MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020533	AAG	2	6	227043	227048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020533	TGG	2	6	228071	228076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020533	TGAA	2	8	228083	228090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020533	TTGT	2	8	228142	228149	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020533	AAG	2	6	228151	228156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020533	TA	3	6	228165	228170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020533	TA	3	6	228227	228232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020533	ATA	2	6	228257	228262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020533	A	7	7	228262	228268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020533	TGT	2	6	228272	228277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020533	AATAT	2	10	228317	228326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020533	TGA	2	6	228369	228374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020533	TATT	2	8	228974	228981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020533	TAA	2	6	229041	229046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020533	AT	3	6	229079	229084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020533	AT	3	6	230603	230608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020533	CT	3	6	230754	230759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_020533	GAAA	2	8	230772	230779	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020533	TGT	2	6	231474	231479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020533	TATTG	2	10	231521	231530	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020533	AAT	2	6	231575	231580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020533	TCA	3	9	231585	231593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020533	AAT	2	6	234161	234166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020533	TGT	2	6	234242	234247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020533	TTTG	2	8	234262	234269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020533	TATTT	2	10	234308	234317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020533	TA	3	6	234326	234331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020533	AT	3	6	234404	234409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020533	CAA	2	6	234447	234452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_020533	T	6	6	234456	234461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020533	AT	3	6	234470	234475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020533	TGT	2	6	234523	234528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020533	ACAT	2	8	234588	234595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_020533	TGA	2	6	234597	234602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020533	A	7	7	234624	234630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020533	CAA	2	6	234634	234639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_020533	AAAG	2	8	237759	237766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020533	CTT	2	6	237799	237804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_020533	GTA	2	6	237835	237840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020533	ATC	2	6	237940	237945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_020533	TTA	2	6	237953	237958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020533	ATATGA	2	12	237971	237982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020533	GAT	2	6	239856	239861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020533	ATT	2	6	239987	239992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020533	AATTG	2	10	240021	240030	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020533	ATTT	2	8	240161	240168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020533	TGCT	2	8	240248	240255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_020533	TGT	2	6	240327	240332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020533	A	7	7	240366	240372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020533	AT	3	6	240447	240452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020533	GGA	2	6	240508	240513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020533	A	6	6	240517	240522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020533	ACA	2	6	242555	242560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_020533	ATG	2	6	242576	242581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020533	ATT	2	6	242628	242633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020533	AACAT	2	10	242651	242660	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1057	NC_020533	AT	3	6	242667	242672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020533	AAT	3	9	242728	242736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020533	AC	4	8	242783	242790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_020533	ATT	2	6	242855	242860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020533	ACC	2	6	242942	242947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_020533	T	6	6	242963	242968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020533	CA	3	6	242986	242991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_020533	TAA	2	6	242999	243004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020533	TTCA	2	8	243042	243049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_020533	CT	3	6	244283	244288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_020533	TCC	2	6	246570	246575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_020533	GATAA	2	10	246588	246597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020533	ATTA	2	8	246636	246643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020533	T	6	6	246707	246712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020533	ATT	2	6	246737	246742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020533	ACA	2	6	248017	248022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_020533	ATAAC	2	10	251235	251244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_020533	ATA	2	6	251282	251287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020533	TGAAT	2	10	251346	251355	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020533	TA	3	6	251370	251375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020533	ATTAA	2	10	251487	251496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020533	TAT	2	6	251505	251510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020533	GGAATA	2	12	252832	252843	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_020533	TA	3	6	252897	252902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020533	TAA	2	6	252930	252935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020533	TCA	2	6	252951	252956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_020533	CT	3	6	254563	254568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_020533	CAA	2	6	254590	254595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_020533	TGT	2	6	254631	254636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020533	ATT	2	6	254649	254654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_020533	GTA	2	6	254670	254675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_020533	AT	3	6	254742	254747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020533	CTG	2	6	254765	254770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_020533	TAC	2	6	254774	254779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1096	NC_020533	TAT	2	6	255064	255069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020533	TGT	2	6	255154	255159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1100	NC_020533	ATC	2	6	255191	255196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_020533	A	6	6	255215	255220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020533	AAAGT	2	10	255231	255240	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020533	ATTT	2	8	255265	255272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020533	AATTA	2	10	255344	255353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020533	AAT	2	6	255365	255370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020533	CTC	2	6	256612	256617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_020533	ATT	2	6	256637	256642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020533	CTA	2	6	256643	256648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_020533	AATT	2	8	256664	256671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020533	ATAA	2	8	256685	256692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020533	T	6	6	256727	256732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020533	CGA	2	6	256778	256783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_020533	GC	3	6	256786	256791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_020533	ATTT	2	8	256792	256799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020533	A	6	6	256809	256814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020533	TTG	2	6	256817	256822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020533	A	6	6	256832	256837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020533	ATA	2	6	256847	256852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020533	AAT	2	6	256869	256874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020533	TAAAA	2	10	256944	256953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020533	AAAT	2	8	256958	256965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020533	AAAT	2	8	257016	257023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020533	AGC	2	6	257111	257116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_020533	A	6	6	258180	258185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020533	GTT	2	6	258253	258258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020533	AAATT	2	10	258260	258269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020533	GAT	2	6	258305	258310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020533	ATG	2	6	258348	258353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020533	CTT	2	6	258401	258406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_020533	ATT	2	6	259997	260002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020533	AT	4	8	260034	260041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020533	TTG	2	6	260112	260117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020533	AGGT	2	8	260172	260179	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020533	CAC	2	6	260284	260289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_020533	ATAA	2	8	260290	260297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020533	AAC	2	6	260317	260322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_020533	TTAA	2	8	261286	261293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_020533	AT	3	6	261429	261434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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