MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020536	TTA	2	6	865206	865211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_020536	AAGCAC	2	12	867417	867428	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_020536	ATT	2	6	867437	867442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_020536	CGA	2	6	868637	868642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_020536	AGG	2	6	869485	869490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_020536	ATT	2	6	870827	870832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_020536	TAA	2	6	871831	871836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_020536	AACG	2	8	871861	871868	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_020536	ATT	2	6	871885	871890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_020536	ATAG	2	8	871932	871939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_020536	GAA	2	6	871942	871947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_020536	GAA	2	6	872009	872014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_020536	TTG	2	6	872061	872066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_020536	TAA	2	6	872116	872121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_020536	A	6	6	872120	872125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_020536	GAA	2	6	872243	872248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_020536	GAC	2	6	872273	872278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_020536	TAA	2	6	872330	872335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_020536	TTC	2	6	872421	872426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_020536	TGG	2	6	872435	872440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_020536	T	7	7	872459	872465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_020536	TA	3	6	873902	873907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_020536	CAC	2	6	873910	873915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_020536	TGG	2	6	873919	873924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_020536	AATG	2	8	873933	873940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_020536	CTT	2	6	873972	873977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_020536	CTT	3	9	874011	874019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_020536	ATC	2	6	874024	874029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_020536	ATA	2	6	874037	874042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_020536	ATTT	2	8	874047	874054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_020536	CAA	2	6	874134	874139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_020536	CAA	2	6	874143	874148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_020536	CT	3	6	874160	874165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_020536	TCA	2	6	874172	874177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_020536	ATCA	2	8	874189	874196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_020536	AGT	2	6	874219	874224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_020536	ATA	2	6	874267	874272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_020536	TA	3	6	874271	874276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_020536	AACT	2	8	874317	874324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_020536	TGA	2	6	874354	874359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_020536	AGCA	2	8	874370	874377	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_020536	ATC	2	6	874420	874425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_020536	ATTT	2	8	874456	874463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_020536	TGAT	2	8	874491	874498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_020536	AT	3	6	874497	874502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_020536	TTA	2	6	874518	874523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_020536	CAG	2	6	874535	874540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_020536	TAA	2	6	874546	874551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_020536	TGA	2	6	874624	874629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_020536	TTA	2	6	874639	874644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_020536	TTA	2	6	874653	874658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_020536	AAGCA	2	10	876533	876542	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5053	NC_020536	TA	3	6	876576	876581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020536	TGA	2	6	876589	876594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_020536	TGA	2	6	876630	876635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_020536	TA	3	6	876654	876659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_020536	TA	3	6	876670	876675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_020536	ATGA	2	8	876711	876718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_020536	CAA	2	6	876725	876730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_020536	AAT	2	6	876745	876750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_020536	TGA	2	6	876755	876760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_020536	TAAAAT	2	12	876785	876796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_020536	A	6	6	876832	876837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_020536	TAA	2	6	876938	876943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_020536	TTA	2	6	876969	876974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_020536	TTA	2	6	876997	877002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_020536	ATTTA	2	10	877009	877018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_020536	AC	4	8	877030	877037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_020536	TTC	2	6	878558	878563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_020536	ATT	2	6	878581	878586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_020536	TTA	2	6	879793	879798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_020536	GAA	2	6	879853	879858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_020536	TAT	2	6	879861	879866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_020536	ATT	3	9	879888	879896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_020536	TAT	2	6	879930	879935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_020536	AGA	2	6	879987	879992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_020536	TTGA	2	8	881203	881210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_020536	ATAGA	2	10	881242	881251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_020536	AAT	2	6	881279	881284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_020536	TAAT	2	8	881289	881296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_020536	A	6	6	881345	881350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_020536	TAA	2	6	881357	881362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_020536	AAT	2	6	881372	881377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_020536	TGT	2	6	881394	881399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_020536	ATA	2	6	881405	881410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_020536	CTT	2	6	881472	881477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_020536	TGTAAT	2	12	881546	881557	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_020536	TCAA	2	8	881579	881586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_020536	CCA	2	6	881597	881602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_020536	TAA	2	6	881608	881613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_020536	GA	3	6	881697	881702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_020536	TTA	2	6	881718	881723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_020536	TAT	2	6	881727	881732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_020536	ATAG	2	8	881734	881741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_020536	TAA	2	6	881744	881749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_020536	AT	3	6	881776	881781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_020536	GTA	2	6	881798	881803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_020536	AT	3	6	881901	881906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_020536	TA	3	6	881921	881926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_020536	ATTA	2	8	882010	882017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_020536	TA	3	6	882047	882052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_020536	CAAA	2	8	882053	882060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_020536	TGAA	2	8	882093	882100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_020536	AT	3	6	883289	883294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_020536	TCA	2	6	883333	883338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_020536	A	6	6	883348	883353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_020536	TTA	2	6	883374	883379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_020536	TA	3	6	883378	883383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_020536	T	7	7	883384	883390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_020536	AAAT	2	8	883403	883410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_020536	ACTA	2	8	883417	883424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_020536	GTT	2	6	883459	883464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_020536	CAT	2	6	883477	883482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_020536	AAG	2	6	883530	883535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_020536	TC	3	6	883566	883571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_020536	TTG	2	6	883706	883711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_020536	GAA	2	6	883726	883731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_020536	TTA	2	6	883732	883737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_020536	AT	4	8	883742	883749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_020536	T	6	6	883772	883777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_020536	AGG	2	6	883779	883784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_020536	AGC	2	6	883815	883820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_020536	AAATG	2	10	883851	883860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_020536	TGG	2	6	883890	883895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_020536	AGA	2	6	883929	883934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_020536	ATG	2	6	883949	883954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_020536	TAG	2	6	883985	883990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_020536	AGA	2	6	883995	884000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_020536	TAA	2	6	884149	884154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_020536	TTA	2	6	884260	884265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_020536	A	6	6	884356	884361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_020536	TTAA	2	8	884362	884369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_020536	T	6	6	884370	884375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_020536	CTGA	2	8	884382	884389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5135	NC_020536	CTTG	2	8	884392	884399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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