MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 337

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020532	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020532	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020532	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020532	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020532	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020532	AAAAAT	2	12	37312	37323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020532	AATGAA	2	12	38548	38559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020532	GCTAAA	2	12	41852	41863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020532	ATTTGG	2	12	45097	45108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020532	ATTTAT	2	12	66057	66068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020532	AACAAA	2	12	79637	79648	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020532	AATATA	2	12	88938	88949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020532	TTAAAT	2	12	99930	99941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020532	TAACAA	2	12	101287	101298	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020532	AATGTA	2	12	124826	124837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020532	CTGTAA	2	12	126647	126658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020532	GTTTTT	2	12	137853	137864	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020532	TGTAAT	2	12	160184	160195	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020532	TCCCAC	2	12	164396	164407	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020532	TTTATA	2	12	186250	186261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020532	ATTAAT	2	12	186273	186284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020532	TTTTTA	2	12	207101	207112	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020532	GATTTT	2	12	217254	217265	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020532	ATATGA	2	12	237969	237980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020532	GGAATA	2	12	252830	252841	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020532	TGGTAT	2	12	264410	264421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020532	ATATAG	2	12	274057	274068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020532	ATTTTC	2	12	279374	279385	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020532	ATAATT	2	12	280323	280334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020532	AACGAT	2	12	287693	287704	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020532	TAACTT	2	12	296068	296079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020532	TAATTA	2	12	306791	306802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020532	ATATGA	2	12	345322	345333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020532	TTCATT	2	12	349777	349788	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020532	TGCAAT	2	12	352909	352920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020532	TTGTAA	2	12	355080	355091	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020532	AAGTAC	2	12	369371	369382	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020532	GAAGAC	2	12	387461	387472	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020532	AATGTA	2	12	393081	393092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020532	AATTTG	2	12	393188	393199	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020532	TAAAGA	2	12	395176	395187	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020532	ATGAAA	2	12	417375	417386	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020532	TGAAAT	2	12	418097	418108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020532	TTTAAT	2	12	423101	423112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020532	TGTATA	2	12	432333	432344	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020532	TTTTTA	2	12	446971	446982	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020532	TTAACA	2	12	462805	462816	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020532	ACGTTG	2	12	472768	472779	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020532	AAAATA	2	12	473490	473501	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020532	CAAGAA	2	12	480548	480559	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020532	AAAATG	2	12	490281	490292	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020532	CAAGAT	2	12	490308	490319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020532	AGTTGA	2	12	490547	490558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020532	TTATAA	2	12	492942	492953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020532	AAATTT	2	12	499701	499712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020532	TGAAAG	2	12	523082	523093	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020532	CATTTA	2	12	552412	552423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020532	CAGTAG	2	12	554465	554476	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020532	TTATAA	2	12	554827	554838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020532	GTTATA	2	12	555498	555509	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020532	TTGTAC	2	12	563769	563780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020532	CTTAAA	2	12	563930	563941	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020532	ACATGT	2	12	573902	573913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020532	GACTCA	2	12	592113	592124	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020532	GATTCA	2	12	592131	592142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020532	GACTCA	2	12	592203	592214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020532	GACTCA	2	12	592221	592232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020532	ATTGCG	2	12	604694	604705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020532	AATGAT	2	12	608612	608623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020532	TAGATG	2	12	608685	608696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020532	CATGAC	2	12	610635	610646	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020532	TAAAAT	2	12	624005	624016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020532	TTATTT	2	12	630123	630134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020532	GAAAAA	2	12	634448	634459	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020532	CATTAT	2	12	646201	646212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020532	TACTTG	2	12	650602	650613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020532	CATCAA	2	12	658252	658263	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020532	TAATTT	2	12	662492	662503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020532	ATAAAA	2	12	663399	663410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020532	TGAATA	2	12	678968	678979	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020532	ATTTAT	2	12	698317	698328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020532	AATTGA	2	12	698396	698407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020532	TTAAAA	2	12	704977	704988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020532	GAAAAA	2	12	705167	705178	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020532	AAAGAT	2	12	705281	705292	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020532	TAGTTA	2	12	709412	709423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020532	TTTTTA	2	12	727619	727630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020532	ATATCA	2	