MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	ACAT	2	8	1467	1474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020535	AAGA	2	8	1699	1706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020535	ATCT	2	8	5377	5384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020535	AAGA	2	8	6251	6258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020535	TTTG	2	8	6559	6566	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020535	TTGG	2	8	7418	7425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020535	CAAC	2	8	7489	7496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020535	CCAA	2	8	7529	7536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020535	CTTT	2	8	7686	7693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020535	ATTA	2	8	11016	11023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020535	CTTA	2	8	11600	11607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020535	TGAT	2	8	11713	11720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020535	TAAA	2	8	20029	20036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020535	ATCT	2	8	23000	23007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020535	TATT	2	8	26746	26753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020535	GAAA	2	8	27706	27713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020535	TATT	2	8	28608	28615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020535	TGAT	2	8	33260	33267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020535	ATCT	2	8	33370	33377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020535	AAAT	2	8	34333	34340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020535	AATT	2	8	34345	34352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020535	TTTA	2	8	34490	34497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020535	TAAA	2	8	34642	34649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020535	AGAA	2	8	34688	34695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020535	AAAT	2	8	34741	34748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020535	TAAA	2	8	35187	35194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020535	AAGA	2	8	36418	36425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020535	ATGT	2	8	36834	36841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020535	ATTC	2	8	36996	37003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020535	TTTG	2	8	37222	37229	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.