MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_020533	ATC	2	6	1415822	1415827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_020533	T	6	6	1415879	1415884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_020533	TAT	2	6	1415956	1415961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_020533	AAAT	2	8	1415967	1415974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_020533	TGC	2	6	1415980	1415985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_020533	AGA	2	6	1416031	1416036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_020533	AGC	2	6	1416039	1416044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_020533	TATACA	2	12	1416047	1416058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8009	NC_020533	TAT	2	6	1416153	1416158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_020533	TAT	2	6	1416267	1416272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_020533	GA	3	6	1416289	1416294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_020533	ACAAA	2	10	1416295	1416304	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8013	NC_020533	ATTA	2	8	1416340	1416347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_020533	AATA	2	8	1416353	1416360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_020533	TGATG	2	10	1416375	1416384	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_020533	CTC	2	6	1416395	1416400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_020533	TCT	2	6	1418473	1418478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_020533	TTG	2	6	1448312	1448317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_020533	TGT	2	6	1448327	1448332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_020533	CATTC	2	10	1448377	1448386	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8021	NC_020533	ATTT	2	8	1448477	1448484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_020533	ATA	2	6	1448497	1448502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_020533	AT	3	6	1448510	1448515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_020533	TAA	2	6	1448546	1448551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_020533	TAAA	2	8	1448555	1448562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_020533	TAA	2	6	1448577	1448582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_020533	A	6	6	1448581	1448586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_020533	AAT	2	6	1448608	1448613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_020533	ATT	2	6	1452715	1452720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_020533	ATT	2	6	1453879	1453884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_020533	ATTA	3	12	1453915	1453926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_020533	TAA	2	6	1453950	1453955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_020533	AT	3	6	1453963	1453968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_020533	TATTCT	2	12	1453969	1453980	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8035	NC_020533	TATT	2	8	1454008	1454015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_020533	TAAT	2	8	1454066	1454073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_020533	T	6	6	1454082	1454087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_020533	TAA	2	6	1454092	1454097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_020533	ATTT	2	8	1454131	1454138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_020533	TATC	2	8	1454183	1454190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8041	NC_020533	TTAT	2	8	1454201	1454208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_020533	CTT	2	6	1455207	1455212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_020533	GTTC	2	8	1458672	1458679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_020533	TGCT	2	8	1458689	1458696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8045	NC_020533	TAT	2	6	1458762	1458767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_020533	GCT	2	6	1458785	1458790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_020533	AAT	2	6	1458805	1458810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_020533	TTC	2	6	1458816	1458821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_020533	ATC	2	6	1458863	1458868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_020533	AAAT	2	8	1458885	1458892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_020533	CA	3	6	1458909	1458914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_020533	GGGA	2	8	1458948	1458955	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_020533	TC	3	6	1460345	1460350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_020533	TAA	2	6	1460373	1460378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_020533	T	6	6	1460418	1460423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_020533	A	6	6	1460436	1460441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_020533	AAG	2	6	1460457	1460462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_020533	CTT	2	6	1460472	1460477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_020533	T	6	6	1460498	1460503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_020533	TCA	2	6	1460531	1460536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_020533	TCA	2	6	1460554	1460559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_020533	CAT	2	6	1460594	1460599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_020533	T	6	6	1460628	1460633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_020533	T	6	6	1460747	1460752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_020533	A	6	6	1460759	1460764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_020533	AAC	2	6	1460793	1460798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_020533	T	7	7	1460825	1460831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_020533	CTC	2	6	1460845	1460850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_020533	TAT	2	6	1460868	1460873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_020533	ATT	2	6	1460886	1460891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_020533	T	6	6	1462110	1462115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_020533	CAA	2	6	1462125	1462130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_020533	A	6	6	1462230	1462235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8079	NC_020533	TCA	2	6	1462573	1462578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_020533	ATC	2	6	1462594	1462599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_020533	TG	3	6	1462606	1462611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_020533	TA	3	6	1462628	1462633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_020533	ATT	2	6	1462680	1462685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_020533	ATT	2	6	1462716	1462721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_020533	ATT	2	6	1462771	1462776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_020533	GAA	2	6	1462805	1462810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_020533	T	6	6	1463061	1463066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_020533	AT	3	6	1463666	1463671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8101	NC_020533	TTG	3	9	1463901	1463909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_020533	TGT	2	6	1463939	1463944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_020533	CAT	2	6	1463972	1463977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8106	NC_020533	TA	3	6	1464045	1464050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_020533	T	6	6	1464065	1464070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_020533	TA	3	6	1464113	1464118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_020533	TGT	2	6	1464140	1464145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8115	NC_020533	AATT	2	8	1464323	1464330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_020533	TG	3	6	1464336	1464341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8119	NC_020533	TCT	2	6	1465152	1465157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8123	NC_020533	T	7	7	1467370	1467376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8127	NC_020533	TAG	2	6	1467452	1467457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8131	NC_020533	GACAC	2	10	1467800	1467809	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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8401	NC_020533	AAAG	2	8	1527410	1527417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8402	NC_020533	TCA	2	6	1527456	1527461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8404	NC_020533	TTA	2	6	1527487	1527492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8405	NC_020533	AAT	2	6	1528740	1528745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8481	NC_020533	T	6	6	1542357	1542362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8487	NC_020533	ATC	3	9	1543903	1543911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8488	NC_020533	TTGTT	2	10	1543918	1543927	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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8500	NC_020533	TTCAA	2	10	1546562	1546571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

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