MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 776

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020533	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020533	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020533	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020533	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020533	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020533	TTTCA	2	10	34313	34322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020533	TAAAA	2	10	35766	35775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020533	AGATA	2	10	35924	35933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020533	ATGAG	2	10	37186	37195	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020533	CAAAA	2	10	38214	38223	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020533	TTTGT	2	10	43592	43601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020533	TTTTG	2	10	45238	45247	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020533	AAGTA	2	10	56410	56419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020533	TTTTA	2	10	56774	56783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020533	CATTT	2	10	62395	62404	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020533	TTTTA	2	10	65255	65264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020533	GTGTT	2	10	71064	71073	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020533	ATTCA	2	10	73656	73665	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020533	GTAAT	2	10	95752	95761	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020533	AGATG	2	10	102348	102357	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020533	ATTTT	2	10	117900	117909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020533	TGATT	2	10	160240	160249	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020533	CAAAA	2	10	160493	160502	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020533	CAAAA	2	10	162604	162613	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020533	TAAAG	2	10	162953	162962	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020533	TATCA	2	10	172981	172990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020533	ATCAT	2	10	181113	181122	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020533	CAACT	2	10	193245	193254	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020533	GCTTT	2	10	197757	197766	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020533	TGAAG	2	10	197959	197968	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020533	AAAAT	2	10	198030	198039	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020533	TGATT	2	10	198103	198112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020533	GAAAA	2	10	208751	208760	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020533	TAACA	2	10	209122	209131	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020533	AATAT	2	10	228317	228326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020533	TATTG	2	10	231521	231530	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020533	TATTT	2	10	234308	234317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020533	AATTG	2	10	240021	240030	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020533	AACAT	2	10	242651	242660	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020533	GATAA	2	10	246588	246597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020533	ATAAC	2	10	251235	251244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020533	TGAAT	2	10	251346	251355	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020533	ATTAA	2	10	251487	251496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020533	AAAGT	2	10	255231	255240	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020533	AATTA	2	10	255344	255353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020533	TAAAA	2	10	256944	256953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020533	AAATT	2	10	258260	258269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020533	TAAAA	2	10	272406	272415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020533	GAAAA	2	10	280196	280205	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020533	ATAAA	2	10	280314	280323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020533	TCATA	2	10	288776	288785	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020533	ATTTA	2	10	302699	302708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020533	ACTCG	2	10	306560	306569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_020533	AATTT	2	10	312971	312980	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020533	AATTA	2	10	314352	314361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020533	TAAAT	2	10	333453	333462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020533	ATTTT	2	10	339010	339019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020533	ATAGA	2	10	345254	345263	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020533	TGACA	2	10	345446	345455	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020533	AAGAT	2	10	346505	346514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020533	GATAA	2	10	357751	357760	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020533	TAAAA	2	10	369191	369200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020533	TTGTT	2	10	369496	369505	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020533	TATCA	3	15	372493	372507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020533	GAATG	2	10	386755	386764	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020533	AGATA	2	10	393625	393634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020533	AGAAT	2	10	393866	393875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020533	TAAGG	2	10	393930	393939	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020533	ATTGT	2	10	395149	395158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020533	TAAAT	2	10	401388	401397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020533	AGATA	2	10	401491	401500	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020533	ACAGT	2	10	405482	405491	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020533	CATAA	2	10	415966	415975	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020533	TAAAA	2	10	416190	416199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020533	AAAGT	2	10	429143	429152	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020533	AAATT	2	10	432322	432331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020533	GAAAA	2	10	443030	443039	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020533	ATAGC	2	10	443897	443906	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020533	TGAAA	2	10	443911	443920	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020533	AATGC	2	10	444014	444023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020533	TAAAG	2	10	444107	444116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020533	CTCAC	2	10	446012	446021	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_020533	CAAAG	2	10	446037	446046	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020533	CTTAA	2	10	463663	463672	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020533	TGGTG	2	10	481482	481491	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020533	CAACT	2	10	482053	482062	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_020533	TCGTG	2	10	483346	483355	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020533	TTAAT	2	10	483987	483996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020533	GATTG	2	10	485789	485798	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020533	GATTT	2	10	490718	490727	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020533	TCTGT	2	10	492895	492904	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020533	ATATA	2	10	493136	493145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020533	CAAAG	2	10	499684	499693	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020533	ATGGT	2	10	502118	502127	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020533	CATTA	2	10	502568	502577	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020533	TTGAT	2	10	502845	502854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020533	AAAAG	2	10	514061	514070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020533	AGACA	2	10	516827	516836	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020533	AAGTA	2	10	519262	519271	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020533	TTAAA	2	10	521385	521394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020533	GATAA	2	10	521424	521433	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020533	GGTAA	2	10	526956	526965	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020533	TCGTG	2	10	527775	527784	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020533	GATTG	2	10	530081	530090	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020533	ATATA	2	10	536695	536704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020533	AAAAT	2	10	541470	541479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020533	TTTAT	2	10	541579	541588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020533	TTATG	2	10	544585	544594	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020533	ATTTA	2	10	544730	544739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020533	ACAAT	2	10	546535	546544	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020533	AAATA	2	10	549024	549033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020533	TGAAT	2	10	551002	551011	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020533	GTATA	2	10	551059	551068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020533	TATAA	2	10	554776	554785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020533	GTTTA	2	10	570919	570928	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020533	TAAAG	2	10	575113	575122	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020533	GAAGC	2	10	576469	576478	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020533	ATATT	2	10	581250	581259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020533	TTAAC	2	10	584162	584171	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020533	AATTT	2	10	584247	584256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020533	ATAAA	2	10	592570	592579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020533	TAAAA	2	10	608035	608044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020533	TTATA	2	10	608468	608477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020533	CACAT	2	10	608864	608873	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_020533	AGCAG	2	10	610664	610673	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020533	GTAAA	2	10	610873	610882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020533	ATGAT	2	10	617887	617896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020533	TAATT	2	10	621374	621383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020533	TAAAT	2	10	630775	630784	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020533	AAATT	2	10	632779	632788	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020533	TAAAA	2	10	639674	639683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020533	CTATC	2	10	640476	640485	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_020533	ATTAA	2	10	641862	641871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020533	TTATT	2	10	641911	641920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020533	CAATA	2	10	641977	641986	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020533	TTAAT	2	10	644603	644612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020533	AAATA	2	10	646868	646877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020533	ATTTT	2	10	646890	646899	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020533	ATAAA	2	10	653582	653591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020533	TTTTA	2	10	657368	657377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020533	AAAGG	2	10	657689	657698	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020533	ATATA	2	10	660926	660935	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020533	AAACT	2	10	664451	664460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_020533	TTCAC	2	10	669664	669673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_020533	TTTGT	2	10	673570	673579	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020533	AATGA	2	10	673643	673652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020533	GGTTG	2	10	680645	680654	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020533	TAAAC	2	10	688571	688580	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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