MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_020533	TAT	2	6	2730808	2730813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_020533	ATTTTA	2	12	2730845	2730856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_020533	T	6	6	2730857	2730862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_020533	CTATTT	2	12	2731393	2731404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16005	NC_020533	TAA	2	6	2732172	2732177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_020533	TGA	2	6	2732206	2732211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_020533	TAT	2	6	2732243	2732248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_020533	AT	3	6	2733960	2733965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_020533	CATT	2	8	2733979	2733986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16010	NC_020533	CAA	2	6	2734000	2734005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16011	NC_020533	A	6	6	2734584	2734589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_020533	CCT	2	6	2735449	2735454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16013	NC_020533	T	6	6	2735454	2735459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_020533	A	7	7	2735468	2735474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_020533	TAG	2	6	2735557	2735562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_020533	ATA	3	9	2735577	2735585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_020533	CTT	2	6	2735629	2735634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_020533	AATT	2	8	2735643	2735650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_020533	GTG	2	6	2735671	2735676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_020533	ATTCGA	2	12	2735713	2735724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16021	NC_020533	T	6	6	2735746	2735751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_020533	GGT	2	6	2735753	2735758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_020533	TGTA	2	8	2735761	2735768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_020533	A	6	6	2735779	2735784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_020533	AT	5	10	2736364	2736373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16027	NC_020533	AGGT	2	8	2736478	2736485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_020533	ATG	2	6	2737616	2737621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_020533	TTAA	2	8	2738661	2738668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_020533	T	6	6	2738723	2738728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_020533	CATA	2	8	2738734	2738741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16032	NC_020533	TAAAT	2	10	2738776	2738785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_020533	CAAA	2	8	2739460	2739467	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16034	NC_020533	GAT	2	6	2739513	2739518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16036	NC_020533	ATC	2	6	2740358	2740363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_020533	GCC	2	6	2740450	2740455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16038	NC_020533	T	7	7	2740465	2740471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_020533	T	6	6	2740492	2740497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_020533	TAC	2	6	2740524	2740529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_020533	ATCTG	2	10	2740643	2740652	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16042	NC_020533	CTA	2	6	2740672	2740677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_020533	ATA	2	6	2740684	2740689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_020533	GTT	2	6	2740738	2740743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16046	NC_020533	TTA	2	6	2741302	2741307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_020533	AAC	2	6	2741314	2741319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_020533	T	6	6	2741331	2741336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_020533	T	6	6	2741355	2741360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_020533	TAA	2	6	2741366	2741371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_020533	TTC	2	6	2741388	2741393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16053	NC_020533	TTAAT	2	10	2741430	2741439	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_020533	ATT	2	6	2741450	2741455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_020533	AGAA	2	8	2741511	2741518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_020533	A	7	7	2743188	2743194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_020533	ATTT	2	8	2743239	2743246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_020533	CA	3	6	2743289	2743294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16059	NC_020533	CCT	2	6	2744279	2744284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16061	NC_020533	ACCA	2	8	2744397	2744404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16062	NC_020533	AAT	2	6	2744426	2744431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16065	NC_020533	AT	4	8	2745108	2745115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_020533	TAA	2	6	2745118	2745123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_020533	AAT	2	6	2745128	2745133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_020533	ATA	2	6	2745139	2745144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16074	NC_020533	GTAG	2	8	2747321	2747328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_020533	T	6	6	2747335	2747340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16079	NC_020533	A	6	6	2747973	2747978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_020533	TAT	2	6	2747981	2747986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_020533	AAT	2	6	2747989	2747994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_020533	CAT	2	6	2748023	2748028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16085	NC_020533	TTCA	2	8	2748127	2748134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16098	NC_020533	T	6	6	2751287	2751292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_020533	ATTT	2	8	2751348	2751355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_020533	A	6	6	2751358	2751363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_020533	TAA	2	6	2751406	2751411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16106	NC_020533	T	7	7	2751788	2751794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_020533	ATA	2	6	2751807	2751812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_020533	GAT	3	9	2751824	2751832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16110	NC_020533	AGAC	2	8	2752532	2752539	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16111	NC_020533	TTA	2	6	2752589	2752594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16113	NC_020533	T	6	6	2752709	2752714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_020533	ATAC	2	8	2752741	2752748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16121	NC_020533	A	6	6	2753031	2753036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_020533	ATG	2	6	2753056	2753061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16128	NC_020533	AAGA	2	8	2753347	2753354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16130	NC_020533	CCT	2	6	2753378	2753383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16131	NC_020533	ACC	2	6	2753389	2753394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16132	NC_020533	AAT	2	6	2753407	2753412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_020533	ACC	2	6	2753434	2753439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16134	NC_020533	GAA	2	6	2753451	2753456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16135	NC_020533	TAAT	2	8	2753497	2753504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16138	NC_020533	CGT	2	6	2753690	2753695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16142	NC_020533	A	7	7	2753855	2753861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16145	NC_020533	CTT	2	6	2757441	2757446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16159	NC_020533	AT	3	6	2759307	2759312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16161	NC_020533	TATT	2	8	2759433	2759440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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