MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_020536	GCTG	2	8	1414243	1414250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8002	NC_020536	ATC	2	6	1414254	1414259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_020536	TTGTG	2	10	1414319	1414328	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_020536	GATATA	2	12	1414342	1414353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_020536	TCC	2	6	1414368	1414373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8006	NC_020536	TTTC	2	8	1414402	1414409	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_020536	ATG	2	6	1414436	1414441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_020536	ATTG	2	8	1414489	1414496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_020536	ATC	2	6	1414514	1414519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_020536	TTA	2	6	1414573	1414578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_020536	TGAA	2	8	1414663	1414670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_020536	TTAT	2	8	1414753	1414760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_020536	AGG	2	6	1414796	1414801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_020536	TAC	2	6	1415523	1415528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_020536	ATTT	2	8	1415579	1415586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_020536	CGT	2	6	1415587	1415592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_020536	TTG	2	6	1415641	1415646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_020536	ATT	2	6	1415668	1415673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_020536	A	6	6	1415724	1415729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_020536	ACT	2	6	1415760	1415765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_020536	GAT	2	6	1415817	1415822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_020536	T	7	7	1415822	1415828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_020536	TAC	2	6	1415845	1415850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_020536	ATC	2	6	1415861	1415866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_020536	T	6	6	1415918	1415923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_020536	TAT	2	6	1415995	1416000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_020536	AAAT	2	8	1416006	1416013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_020536	TGC	2	6	1416019	1416024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_020536	AGA	2	6	1416070	1416075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_020536	AGC	2	6	1416078	1416083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_020536	TATACA	2	12	1416086	1416097	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8032	NC_020536	TAT	2	6	1416192	1416197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_020536	TAT	2	6	1416306	1416311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_020536	GA	3	6	1416328	1416333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_020536	ACAAA	2	10	1416334	1416343	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8036	NC_020536	ATTA	2	8	1416379	1416386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_020536	AATA	2	8	1416392	1416399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_020536	TGATG	2	10	1416414	1416423	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_020536	CTC	2	6	1416434	1416439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_020536	TTG	2	6	1448355	1448360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_020536	TGT	2	6	1448370	1448375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_020536	CATTC	2	10	1448420	1448429	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8043	NC_020536	ATTT	2	8	1448520	1448527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_020536	ATA	2	6	1448540	1448545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_020536	AT	3	6	1448553	1448558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_020536	TAA	2	6	1448589	1448594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_020536	TAAA	2	8	1448598	1448605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_020536	TAA	2	6	1448620	1448625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_020536	A	6	6	1448624	1448629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_020536	AAT	2	6	1448651	1448656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_020536	ATT	2	6	1452758	1452763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_020536	ATT	2	6	1453922	1453927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_020536	ATTA	3	12	1453958	1453969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_020536	TAA	2	6	1453993	1453998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_020536	AT	3	6	1454006	1454011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_020536	TATTCT	2	12	1454012	1454023	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8057	NC_020536	TATT	2	8	1454051	1454058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_020536	TAAT	2	8	1454109	1454116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_020536	T	6	6	1454125	1454130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_020536	TAA	2	6	1454135	1454140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_020536	ATTT	2	8	1454174	1454181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_020536	TATC	2	8	1454226	1454233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8063	NC_020536	TTAT	2	8	1454244	1454251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_020536	CTT	2	6	1455250	1455255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_020536	GTTC	2	8	1458715	1458722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8066	NC_020536	TGCT	2	8	1458732	1458739	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8067	NC_020536	TAT	2	6	1458805	1458810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_020536	GCT	2	6	1458828	1458833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_020536	AAT	2	6	1458848	1458853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_020536	TTC	2	6	1458859	1458864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_020536	ATC	2	6	1458906	1458911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_020536	AAAT	2	8	1458928	1458935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_020536	CA	3	6	1458952	1458957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8074	NC_020536	GGGA	2	8	1458991	1458998	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_020536	TC	3	6	1460388	1460393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8076	NC_020536	TAA	2	6	1460416	1460421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_020536	T	6	6	1460461	1460466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_020536	A	6	6	1460479	1460484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_020536	AAG	2	6	1460500	1460505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_020536	CTT	2	6	1460515	1460520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_020536	T	6	6	1460541	1460546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_020536	TCA	2	6	1460574	1460579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_020536	TCA	2	6	1460597	1460602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_020536	CAT	2	6	1460637	1460642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_020536	T	6	6	1460671	1460676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_020536	T	6	6	1460790	1460795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_020536	A	6	6	1460802	1460807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_020536	AAC	2	6	1460836	1460841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_020536	T	7	7	1460868	1460874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_020536	CTC	2	6	1460888	1460893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_020536	TAT	2	6	1460911	1460916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_020536	ATT	2	6	1460929	1460934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_020536	T	6	6	1462153	1462158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_020536	CAA	2	6	1462168	1462173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_020536	A	6	6	1462273	1462278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_020536	CAT	2	6	1462285	1462290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_020536	TAG	2	6	1462306	1462311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_020536	TGTTC	2	10	1462330	1462339	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8099	NC_020536	TCA	2	6	1462348	1462353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_020536	GT	3	6	1462417	1462422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_020536	TCA	2	6	1462616	1462621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_020536	ATC	2	6	1462637	1462642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_020536	TG	3	6	1462649	1462654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_020536	TA	3	6	1462671	1462676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_020536	ATT	2	6	1462723	1462728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_020536	ATT	2	6	1462759	1462764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_020536	ATT	2	6	1462814	1462819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_020536	TGT	3	9	1462832	1462840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_020536	ATT	2	6	1462841	1462846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_020536	GAA	2	6	1462848	1462853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_020536	TTC	2	6	1462901	1462906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_020536	T	6	6	1462913	1462918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_020536	TCT	2	6	1462932	1462937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_020536	ATT	2	6	1462955	1462960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_020536	T	6	6	1462972	1462977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_020536	AAT	2	6	1462988	1462993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_020536	CTT	2	6	1463014	1463019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_020536	T	6	6	1463044	1463049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_020536	T	6	6	1463104	1463109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_020536	AT	3	6	1463709	1463714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_020536	GTT	2	6	1463796	1463801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_020536	TAA	2	6	1463856	1463861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_020536	TTG	3	9	1463944	1463952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_020536	TGT	2	6	1463982	1463987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_020536	CAT	2	6	1464015	1464020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_020536	CCT	2	6	1464032	1464037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8127	NC_020536	T	6	6	1464041	1464046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_020536	TA	3	6	1464088	1464093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_020536	T	6	6	1464108	1464113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_020536	TA	3	6	1464156	1464161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_020536	TGT	2	6	1464183	1464188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8133	NC_020536	CTG	2	6	1464242	1464247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8401	NC_020536	TAA	2	6	1522799	1522804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8402	NC_020536	AAT	2	6	1522836	1522841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8403	NC_020536	AAG	2	6	1523763	1523768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8405	NC_020536	CCT	2	6	1526524	1526529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8433	NC_020536	AAAT	2	8	1529012	1529019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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