12	734370	734381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020532	GAATTA	2	12	735664	735675	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020532	TGAAAA	2	12	735862	735873	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020532	TTAATT	2	12	790020	790031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020532	ACAAAA	2	12	804778	804789	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020532	AAACAA	2	12	817285	817296	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020532	TTTATT	2	12	822452	822463	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020532	TAAAAA	2	12	824144	824155	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020532	TATCAA	2	12	832122	832133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020532	TTTTGA	2	12	835942	835953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020532	CTGTTT	2	12	836720	836731	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020532	TCATTT	2	12	841934	841945	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020532	TAAAAA	2	12	845022	845033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020532	AGAAAA	2	12	849060	849071	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020532	AGTGAA	2	12	853500	853511	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020532	ATAAAG	2	12	853883	853894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020532	AAATTA	2	12	858657	858668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020532	AAGCAC	2	12	867390	867401	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020532	TAAAAT	2	12	876758	876769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020532	TGTAAT	2	12	881519	881530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020532	TTACAT	2	12	919512	919523	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020532	ATTTAG	2	12	932800	932811	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020532	ATTCAA	2	12	932965	932976	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020532	TTTAAT	2	12	949285	949296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020532	TTGTTT	2	12	955374	955385	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020532	AAATTA	2	12	956419	956430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020532	ACAATA	2	12	966686	966697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020532	AACGGA	2	12	981209	981220	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020532	AAAAGC	2	12	985807	985818	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020532	CACTTG	2	12	995191	995202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020532	CTAAAT	2	12	1000204	1000215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020532	CATTTA	2	12	1009357	1009368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020532	ATCATA	2	12	1011252	1011263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_020532	TCAAAA	2	12	1017760	1017771	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020532	ATTGCA	2	12	1018889	1018900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_020532	TTTTCT	2	12	1031619	1031630	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_020532	TAGTAT	2	12	1060619	1060630	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020532	TTTATA	2	12	1067769	1067780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020532	ATTTTA	2	12	1074665	1074676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020532	TGGATA	2	12	1079610	1079621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020532	ATTTTT	2	12	1091719	1091730	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020532	ATAATT	2	12	1092516	1092527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020532	TCATTA	2	12	1097729	1097740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_020532	TAATGA	2	12	1105815	1105826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020532	GATTGC	2	12	1117014	1117025	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_020532	ATTTAT	2	12	1126382	1126393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020532	AAATTT	2	12	1131101	1131112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020532	GATTTT	2	12	1135190	1135201	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020532	AAGTAA	2	12	1152806	1152817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020532	TCGTTT	2	12	1155933	1155944	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_020532	TTAATT	2	12	1166649	1166660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020532	AATTAA	2	12	1169385	1169396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_020532	TATATT	2	12	1262202	1262213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_020532	AAAATA	2	12	1341762	1341773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_020532	TTGATA	2	12	1387833	1387844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020532	TTGATT	2	12	1395803	1395814	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_020532	TTTTAA	2	12	2116348	2116359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_020532	TTCTAT	2	12	2141849	2141860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_020532	TTTTCT	2	12	2152282	2152293	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_020532	AATTAA	2	12	2152472	2152483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_020532	GAATGT	2	12	2157964	2157975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_020532	TTTAAT	2	12	2160279	2160290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_020532	CAAATA	2	12	2162499	2162510	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_020532	TAAATG	2	12	2166553	2166564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_020532	AATTAA	2	12	2175930	2175941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_020532	ATCATT	2	12	2203688	2203699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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266	NC_020532	TTTATT	2	12	2221718	2221729	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_020532	AAATTT	2	12	2223575	2223586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_020532	AATATT	2	12	2227399	2227410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_020532	TTTATA	2	12	2236401	2236412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_020532	ACATTC	2	12	2237658	2237669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_020532	AATTTA	2	12	2252365	2252376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_020532	TCTGAT	2	12	2258912	2258923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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282	NC_020532	CTTTAA	2	12	2298266	2298277	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
283	NC_020532	TTAAAA	2	12	2306732	2306743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020532	TCATTA	2	12	2307226	2307237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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286	NC_020532	ATCATT	2	12	2318141	2318152	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
287	NC_020532	TTTACG	2	12	2331950	2331961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
288	NC_020532	AATATA	2	12	2345946	2345957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_020532	ATTTTT	2	12	2360312	2360323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_020532	TATATT	2	12	2372207	2372218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_020532	GAAAAA	2	12	2390522	2390533	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
295	NC_020532	TTCAGA	2	12	2390714	2390725	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.