MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020533	TAAT	2	8	78364	78371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020533	A	6	6	78424	78429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020533	TAAT	2	8	78436	78443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020533	AGAA	2	8	78455	78462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020533	AAT	2	6	79465	79470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020533	ATT	2	6	79506	79511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020533	ACT	2	6	79515	79520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020533	TAA	2	6	79542	79547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020533	CAA	2	6	79550	79555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_020533	TAT	2	6	79556	79561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020533	TTGT	2	8	79574	79581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020533	ATA	2	6	79592	79597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020533	AT	3	6	79628	79633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020533	AACAAA	2	12	79640	79651	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
515	NC_020533	AGA	2	6	79663	79668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020533	TAA	2	6	82114	82119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020533	AGA	2	6	82155	82160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020533	AATC	2	8	82964	82971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_020533	ATA	3	9	82980	82988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020533	ATG	2	6	83572	83577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020533	TTG	2	6	83640	83645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020533	TCA	2	6	83670	83675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020533	A	6	6	83712	83717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020533	T	7	7	83729	83735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020533	ATAA	2	8	83767	83774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020533	AAT	2	6	83825	83830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020533	T	6	6	86150	86155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020533	A	6	6	86176	86181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020533	TGT	2	6	86199	86204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020533	ATAA	2	8	86212	86219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020533	ATG	2	6	86233	86238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020533	AATATA	2	12	88940	88951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020533	TTAT	2	8	88997	89004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020533	GTT	2	6	89008	89013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020533	TA	3	6	89031	89036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020533	TA	4	8	89045	89052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020533	ATT	2	6	89168	89173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020533	ATA	2	6	89200	89205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020533	A	6	6	89219	89224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020533	A	6	6	89279	89284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020533	ATAA	2	8	89292	89299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020533	ATT	2	6	91052	91057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020533	AT	3	6	91063	91068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020533	TTA	2	6	91102	91107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020533	ATG	2	6	91158	91163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020533	CAAT	2	8	91164	91171	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_020533	TCA	2	6	91186	91191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_020533	A	7	7	91191	91197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020533	CCA	2	6	93075	93080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_020533	A	6	6	94156	94161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020533	AGGG	2	8	94218	94225	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020533	AGA	2	6	94226	94231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020533	AAT	2	6	94272	94277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020533	AAT	2	6	95636	95641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020533	GTAAT	2	10	95752	95761	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020533	ATG	2	6	96306	96311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020533	ATT	2	6	96335	96340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020533	ATAA	2	8	96341	96348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020533	AT	3	6	96373	96378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020533	TATT	2	8	96379	96386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020533	ATC	2	6	96474	96479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_020533	TA	3	6	96531	96536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020533	AG	3	6	96538	96543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020533	TGT	2	6	98156	98161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020533	ATT	2	6	98192	98197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020533	T	6	6	98246	98251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020533	GTT	2	6	98309	98314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020533	AGTA	2	8	98321	98328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020533	A	6	6	98333	98338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020533	CAA	2	6	98348	98353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_020533	GAT	2	6	98375	98380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020533	TA	3	6	98416	98421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020533	TTGT	2	8	98464	98471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020533	TTAAAT	2	12	99932	99943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020533	AAAT	2	8	99963	99970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020533	TAA	2	6	100035	100040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020533	T	6	6	100063	100068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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582	NC_020533	AAT	2	6	101080	101085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020533	ATA	2	6	101105	101110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020533	TTA	2	6	101119	101124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_020533	ATTG	2	8	101209	101216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020533	TA	3	6	101247	101252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020533	TAACAA	2	12	101289	101300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
589	NC_020533	A	7	7	101314	101320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020533	GTTA	2	8	101331	101338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020533	TAA	2	6	101381	101386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020533	AGATG	2	10	102348	102357	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020533	T	6	6	102367	102372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020533	CCT	2	6	104402	104407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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596	NC_020533	ATT	2	6	104505	104510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020533	A	6	6	104527	104532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_020533	TCAG	2	8	108422	108429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_020533	ATT	2	6	108465	108470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020533	ACA	2	6	109642	109647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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606	NC_020533	ATC	2	6	109725	109730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_020533	ATG	2	6	115863	115868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020533	ATA	2	6	115893	115898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020533	TAAA	2	8	115976	115983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020533	TAAA	2	8	116014	116021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020533	GA	3	6	116674	116679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020533	A	7	7	116683	116689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020533	TGT	2	6	116805	116810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020533	GAAA	2	8	116847	116854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020533	GAG	2	6	116858	116863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020533	ATAA	2	8	117665	117672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020533	T	6	6	117710	117715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020533	TAA	2	6	117750	117755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020533	ATG	2	6	117776	117781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_020533	ATTTT	2	10	117900	117909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020533	TAAA	2	8	117912	117919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020533	A	6	6	117917	117922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020533	AT	3	6	117960	117965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020533	ATA	3	9	118985	118993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020533	GAA	2	6	119029	119034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020533	TAA	2	6	119632	119637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020533	CAT	2	6	119736	119741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_020533	TGA	2	6	119772	119777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_020533	AAG	2	6	123670	123675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020533	T	6	6	123711	123716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020533	TA	3	6	123806	123811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020533	AAAT	2	8	123824	123831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020533	AAT	3	9	123829	123837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020533	AC	3	6	123847	123852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_020533	ATTA	2	8	123858	123865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020533	AGG	2	6	123887	123892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020533	T	6	6	124547	124552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020533	ATA	2	6	124613	124618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020533	TTA	2	6	124643	124648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020533	TTG	2	6	124649	124654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_020533	ATG	2	6	124661	124666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_020533	TA	3	6	124677	124682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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