	6	79555	79560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020536	TTGT	2	8	79573	79580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020536	ATA	2	6	79591	79596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020536	AT	3	6	79627	79632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020536	AACAAA	2	12	79639	79650	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
515	NC_020536	AGA	2	6	79662	79667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020536	ATG	2	6	81067	81072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020536	ATATA	2	10	81101	81110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020536	TTG	2	6	81135	81140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020536	TCA	2	6	81165	81170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_020536	A	7	7	81180	81186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020536	AT	3	6	81220	81225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020536	ATAA	2	8	81262	81269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020536	TAA	2	6	82112	82117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020536	AGA	2	6	82153	82158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020536	AATC	2	8	82962	82969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
526	NC_020536	ATA	3	9	82978	82986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020536	AAT	2	6	83824	83829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020536	T	6	6	86149	86154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020536	A	6	6	86175	86180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020536	TGT	2	6	86198	86203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020536	ATAA	2	8	86211	86218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020536	ATG	2	6	86232	86237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020536	AATATA	2	12	88939	88950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020536	TTAT	2	8	88996	89003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020536	GTT	2	6	89007	89012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020536	TA	3	6	89030	89035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020536	TA	4	8	89044	89051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020536	ATT	2	6	89167	89172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020536	ATA	2	6	89199	89204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020536	A	6	6	89218	89223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020536	A	6	6	89278	89283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020536	ATAA	2	8	89291	89298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020536	ATT	2	6	91051	91056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020536	AT	3	6	91062	91067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020536	TTA	2	6	91101	91106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020536	ATG	2	6	91157	91162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020536	CAAT	2	8	91163	91170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_020536	TCA	2	6	91185	91190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_020536	A	7	7	91190	91196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020536	CCA	2	6	93074	93079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_020536	A	6	6	94155	94160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020536	AGGG	2	8	94217	94224	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020536	AGA	2	6	94225	94230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020536	AAT	2	6	94271	94276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020536	AAT	2	6	95635	95640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020536	GTAAT	2	10	95751	95760	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020536	ATG	2	6	96305	96310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020536	ATT	2	6	96334	96339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020536	ATAA	2	8	96340	96347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020536	AT	3	6	96372	96377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020536	TATT	2	8	96378	96385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020536	ATC	2	6	96473	96478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_020536	TA	3	6	96530	96535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020536	AG	3	6	96537	96542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020536	TGT	2	6	98155	98160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020536	ATT	2	6	98191	98196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020536	T	6	6	98245	98250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020536	GTT	2	6	98308	98313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020536	AGTA	2	8	98320	98327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020536	A	6	6	98332	98337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020536	CAA	2	6	98347	98352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_020536	GAT	2	6	98374	98379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020536	TA	3	6	98415	98420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020536	TTGT	2	8	98463	98470	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020536	TTAAAT	2	12	99931	99942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020536	AAAT	2	8	99962	99969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020536	TAA	2	6	100034	100039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_020536	AAT	2	6	101079	101084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020536	ATA	2	6	101104	101109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_020536	ATTG	2	8	101208	101215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020536	TA	3	6	101246	101251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020536	TAACAA	2	12	101288	101299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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591	NC_020536	GTTA	2	8	101330	101337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020536	TAA	2	6	101380	101385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020536	AGATG	2	10	102347	102356	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020536	T	6	6	102366	102371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020536	CCT	2	6	104401	104406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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597	NC_020536	ATT	2	6	104504	104509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020536	A	6	6	104526	104531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_020536	TCAG	2	8	108421	108428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_020536	ATT	2	6	108464	108469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_020536	ACC	2	6	109713	109718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_020536	ATC	2	6	109724	109729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_020536	ATG	2	6	115862	115867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020536	ATA	2	6	115892	115897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020536	TAAA	2	8	115975	115982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020536	TAAA	2	8	116013	116020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020536	GA	3	6	116673	116678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020536	A	7	7	116682	116688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020536	TGT	2	6	116804	116809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020536	GAAA	2	8	116846	116853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020536	GAG	2	6	116857	116862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020536	ATAA	2	8	117664	117671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020536	T	6	6	117709	117714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020536	TAA	2	6	117749	117754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020536	ATG	2	6	117775	117780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020536	AC	3	6	117821	117826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_020536	ATTTT	2	10	117899	117908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020536	TAAA	2	8	117911	117918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020536	A	6	6	117916	117921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020536	AT	3	6	117959	117964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020536	ATA	3	9	118984	118992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020536	GAA	2	6	119028	119033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020536	TAA	2	6	119631	119636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020536	CAT	2	6	119735	119740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_020536	TGA	2	6	119771	119776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020536	ATT	2	6	122230	122235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020536	AAG	2	6	123669	123674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020536	T	6	6	123710	123715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020536	TA	3	6	123805	123810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020536	AAAT	2	8	123823	123830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020536	AAT	3	9	123828	123836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020536	AC	3	6	123846	123851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_020536	ATTA	2	8	123857	123864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020536	AGG	2	6	123886	123891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020536	T	6	6	124546	124551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020536	ATA	2	6	124612	124617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020536	TTA	2	6	124642	124647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_020536	ATG	2	6	124660	124665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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